53 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pnap_3294 on replicon NC_008781
Organism: Polaromonas naphthalenivorans CJ2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008781  Pnap_3294  phage tail X family protein  100 
 
 
68 aa  135  1e-31  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.884324  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2863  phage Tail Protein X  60.29 
 
 
67 aa  85.1  3e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2646  tail X family protein  55.88 
 
 
67 aa  82  0.000000000000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  decreased coverage  0.00667297  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0202  tail X family protein  55.71 
 
 
70 aa  80.1  0.000000000000008  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.10462 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4841  tail X family protein  58.57 
 
 
70 aa  79.7  0.00000000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.223234  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3045  phage Tail Protein X  57.35 
 
 
67 aa  73.9  0.0000000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000746353 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2772  tail X family protein  57.35 
 
 
67 aa  73.9  0.0000000000006  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.592112  decreased coverage  0.0000146404 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0929  phage tail protein X  57.35 
 
 
67 aa  73.9  0.0000000000006  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3176  tail X family protein  54.41 
 
 
67 aa  72.8  0.000000000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.753012  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_37560  Phage P2 tail gpX-like protein  51.52 
 
 
69 aa  72.8  0.000000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.881867  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01358  phage Tail Protein X  58.73 
 
 
64 aa  70.5  0.000000000007  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  decreased coverage  0.00715171  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1934  bacteriophage protein  45.59 
 
 
68 aa  68.6  0.00000000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.5631  normal  0.801255 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2332  tail X family protein  44.12 
 
 
67 aa  68.2  0.00000000003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0325995  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1829  tail X family protein  41.18 
 
 
67 aa  68.2  0.00000000003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.00586529  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2088  tail X family protein  45.59 
 
 
67 aa  67.8  0.00000000004  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0545873  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4370  phage Tail Protein X  48.53 
 
 
67 aa  66.6  0.00000000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.621111  hitchhiker  0.00000000857758 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1346  Phage tail protein X  45.59 
 
 
68 aa  66.2  0.0000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0873  tail X family protein  45.59 
 
 
67 aa  64.7  0.0000000004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.0899137 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4328  phage tail protein GpX  45.59 
 
 
67 aa  61.6  0.000000003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00292132 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3047  phage tail protein GpX  45.59 
 
 
67 aa  61.6  0.000000004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000083115 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3496  phage tail X family protein  45.59 
 
 
67 aa  60.8  0.000000006  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.147017 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0752  hypothetical protein  41.27 
 
 
70 aa  60.1  0.00000001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.286797  normal  0.157353 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0771  hypothetical protein  46.15 
 
 
68 aa  57.8  0.00000005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.63147  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3320  phage tail X  45.31 
 
 
70 aa  57.8  0.00000005  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2499  phage tail X family protein  40.3 
 
 
69 aa  57.4  0.00000006  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0126871  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_08140  hypothetical protein  43.08 
 
 
68 aa  57.4  0.00000006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  3.77075e-17  hitchhiker  0.000171752 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1855  phage tail X family protein  41.54 
 
 
68 aa  56.6  0.0000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.520238  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0392  phage-related tail protein  43.08 
 
 
72 aa  55.5  0.0000002  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1131  phage-related tail protein  43.08 
 
 
72 aa  55.5  0.0000002  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1153  tail X family protein  43.08 
 
 
72 aa  55.8  0.0000002  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0882  tail X family protein  40 
 
 
71 aa  55.8  0.0000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.126083  normal 
 
 
-
 
NC_002978  WD0568  prophage P2W3, tail protein X, putative  39.06 
 
 
69 aa  55.8  0.0000002  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.37075  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1150  Phage tail X  45.59 
 
 
70 aa  55.5  0.0000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0210537  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2642  tail X family protein  44.12 
 
 
67 aa  55.5  0.0000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.125505  hitchhiker  0.00331618 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2608  tail X family protein  44.12 
 
 
67 aa  55.5  0.0000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  hitchhiker  0.00274185  unclonable  2.34283e-16 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2911  tail X family protein  40.91 
 
 
69 aa  56.2  0.0000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.125785  normal  0.4425 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2372  phage tail X  45.31 
 
 
70 aa  55.5  0.0000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1279  phage tail X  43.94 
 
 
72 aa  55.1  0.0000003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.439324 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2290  phage tail X family protein  42.19 
 
 
70 aa  54.7  0.0000004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.525878  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2507  phage tail X family protein  38.81 
 
 
69 aa  54.7  0.0000004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_32140  Phage tail X protein  41.54 
 
 
64 aa  53.1  0.000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1624  P2-like protein prophage tail protein X-like protein  42.86 
 
 
73 aa  53.1  0.000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4035  tail X family protein  35.38 
 
 
68 aa  48.9  0.00002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.743163  unclonable  0.0000000000000167658 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3391  tail protein X  37.5 
 
 
68 aa  47.4  0.00007  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2761  putative P2-like prophage tail protein X  42.62 
 
 
77 aa  46.6  0.0001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.90872  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3828  tail X family protein  48.08 
 
 
73 aa  46.2  0.0001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3358  Phage tail component protein X  40.62 
 
 
70 aa  46.2  0.0001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0571  tail X family protein  41.79 
 
 
75 aa  45.1  0.0003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4125  tail X family protein  39.71 
 
 
77 aa  43.9  0.0007  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.516119  normal  0.382743 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1217  tail X family protein  36.92 
 
 
68 aa  43.9  0.0008  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000611286 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3064  pyocin R2_PP, tail component protein  42 
 
 
68 aa  43.9  0.0008  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.471622  normal  0.438372 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1394  putative bacteriophage protein  51.28 
 
 
40 aa  42.7  0.002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.604078  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0697  tail X family protein  39.68 
 
 
78 aa  42  0.003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>