36 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daci_2642 on replicon NC_010002
Organism: Delftia acidovorans SPH-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010002  Daci_2642  tail X family protein  100 
 
 
67 aa  135  1e-31  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.125505  hitchhiker  0.00331618 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2608  tail X family protein  100 
 
 
67 aa  135  1e-31  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  hitchhiker  0.00274185  unclonable  2.34283e-16 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3176  tail X family protein  49.25 
 
 
67 aa  64.7  0.0000000004  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.753012  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2863  phage Tail Protein X  43.28 
 
 
67 aa  63.2  0.000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3496  phage tail X family protein  46.27 
 
 
67 aa  61.6  0.000000004  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.147017 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2772  tail X family protein  43.28 
 
 
67 aa  58.9  0.00000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.592112  decreased coverage  0.0000146404 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3045  phage Tail Protein X  43.28 
 
 
67 aa  58.9  0.00000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000746353 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4370  phage Tail Protein X  49.25 
 
 
67 aa  58.9  0.00000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.621111  hitchhiker  0.00000000857758 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2332  tail X family protein  43.28 
 
 
67 aa  58.9  0.00000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0325995  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0929  phage tail protein X  43.28 
 
 
67 aa  58.9  0.00000002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_37560  Phage P2 tail gpX-like protein  50.77 
 
 
69 aa  55.8  0.0000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.881867  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3047  phage tail protein GpX  43.28 
 
 
67 aa  55.5  0.0000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000083115 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2088  tail X family protein  40.3 
 
 
67 aa  54.7  0.0000004  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0545873  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4328  phage tail protein GpX  43.28 
 
 
67 aa  54.7  0.0000004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00292132 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2646  tail X family protein  44.44 
 
 
67 aa  54.7  0.0000005  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  decreased coverage  0.00667297  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1829  tail X family protein  38.81 
 
 
67 aa  53.9  0.0000008  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.00586529  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3294  phage tail X family protein  54.9 
 
 
68 aa  53.1  0.000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.884324  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4841  tail X family protein  56.86 
 
 
70 aa  53.1  0.000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.223234  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0202  tail X family protein  54.55 
 
 
70 aa  52.4  0.000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.10462 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0752  hypothetical protein  38.46 
 
 
70 aa  52.4  0.000002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.286797  normal  0.157353 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1346  Phage tail protein X  47.06 
 
 
68 aa  52  0.000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2911  tail X family protein  45.16 
 
 
69 aa  51.2  0.000005  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.125785  normal  0.4425 
 
 
-
 
NC_002978  WD0568  prophage P2W3, tail protein X, putative  35.94 
 
 
69 aa  50.1  0.00001  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.37075  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01358  phage Tail Protein X  47.54 
 
 
64 aa  50.1  0.00001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  decreased coverage  0.00715171  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1624  P2-like protein prophage tail protein X-like protein  53.06 
 
 
73 aa  47.8  0.00005  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0697  tail X family protein  36.36 
 
 
78 aa  45.4  0.0002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3320  phage tail X  40 
 
 
70 aa  44.3  0.0006  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1279  phage tail X  44.78 
 
 
72 aa  44.3  0.0006  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.439324 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0392  phage-related tail protein  33.82 
 
 
72 aa  43.1  0.001  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1131  phage-related tail protein  33.82 
 
 
72 aa  43.1  0.001  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2372  phage tail X  40 
 
 
70 aa  43.1  0.001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1855  phage tail X family protein  37.93 
 
 
68 aa  41.6  0.003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.520238  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1153  tail X family protein  33.33 
 
 
72 aa  41.6  0.004  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0873  tail X family protein  34.33 
 
 
67 aa  41.2  0.005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.0899137 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2290  phage tail X family protein  38.33 
 
 
70 aa  40.8  0.006  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.525878  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1934  bacteriophage protein  35.29 
 
 
68 aa  40.4  0.007  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.5631  normal  0.801255 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>