35 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PSPA7_0771 on replicon NC_009656
Organism: Pseudomonas aeruginosa PA7



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009656  PSPA7_0771  hypothetical protein  100 
 
 
68 aa  141  3e-33  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.63147  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_08140  hypothetical protein  85.29 
 
 
68 aa  124  5e-28  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  3.77075e-17  hitchhiker  0.000171752 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4035  tail X family protein  55.88 
 
 
68 aa  88.6  2e-17  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.743163  unclonable  0.0000000000000167658 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3391  tail protein X  61.19 
 
 
68 aa  87  8e-17  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1217  tail X family protein  61.76 
 
 
68 aa  86.3  1e-16  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000611286 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3064  pyocin R2_PP, tail component protein  68.42 
 
 
68 aa  82  0.000000000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.471622  normal  0.438372 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_32140  Phage tail X protein  59.68 
 
 
64 aa  80.5  0.000000000000007  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1855  phage tail X family protein  53.73 
 
 
68 aa  75.5  0.0000000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.520238  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3320  phage tail X  42.86 
 
 
70 aa  55.1  0.0000003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3294  phage tail X family protein  46.15 
 
 
68 aa  54.3  0.0000005  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.884324  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2290  phage tail X family protein  42.86 
 
 
70 aa  53.1  0.000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.525878  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2372  phage tail X  41.43 
 
 
70 aa  51.6  0.000004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2863  phage Tail Protein X  41.54 
 
 
67 aa  50.8  0.000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3176  tail X family protein  47.46 
 
 
67 aa  49.7  0.00001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.753012  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0882  tail X family protein  40.85 
 
 
71 aa  48.9  0.00003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.126083  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1934  bacteriophage protein  42.42 
 
 
68 aa  48.1  0.00004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.5631  normal  0.801255 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1829  tail X family protein  37.29 
 
 
67 aa  47.8  0.00005  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.00586529  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_37560  Phage P2 tail gpX-like protein  44.29 
 
 
69 aa  47.4  0.00006  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.881867  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0752  hypothetical protein  38.71 
 
 
70 aa  47  0.00008  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.286797  normal  0.157353 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2646  tail X family protein  37.5 
 
 
67 aa  47  0.00009  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  decreased coverage  0.00667297  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3047  phage tail protein GpX  40.98 
 
 
67 aa  46.2  0.0001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000083115 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1346  Phage tail protein X  46.81 
 
 
68 aa  45.8  0.0002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2332  tail X family protein  40.68 
 
 
67 aa  45.8  0.0002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0325995  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4328  phage tail protein GpX  40.98 
 
 
67 aa  45.8  0.0002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00292132 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2203  Phage tail protein X  44.44 
 
 
70 aa  45.8  0.0002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0929  phage tail protein X  40 
 
 
67 aa  45.1  0.0003  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2772  tail X family protein  40 
 
 
67 aa  45.1  0.0003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.592112  decreased coverage  0.0000146404 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3045  phage Tail Protein X  40 
 
 
67 aa  45.1  0.0003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000746353 
 
 
-
 
NC_002978  WD0568  prophage P2W3, tail protein X, putative  31.88 
 
 
69 aa  45.1  0.0004  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.37075  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4370  phage Tail Protein X  45 
 
 
67 aa  44.7  0.0004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.621111  hitchhiker  0.00000000857758 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2088  tail X family protein  38.98 
 
 
67 aa  42.7  0.001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0545873  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3358  Phage tail component protein X  40.85 
 
 
70 aa  41.6  0.003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3496  phage tail X family protein  38.33 
 
 
67 aa  40.8  0.006  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.147017 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1624  P2-like protein prophage tail protein X-like protein  36.76 
 
 
73 aa  40.4  0.008  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0202  tail X family protein  35.29 
 
 
70 aa  40  0.01  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.10462 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>