32 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dd703_3828 on replicon NC_012880
Organism: Dickeya dadantii Ech703



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012880  Dd703_3828  tail X family protein  100 
 
 
73 aa  152  2e-36  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2646  tail X family protein  59.02 
 
 
67 aa  67  0.00000000008  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  decreased coverage  0.00667297  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3176  tail X family protein  54.69 
 
 
67 aa  64.7  0.0000000004  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.753012  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2863  phage Tail Protein X  56.45 
 
 
67 aa  64.7  0.0000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2772  tail X family protein  58.18 
 
 
67 aa  60.5  0.000000007  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.592112  decreased coverage  0.0000146404 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3045  phage Tail Protein X  58.18 
 
 
67 aa  60.5  0.000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000746353 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0929  phage tail protein X  58.18 
 
 
67 aa  60.5  0.000000007  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4370  phage Tail Protein X  51.61 
 
 
67 aa  60.5  0.000000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.621111  hitchhiker  0.00000000857758 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3496  phage tail X family protein  46.77 
 
 
67 aa  58.9  0.00000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.147017 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3047  phage tail protein GpX  48.39 
 
 
67 aa  58.9  0.00000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000083115 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01358  phage Tail Protein X  49.12 
 
 
64 aa  57.8  0.00000006  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  decreased coverage  0.00715171  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1346  Phage tail protein X  48.39 
 
 
68 aa  57.8  0.00000006  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1829  tail X family protein  45.16 
 
 
67 aa  57.4  0.00000007  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.00586529  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_37560  Phage P2 tail gpX-like protein  58.82 
 
 
69 aa  57  0.00000008  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.881867  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4328  phage tail protein GpX  46.77 
 
 
67 aa  56.6  0.0000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00292132 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2332  tail X family protein  45.16 
 
 
67 aa  54.7  0.0000004  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0325995  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2088  tail X family protein  41.94 
 
 
67 aa  54.7  0.0000005  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0545873  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1934  bacteriophage protein  50.91 
 
 
68 aa  54.3  0.0000006  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.5631  normal  0.801255 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0873  tail X family protein  38.71 
 
 
67 aa  50.4  0.000008  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.0899137 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0752  hypothetical protein  42.31 
 
 
70 aa  49.7  0.00001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.286797  normal  0.157353 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0882  tail X family protein  43.1 
 
 
71 aa  49.3  0.00002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.126083  normal 
 
 
-
 
NC_002978  WD0568  prophage P2W3, tail protein X, putative  38.89 
 
 
69 aa  49.3  0.00002  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.37075  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1855  phage tail X family protein  44.9 
 
 
68 aa  46.6  0.0001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.520238  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2911  tail X family protein  48 
 
 
69 aa  46.6  0.0001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.125785  normal  0.4425 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3320  phage tail X  36.36 
 
 
70 aa  45.1  0.0003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2372  phage tail X  38.18 
 
 
70 aa  44.3  0.0006  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2290  phage tail X family protein  35.09 
 
 
70 aa  43.9  0.0007  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.525878  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3294  phage tail X family protein  48.94 
 
 
68 aa  43.9  0.0008  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.884324  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_32140  Phage tail X protein  42.86 
 
 
64 aa  43.1  0.001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3064  pyocin R2_PP, tail component protein  41.67 
 
 
68 aa  42  0.003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.471622  normal  0.438372 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1624  P2-like protein prophage tail protein X-like protein  45.1 
 
 
73 aa  40.8  0.006  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4841  tail X family protein  43.33 
 
 
70 aa  40.8  0.007  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.223234  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>