25 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pfl01_1150 on replicon NC_007492
Organism: Pseudomonas fluorescens Pf0-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007492  Pfl01_1150  Phage tail X  100 
 
 		 70 aa  140  5e-33  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0210537  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2499  phage tail X family protein  47.54 
 
 		 69 aa  59.7  0.00000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0126871  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2507  phage tail X family protein  45.9 
 
 		 69 aa  57.4  0.00000006  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3294  phage tail X family protein  45.59 
 
 		 68 aa  52  0.000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.884324  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2646  tail X family protein  46.3 
 
 		 67 aa  52  0.000003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  decreased coverage  0.00667297  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3176  tail X family protein  45.9 
 
 		 67 aa  49.3  0.00002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.753012  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1934  bacteriophage protein  35.29 
 
 		 68 aa  48.9  0.00002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.5631  normal  0.801255 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2863  phage Tail Protein X  39.71 
 
 		 67 aa  49.3  0.00002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2911  tail X family protein  40 
 
 		 69 aa  48.9  0.00002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.125785  normal  0.4425 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2772  tail X family protein  44.44 
 
 		 67 aa  47  0.00008  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.592112  decreased coverage  0.0000146404 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3045  phage Tail Protein X  44.44 
 
 		 67 aa  47  0.00008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000746353 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0929  phage tail protein X  44.44 
 
 		 67 aa  47  0.00008  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_37560  Phage P2 tail gpX-like protein  42.86 
 
 		 69 aa  46.6  0.0001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.881867  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4370  phage Tail Protein X  43.55 
 
 		 67 aa  45.8  0.0002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.621111  hitchhiker  0.00000000857758 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01358  phage Tail Protein X  40 
 
 		 64 aa  45.4  0.0003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  decreased coverage  0.00715171  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3496  phage tail X family protein  39.71 
 
 		 67 aa  44.3  0.0007  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.147017 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0882  tail X family protein  35.48 
 
 		 71 aa  43.1  0.001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.126083  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1131  phage-related tail protein  35.48 
 
 		 72 aa  43.5  0.001  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0392  phage-related tail protein  35.48 
 
 		 72 aa  43.5  0.001  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02001  hypothetical protein  40.3 
 
 		 73 aa  43.1  0.001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4841  tail X family protein  44.23 
 
 		 70 aa  43.1  0.001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.223234  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1153  tail X family protein  35.48 
 
 		 72 aa  42.7  0.002  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0202  tail X family protein  41.51 
 
 		 70 aa  42.7  0.002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.10462 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4328  phage tail protein GpX  36.21 
 
 		 67 aa  40.4  0.009  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00292132 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1829  tail X family protein  36.36 
 
 		 67 aa  40.4  0.01  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.00586529  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>