48 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RSc1934 on replicon NC_003295
Organism: Ralstonia solanacearum GMI1000



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003295  RSc1934  bacteriophage protein  100 
 
 		 68 aa  137  3.9999999999999997e-32  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.5631  normal  0.801255 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2863  phage Tail Protein X  63.24 
 
 		 67 aa  90.1  9e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_37560  Phage P2 tail gpX-like protein  66.67 
 
 		 69 aa  89.4  1e-17  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.881867  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2332  tail X family protein  60.29 
 
 		 67 aa  86.3  1e-16  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0325995  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3047  phage tail protein GpX  58.82 
 
 		 67 aa  85.1  3e-16  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000083115 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4328  phage tail protein GpX  57.35 
 
 		 67 aa  84  7e-16  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00292132 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3176  tail X family protein  60.29 
 
 		 67 aa  80.9  0.000000000000005  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.753012  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3045  phage Tail Protein X  63.24 
 
 		 67 aa  80.9  0.000000000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000746353 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2772  tail X family protein  63.24 
 
 		 67 aa  80.9  0.000000000000005  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.592112  decreased coverage  0.0000146404 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0929  phage tail protein X  63.24 
 
 		 67 aa  80.9  0.000000000000005  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1829  tail X family protein  48.53 
 
 		 67 aa  80.1  0.000000000000009  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.00586529  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3496  phage tail X family protein  57.14 
 
 		 67 aa  80.1  0.00000000000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.147017 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4370  phage Tail Protein X  55.88 
 
 		 67 aa  79.3  0.00000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.621111  hitchhiker  0.00000000857758 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0202  tail X family protein  57.14 
 
 		 70 aa  76.6  0.00000000000009  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.10462 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2646  tail X family protein  52.94 
 
 		 67 aa  75.5  0.0000000000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  decreased coverage  0.00667297  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2088  tail X family protein  48.53 
 
 		 67 aa  75.5  0.0000000000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0545873  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0873  tail X family protein  52.94 
 
 		 67 aa  72.4  0.000000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.0899137 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4841  tail X family protein  52.86 
 
 		 70 aa  72  0.000000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.223234  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2911  tail X family protein  51.52 
 
 		 69 aa  70.1  0.000000000009  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.125785  normal  0.4425 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1346  Phage tail protein X  47.06 
 
 		 68 aa  68.6  0.00000000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3294  phage tail X family protein  45.59 
 
 		 68 aa  65.1  0.0000000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.884324  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2290  phage tail X family protein  49.21 
 
 		 70 aa  65.1  0.0000000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.525878  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01358  phage Tail Protein X  47.69 
 
 		 64 aa  60.1  0.00000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  decreased coverage  0.00715171  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1624  P2-like protein prophage tail protein X-like protein  51.92 
 
 		 73 aa  57.8  0.00000005  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3320  phage tail X  44.44 
 
 		 70 aa  57.4  0.00000006  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1855  phage tail X family protein  40 
 
 		 68 aa  57  0.00000008  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.520238  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0752  hypothetical protein  44.26 
 
 		 70 aa  56.6  0.0000001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.286797  normal  0.157353 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_32140  Phage tail X protein  43.08 
 
 		 64 aa  55.5  0.0000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2372  phage tail X  42.86 
 
 		 70 aa  55.5  0.0000003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1394  putative bacteriophage protein  62.5 
 
 		 40 aa  55.1  0.0000003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.604078  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3828  tail X family protein  50.91 
 
 		 73 aa  54.3  0.0000006  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1279  phage tail X  44.44 
 
 		 72 aa  51.6  0.000003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.439324 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0392  phage-related tail protein  38.1 
 
 		 72 aa  50.4  0.000008  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1131  phage-related tail protein  38.1 
 
 		 72 aa  50.4  0.000008  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0568  prophage P2W3, tail protein X, putative  37.1 
 
 		 69 aa  50.1  0.000009  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.37075  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1150  Phage tail X  35.29 
 
 		 70 aa  48.9  0.00002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0210537  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1153  tail X family protein  38.1 
 
 		 72 aa  49.3  0.00002  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0771  hypothetical protein  42.42 
 
 		 68 aa  48.1  0.00004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.63147  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2761  putative P2-like prophage tail protein X  40.3 
 
 		 77 aa  48.1  0.00004  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.90872  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3391  tail protein X  37.5 
 
 		 68 aa  48.1  0.00004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3358  Phage tail component protein X  40.62 
 
 		 70 aa  45.8  0.0002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_08140  hypothetical protein  39.39 
 
 		 68 aa  45.8  0.0002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  3.77075e-17  hitchhiker  0.000171752 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0882  tail X family protein  38.71 
 
 		 71 aa  46.2  0.0002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.126083  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4035  tail X family protein  36.92 
 
 		 68 aa  45.4  0.0002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.743163  unclonable  0.0000000000000167658 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0571  tail X family protein  38.71 
 
 		 75 aa  42.7  0.002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2203  Phage tail protein X  35.48 
 
 		 70 aa  42  0.003  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2608  tail X family protein  35.29 
 
 		 67 aa  40.4  0.007  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  hitchhiker  0.00274185  unclonable  2.34283e-16 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2642  tail X family protein  35.29 
 
 		 67 aa  40.4  0.007  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.125505  hitchhiker  0.00331618 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>