50 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SNSL254_A4370 on replicon NC_011080
Organism: Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011080  SNSL254_A4370  phage Tail Protein X  100 
 
 		 67 aa  136  1e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.621111  hitchhiker  0.00000000857758 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3176  tail X family protein  74.63 
 
 		 67 aa  108  3e-23  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.753012  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4328  phage tail protein GpX  74.63 
 
 		 67 aa  106  1e-22  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00292132 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3496  phage tail X family protein  71.64 
 
 		 67 aa  104  3e-22  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.147017 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3047  phage tail protein GpX  73.13 
 
 		 67 aa  104  4e-22  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000083115 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2332  tail X family protein  61.19 
 
 		 67 aa  90.5  6e-18  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0325995  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2088  tail X family protein  56.72 
 
 		 67 aa  90.9  6e-18  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0545873  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_37560  Phage P2 tail gpX-like protein  69.7 
 
 		 69 aa  90.1  8e-18  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.881867  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1829  tail X family protein  53.73 
 
 		 67 aa  89.7  1e-17  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.00586529  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2863  phage Tail Protein X  61.19 
 
 		 67 aa  89.7  1e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0929  phage tail protein X  61.19 
 
 		 67 aa  82  0.000000000000002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2772  tail X family protein  61.19 
 
 		 67 aa  82  0.000000000000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.592112  decreased coverage  0.0000146404 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3045  phage Tail Protein X  61.19 
 
 		 67 aa  82  0.000000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000746353 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1934  bacteriophage protein  55.88 
 
 		 68 aa  79.3  0.00000000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.5631  normal  0.801255 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2646  tail X family protein  56.72 
 
 		 67 aa  79  0.00000000000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  decreased coverage  0.00667297  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1346  Phage tail protein X  69.64 
 
 		 68 aa  78.6  0.00000000000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0873  tail X family protein  53.73 
 
 		 67 aa  77.4  0.00000000000006  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.0899137 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01358  phage Tail Protein X  60.32 
 
 		 64 aa  72.4  0.000000000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  decreased coverage  0.00715171  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0202  tail X family protein  55.71 
 
 		 70 aa  63.9  0.0000000007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.10462 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0752  hypothetical protein  44.44 
 
 		 70 aa  63.5  0.0000000008  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.286797  normal  0.157353 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4841  tail X family protein  55.71 
 
 		 70 aa  63.2  0.000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.223234  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1624  P2-like protein prophage tail protein X-like protein  58.82 
 
 		 73 aa  62.8  0.000000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1855  phage tail X family protein  52.54 
 
 		 68 aa  62.4  0.000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.520238  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3294  phage tail X family protein  48.53 
 
 		 68 aa  61.2  0.000000004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.884324  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3828  tail X family protein  51.61 
 
 		 73 aa  60.5  0.000000008  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1279  phage tail X  43.75 
 
 		 72 aa  59.3  0.00000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.439324 
 
 
-
 
NC_002978  WD0568  prophage P2W3, tail protein X, putative  39.06 
 
 		 69 aa  59.3  0.00000002  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.37075  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_32140  Phage tail X protein  52.54 
 
 		 64 aa  59.3  0.00000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3320  phage tail X  48.39 
 
 		 70 aa  59.3  0.00000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2608  tail X family protein  49.25 
 
 		 67 aa  58.9  0.00000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  hitchhiker  0.00274185  unclonable  2.34283e-16 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2642  tail X family protein  49.25 
 
 		 67 aa  58.9  0.00000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.125505  hitchhiker  0.00331618 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2911  tail X family protein  48.39 
 
 		 69 aa  58.5  0.00000003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.125785  normal  0.4425 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2290  phage tail X family protein  50 
 
 		 70 aa  58.5  0.00000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.525878  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2372  phage tail X  46.77 
 
 		 70 aa  57.4  0.00000006  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4035  tail X family protein  47.54 
 
 		 68 aa  54.7  0.0000004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.743163  unclonable  0.0000000000000167658 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0882  tail X family protein  46.15 
 
 		 71 aa  53.5  0.0000009  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.126083  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1131  phage-related tail protein  40.91 
 
 		 72 aa  51.2  0.000005  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0392  phage-related tail protein  40.91 
 
 		 72 aa  51.2  0.000005  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1153  tail X family protein  39.71 
 
 		 72 aa  50.4  0.000008  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1394  putative bacteriophage protein  65 
 
 		 40 aa  50.1  0.00001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.604078  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3391  tail protein X  45.76 
 
 		 68 aa  49.3  0.00002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_08140  hypothetical protein  46.67 
 
 		 68 aa  48.1  0.00003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  3.77075e-17  hitchhiker  0.000171752 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2761  putative P2-like prophage tail protein X  44.12 
 
 		 77 aa  48.5  0.00003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.90872  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3064  pyocin R2_PP, tail component protein  45.76 
 
 		 68 aa  48.1  0.00004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.471622  normal  0.438372 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3358  Phage tail component protein X  45.76 
 
 		 70 aa  48.1  0.00004  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1217  tail X family protein  43.33 
 
 		 68 aa  47  0.00009  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000611286 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0697  tail X family protein  41.51 
 
 		 78 aa  45.8  0.0002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1150  Phage tail X  43.55 
 
 		 70 aa  45.8  0.0002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0210537  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0771  hypothetical protein  45 
 
 		 68 aa  44.7  0.0004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.63147  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2203  Phage tail protein X  42.62 
 
 		 70 aa  42.4  0.002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>