295 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SYO3AOP1_0283 on replicon NC_010730
Organism: Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010730  SYO3AOP1_0283  50S ribosomal protein L29  100 
 
 		 67 aa  126  1.0000000000000001e-28  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000500169  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3016  50S ribosomal protein L29  61.54 
 
 		 68 aa  78.2  0.00000000000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.011652  hitchhiker  0.00780318 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1176  ribosomal protein L29  57.38 
 
 		 71 aa  73.6  0.0000000000008  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00096654  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0202  LSU ribosomal protein L29P  58.73 
 
 		 65 aa  73.2  0.000000000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.112179  normal  0.131015 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1563  ribosomal protein L29  55.74 
 
 		 66 aa  72.4  0.000000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2703  ribosomal protein L29  60.32 
 
 		 65 aa  71.6  0.000000000004  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.859678  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0961  50S ribosomal protein L29  61.29 
 
 		 66 aa  71.6  0.000000000004  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.00226195  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0115  50S ribosomal protein L29  58.06 
 
 		 66 aa  70.9  0.000000000006  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0119  50S ribosomal protein L29  56.45 
 
 		 68 aa  70.1  0.00000000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.217136  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4018  50S ribosomal protein L29  53.97 
 
 		 66 aa  68.6  0.00000000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.186553  hitchhiker  0.00000457744 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0590  50S ribosomal protein L29  53.97 
 
 		 88 aa  68.6  0.00000000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_09920  LSU ribosomal protein L29P  53.97 
 
 		 64 aa  68.2  0.00000000004  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.0238741  hitchhiker  0.0000015632 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0723  ribosomal protein L29  58.33 
 
 		 63 aa  67.8  0.00000000005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2249  50S ribosomal protein L29  55 
 
 		 62 aa  67.8  0.00000000005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.0000185964  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0875  50S ribosomal protein L29  57.14 
 
 		 69 aa  67  0.00000000007  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00116598  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0782  ribosomal protein L29  54.84 
 
 		 66 aa  67  0.00000000008  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2170  ribosomal protein L29  52.38 
 
 		 64 aa  67  0.00000000008  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.37818  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3427  ribosomal protein L29  52.31 
 
 		 76 aa  66.6  0.00000000009  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.93339  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1177  50S ribosomal protein L29  52.38 
 
 		 71 aa  66.6  0.0000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.267445  normal  0.166856 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01250  ribosomal protein L29  50.79 
 
 		 71 aa  66.2  0.0000000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.774041  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_20790  LSU ribosomal protein L29P  48.33 
 
 		 78 aa  65.1  0.0000000003  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.888777  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0634  50S ribosomal protein L29  58.33 
 
 		 62 aa  65.5  0.0000000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000169135  hitchhiker  0.00000000334263 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0087  50S ribosomal protein L29  51.67 
 
 		 61 aa  65.1  0.0000000003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0344032 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1386  50S ribosomal protein L29  58.73 
 
 		 66 aa  65.1  0.0000000003  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  unclonable  0.000000247048  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1300  50S ribosomal protein L29  58.73 
 
 		 66 aa  65.1  0.0000000003  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  unclonable  0.000000000050767  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2849  50S ribosomal protein L29  60 
 
 		 64 aa  64.7  0.0000000004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.851445  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1757  50S ribosomal protein L29  50.82 
 
 		 61 aa  64.7  0.0000000004  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.171638  normal  0.386752 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1048  50S ribosomal protein L29  46.27 
 
 		 77 aa  64.3  0.0000000005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1021  50S ribosomal protein L29  46.27 
 
 		 77 aa  64.3  0.0000000005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.086261  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1038  50S ribosomal protein L29  46.27 
 
 		 77 aa  64.3  0.0000000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0463053  normal  0.422839 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0204  50S ribosomal protein L29  50.77 
 
 		 68 aa  63.9  0.0000000007  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_23390  LSU ribosomal protein L29P  49.25 
 
 		 69 aa  63.9  0.0000000008  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  unclonable  0.00000127538  hitchhiker  0.000000855419 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10723  50S ribosomal protein L29  46.27 
 
 		 77 aa  63.5  0.0000000008  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.698267  normal  0.159756 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4499  ribosomal protein L29  50.79 
 
 		 77 aa  63.9  0.0000000008  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0989  ribosomal protein L29  51.56 
 
 		 67 aa  63.2  0.000000001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1193  50S ribosomal protein L29  46.03 
 
 		 79 aa  63.2  0.000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0737458 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2911  50S ribosomal protein L29  51.61 
 
 		 67 aa  62  0.000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5041  50S ribosomal protein L29  46.88 
 
 		 77 aa  62.4  0.000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0723534  normal  0.108147 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0994  50S ribosomal protein L29  48.33 
 
 		 66 aa  62.4  0.000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0283422 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2452  50S ribosomal protein L29  47.76 
 
 		 67 aa  62.4  0.000000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.206737 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0939  50S ribosomal protein L29  52.46 
 
 		 74 aa  62.8  0.000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.122968  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0299  50S ribosomal protein L29  50 
 
 		 69 aa  62.8  0.000000002  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  unclonable  6.39149e-29 
 
 
-
 
NC_009972  Maur_5050  50S ribosomal protein L29  50 
 
 		 67 aa  62  0.000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0326432  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4313  ribosomal protein L29  47.62 
 
 		 84 aa  62  0.000000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.883928  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0716  ribosomal protein L29  49.12 
 
 		 62 aa  62  0.000000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.762697  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1313  50S ribosomal protein L29  46.88 
 
 		 77 aa  61.6  0.000000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.668661  normal  0.21811 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1516  ribosomal protein L29  53.23 
 
 		 69 aa  61.2  0.000000005  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.380444  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1475  50S ribosomal protein L29  50 
 
 		 68 aa  61.2  0.000000005  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.0000000000000032863  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2147  50S ribosomal protein L29P  45.61 
 
 		 67 aa  61.2  0.000000005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.018623  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_23730  LSU ribosomal protein L29P  47.62 
 
 		 77 aa  60.8  0.000000006  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0241795  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1438  50S ribosomal protein L29  45 
 
 		 66 aa  60.8  0.000000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.397663  normal  0.137292 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_04060  LSU ribosomal protein L29P  49.21 
 
 		 83 aa  60.8  0.000000006  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0233  50S ribosomal protein L29  44.44 
 
 		 67 aa  60.5  0.000000007  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1340  50S ribosomal protein L29  45 
 
 		 66 aa  60.5  0.000000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.282614  normal  0.101292 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2638  50S ribosomal protein L29P  49.21 
 
 		 85 aa  60.5  0.000000007  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.137123  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2744  ribosomal protein L29  45 
 
 		 68 aa  60.5  0.000000007  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0416079  normal  0.108023 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0570  50S ribosomal protein L29  47.54 
 
 		 78 aa  60.5  0.000000008  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2967  50S ribosomal protein L29P  46.03 
 
 		 109 aa  60.1  0.000000009  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.115661  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1848  50S ribosomal protein L29  45 
 
 		 66 aa  59.7  0.00000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.15271  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3659  50S ribosomal protein L29  41.54 
 
 		 69 aa  60.1  0.00000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0293  50S ribosomal protein L29  45 
 
 		 68 aa  60.1  0.00000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1566  ribosomal protein L29  44.44 
 
 		 68 aa  59.7  0.00000001  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.00135889  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2679  ribosomal protein L29  46.03 
 
 		 109 aa  60.1  0.00000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1687  50S ribosomal protein L29  50 
 
 		 70 aa  59.7  0.00000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  hitchhiker  0.000000411175  hitchhiker  0.00000000390358 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1823  50S ribosomal protein L29  44.78 
 
 		 69 aa  58.9  0.00000002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.340193  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1131  ribosomal protein L29  46.88 
 
 		 80 aa  59.3  0.00000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3750  ribosomal protein L29  41.79 
 
 		 77 aa  59.3  0.00000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.775863  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3176  50S ribosomal protein L29  40 
 
 		 69 aa  58.9  0.00000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.909718 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2310  50S ribosomal protein L29  44.78 
 
 		 69 aa  58.9  0.00000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000372663  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6041  50S ribosomal protein L29  46.67 
 
 		 83 aa  59.3  0.00000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.127214 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2057  ribosomal protein L29  43.55 
 
 		 67 aa  59.3  0.00000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00051227  normal  0.0499513 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2269  50S ribosomal protein L29  44.78 
 
 		 69 aa  58.9  0.00000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.000389369  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0767  ribosomal protein L29  47.37 
 
 		 92 aa  59.3  0.00000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.211892  normal  0.786467 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2131  ribosomal protein L29  41.67 
 
 		 71 aa  58.2  0.00000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.579075  normal  0.483712 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2526  50S ribosomal protein L29  44.07 
 
 		 67 aa  58.5  0.00000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0599  50S ribosomal protein L29  47.37 
 
 		 69 aa  58.5  0.00000003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5132  ribosomal protein L29  49.21 
 
 		 83 aa  58.5  0.00000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.76527 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2448  ribosomal protein L29  41.67 
 
 		 71 aa  58.2  0.00000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.338512  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1670  50S ribosomal protein L29  42.19 
 
 		 66 aa  58.5  0.00000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0221065  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2325  50S ribosomal protein L29  48.39 
 
 		 70 aa  58.5  0.00000003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.0000880792  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2170  ribosomal protein L29  41.67 
 
 		 71 aa  58.2  0.00000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.350085 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2303  50S ribosomal protein L29  40 
 
 		 69 aa  58.2  0.00000004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0116105  normal  0.098127 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1737  50S ribosomal protein L29  48.39 
 
 		 72 aa  58.2  0.00000004  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.0000000000140424  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_29660  LSU ribosomal protein L29P  46.03 
 
 		 79 aa  57.8  0.00000005  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.942606  normal  0.510247 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1348  ribosomal protein L29  37.5 
 
 		 72 aa  57.4  0.00000006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3897  50S ribosomal protein L29P  47.54 
 
 		 80 aa  57.4  0.00000006  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1938  50S ribosomal protein L29  46.55 
 
 		 73 aa  57.4  0.00000007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1941  50S ribosomal protein L29  46.55 
 
 		 73 aa  57.4  0.00000007  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2026  50S ribosomal protein L29  46.55 
 
 		 73 aa  57.4  0.00000007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.63096  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1787  50S ribosomal protein L29P  40.3 
 
 		 68 aa  57.4  0.00000007  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.063594  normal  0.106706 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3330  50S ribosomal protein L29  46.67 
 
 		 64 aa  57.4  0.00000007  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  hitchhiker  0.00000258995  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0696  ribosomal protein L29  41.54 
 
 		 83 aa  57  0.00000008  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.66436 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0674  50S ribosomal protein L29  45 
 
 		 66 aa  57  0.00000008  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  hitchhiker  0.000000000868112  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0706  50S ribosomal protein L29  45 
 
 		 66 aa  57  0.00000008  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  hitchhiker  0.00000555374  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0314  50S ribosomal protein L29P  46.77 
 
 		 77 aa  57  0.00000008  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00171364 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1916  ribosomal protein L29  40.62 
 
 		 71 aa  57  0.00000008  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.174298  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0941  50S ribosomal protein L29  48.33 
 
 		 62 aa  57  0.00000009  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00256084  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0369  50S ribosomal protein L29  43.86 
 
 		 68 aa  57  0.00000009  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3320  50S ribosomal protein L29  48.33 
 
 		 62 aa  57  0.00000009  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000288023 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1724  50S ribosomal protein L29  43.86 
 
 		 68 aa  57  0.00000009  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>