51 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PC1_2646 on replicon NC_012917
Organism: Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012917  PC1_2646  tail X family protein  100 
 
 		 67 aa  137  3.9999999999999997e-32  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  decreased coverage  0.00667297  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2863  phage Tail Protein X  67.16 
 
 		 67 aa  96.3  1e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2332  tail X family protein  61.19 
 
 		 67 aa  89.7  1e-17  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0325995  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0929  phage tail protein X  64.18 
 
 		 67 aa  85.9  2e-16  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2772  tail X family protein  64.18 
 
 		 67 aa  85.9  2e-16  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.592112  decreased coverage  0.0000146404 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3045  phage Tail Protein X  64.18 
 
 		 67 aa  85.9  2e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000746353 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3176  tail X family protein  58.21 
 
 		 67 aa  82  0.000000000000003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.753012  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1829  tail X family protein  50.75 
 
 		 67 aa  80.9  0.000000000000005  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.00586529  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0873  tail X family protein  55.22 
 
 		 67 aa  80.9  0.000000000000005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.0899137 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4370  phage Tail Protein X  56.72 
 
 		 67 aa  79  0.00000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.621111  hitchhiker  0.00000000857758 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3047  phage tail protein GpX  55.22 
 
 		 67 aa  76.3  0.0000000000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000083115 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2088  tail X family protein  44.78 
 
 		 67 aa  75.5  0.0000000000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0545873  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1934  bacteriophage protein  52.94 
 
 		 68 aa  75.5  0.0000000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.5631  normal  0.801255 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3294  phage tail X family protein  54.41 
 
 		 68 aa  74.7  0.0000000000004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.884324  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4328  phage tail protein GpX  53.73 
 
 		 67 aa  74.3  0.0000000000005  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00292132 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3496  phage tail X family protein  50.75 
 
 		 67 aa  73.2  0.000000000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.147017 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_37560  Phage P2 tail gpX-like protein  54.55 
 
 		 69 aa  72.4  0.000000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.881867  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0202  tail X family protein  57.14 
 
 		 70 aa  70.9  0.000000000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.10462 
 
 
-
 
NC_002978  WD0568  prophage P2W3, tail protein X, putative  44.44 
 
 		 69 aa  70.9  0.000000000006  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.37075  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01358  phage Tail Protein X  55.56 
 
 		 64 aa  70.1  0.000000000008  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  decreased coverage  0.00715171  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4841  tail X family protein  54.29 
 
 		 70 aa  67.8  0.00000000005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.223234  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3828  tail X family protein  59.02 
 
 		 73 aa  67  0.00000000008  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1346  Phage tail protein X  47.06 
 
 		 68 aa  65.5  0.0000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0752  hypothetical protein  41.94 
 
 		 70 aa  65.1  0.0000000003  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.286797  normal  0.157353 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2911  tail X family protein  53.03 
 
 		 69 aa  65.1  0.0000000003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.125785  normal  0.4425 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1624  P2-like protein prophage tail protein X-like protein  60.78 
 
 		 73 aa  63.9  0.0000000007  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1855  phage tail X family protein  43.75 
 
 		 68 aa  60.8  0.000000006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.520238  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0392  phage-related tail protein  47.69 
 
 		 72 aa  59.7  0.00000001  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1131  phage-related tail protein  47.69 
 
 		 72 aa  59.7  0.00000001  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1153  tail X family protein  46.15 
 
 		 72 aa  58.2  0.00000004  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0882  tail X family protein  40.62 
 
 		 71 aa  55.5  0.0000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.126083  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2642  tail X family protein  44.44 
 
 		 67 aa  54.7  0.0000005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.125505  hitchhiker  0.00331618 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2608  tail X family protein  44.44 
 
 		 67 aa  54.7  0.0000005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  hitchhiker  0.00274185  unclonable  2.34283e-16 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1150  Phage tail X  46.3 
 
 		 70 aa  52  0.000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0210537  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1279  phage tail X  35.38 
 
 		 72 aa  51.6  0.000003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.439324 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_32140  Phage tail X protein  39.06 
 
 		 64 aa  50.8  0.000006  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4035  tail X family protein  35.94 
 
 		 68 aa  50.1  0.000009  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.743163  unclonable  0.0000000000000167658 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2290  phage tail X family protein  41.94 
 
 		 70 aa  49.7  0.00001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.525878  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3320  phage tail X  41.27 
 
 		 70 aa  50.1  0.00001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1217  tail X family protein  40.62 
 
 		 68 aa  49.7  0.00001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000611286 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3391  tail protein X  41.27 
 
 		 68 aa  48.5  0.00003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2499  phage tail X family protein  30.3 
 
 		 69 aa  47.8  0.00005  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0126871  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4125  tail X family protein  43.75 
 
 		 77 aa  47.8  0.00006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.516119  normal  0.382743 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2507  phage tail X family protein  30.3 
 
 		 69 aa  47.4  0.00006  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_08140  hypothetical protein  35.94 
 
 		 68 aa  47.4  0.00007  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  3.77075e-17  hitchhiker  0.000171752 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3064  pyocin R2_PP, tail component protein  38.1 
 
 		 68 aa  47.4  0.00008  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.471622  normal  0.438372 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0771  hypothetical protein  37.5 
 
 		 68 aa  47  0.00009  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.63147  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2372  phage tail X  38.1 
 
 		 70 aa  46.2  0.0001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2761  putative P2-like prophage tail protein X  39.34 
 
 		 77 aa  43.1  0.001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.90872  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0571  tail X family protein  40.32 
 
 		 75 aa  43.1  0.001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3358  Phage tail component protein X  38.1 
 
 		 70 aa  40.8  0.006  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>