32 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PP_3064 on replicon NC_002947
Organism: Pseudomonas putida KT2440



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002947  PP_3064  pyocin R2_PP, tail component protein  100 
 
 		 68 aa  138  1.9999999999999998e-32  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.471622  normal  0.438372 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1217  tail X family protein  88.06 
 
 		 68 aa  123  7e-28  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000611286 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3391  tail protein X  67.65 
 
 		 68 aa  97.4  5e-20  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_08140  hypothetical protein  64.18 
 
 		 68 aa  91.3  4e-18  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  3.77075e-17  hitchhiker  0.000171752 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1855  phage tail X family protein  62.69 
 
 		 68 aa  87  8e-17  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.520238  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4035  tail X family protein  55.22 
 
 		 68 aa  84  6e-16  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.743163  unclonable  0.0000000000000167658 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_32140  Phage tail X protein  61.29 
 
 		 64 aa  82.4  0.000000000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0771  hypothetical protein  68.42 
 
 		 68 aa  82  0.000000000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.63147  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3320  phage tail X  46.38 
 
 		 70 aa  58.9  0.00000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2372  phage tail X  44.93 
 
 		 70 aa  54.7  0.0000004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0882  tail X family protein  46.03 
 
 		 71 aa  51.6  0.000003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.126083  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1346  Phage tail protein X  44.26 
 
 		 68 aa  48.9  0.00003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4370  phage Tail Protein X  45.76 
 
 		 67 aa  48.1  0.00004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.621111  hitchhiker  0.00000000857758 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3176  tail X family protein  44.83 
 
 		 67 aa  47.8  0.00005  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.753012  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2646  tail X family protein  38.1 
 
 		 67 aa  47.4  0.00008  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  decreased coverage  0.00667297  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3047  phage tail protein GpX  44.07 
 
 		 67 aa  46.6  0.0001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000083115 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1624  P2-like protein prophage tail protein X-like protein  40.68 
 
 		 73 aa  47  0.0001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4328  phage tail protein GpX  44.07 
 
 		 67 aa  46.2  0.0002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00292132 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3358  Phage tail component protein X  43.48 
 
 		 70 aa  46.2  0.0002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2290  phage tail X family protein  48.28 
 
 		 70 aa  44.7  0.0004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.525878  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3496  phage tail X family protein  42.37 
 
 		 67 aa  44.7  0.0004  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.147017 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2772  tail X family protein  42.31 
 
 		 67 aa  44.3  0.0006  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.592112  decreased coverage  0.0000146404 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0752  hypothetical protein  42.59 
 
 		 70 aa  44.3  0.0006  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.286797  normal  0.157353 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0929  phage tail protein X  42.31 
 
 		 67 aa  44.3  0.0006  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3045  phage Tail Protein X  42.31 
 
 		 67 aa  44.3  0.0006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000746353 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2863  phage Tail Protein X  38.1 
 
 		 67 aa  43.5  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0568  prophage P2W3, tail protein X, putative  38.6 
 
 		 69 aa  43.1  0.001  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.37075  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3294  phage tail X family protein  42 
 
 		 68 aa  43.5  0.001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.884324  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3828  tail X family protein  41.67 
 
 		 73 aa  42  0.003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0202  tail X family protein  41.79 
 
 		 70 aa  41.2  0.004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.10462 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4841  tail X family protein  42.42 
 
 		 70 aa  41.6  0.004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.223234  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_37560  Phage P2 tail gpX-like protein  53.85 
 
 		 69 aa  40.4  0.007  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.881867  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>