27 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RSP_2761 on replicon NC_007493
Organism: Rhodobacter sphaeroides 2.4.1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007493  RSP_2761  putative P2-like prophage tail protein X  100 
 
 
77 aa  150  5.9999999999999996e-36  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.90872  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1486  phage tail X family protein  48.1 
 
 
79 aa  70.1  0.00000000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_37560  Phage P2 tail gpX-like protein  44.78 
 
 
69 aa  58.5  0.00000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.881867  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1279  phage tail X  42.22 
 
 
72 aa  53.5  0.0000009  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.439324 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2088  tail X family protein  39.34 
 
 
67 aa  50.1  0.00001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0545873  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1346  Phage tail protein X  54.55 
 
 
68 aa  48.9  0.00002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4370  phage Tail Protein X  44.12 
 
 
67 aa  48.5  0.00003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.621111  hitchhiker  0.00000000857758 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0202  tail X family protein  40.98 
 
 
70 aa  48.5  0.00003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.10462 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1934  bacteriophage protein  40.3 
 
 
68 aa  48.1  0.00004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.5631  normal  0.801255 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4841  tail X family protein  40.98 
 
 
70 aa  47.4  0.00007  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.223234  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2863  phage Tail Protein X  47.73 
 
 
67 aa  47  0.00008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1153  tail X family protein  38.67 
 
 
72 aa  47  0.00008  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3176  tail X family protein  41.94 
 
 
67 aa  47  0.00009  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.753012  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1131  phage-related tail protein  40.26 
 
 
72 aa  47  0.00009  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0392  phage-related tail protein  40.26 
 
 
72 aa  47  0.00009  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2332  tail X family protein  50 
 
 
67 aa  45.8  0.0002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0325995  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3496  phage tail X family protein  42.86 
 
 
67 aa  45.8  0.0002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.147017 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1829  tail X family protein  36.07 
 
 
67 aa  45.4  0.0002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.00586529  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2772  tail X family protein  47.73 
 
 
67 aa  45.4  0.0003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.592112  decreased coverage  0.0000146404 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0929  phage tail protein X  47.73 
 
 
67 aa  45.4  0.0003  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3045  phage Tail Protein X  47.73 
 
 
67 aa  45.4  0.0003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000746353 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4328  phage tail protein GpX  40.28 
 
 
67 aa  44.3  0.0006  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00292132 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3047  phage tail protein GpX  38.89 
 
 
67 aa  43.9  0.0008  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000083115 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3294  phage tail X family protein  50 
 
 
68 aa  43.1  0.001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.884324  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2646  tail X family protein  39.34 
 
 
67 aa  43.1  0.001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  decreased coverage  0.00667297  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0568  prophage P2W3, tail protein X, putative  39.66 
 
 
69 aa  42  0.003  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.37075  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2507  phage tail X family protein  43.64 
 
 
69 aa  40.8  0.007  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>