30 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RSP_3358 on replicon NC_007494
Organism: Rhodobacter sphaeroides 2.4.1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007494  RSP_3358  Phage tail component protein X  100 
 
 		 70 aa  141  2e-33  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2290  phage tail X family protein  51.79 
 
 		 70 aa  53.5  0.0000009  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.525878  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0882  tail X family protein  44.29 
 
 		 71 aa  52.4  0.000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.126083  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2911  tail X family protein  42.19 
 
 		 69 aa  49.7  0.00001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.125785  normal  0.4425 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0697  tail X family protein  46.15 
 
 		 78 aa  48.5  0.00003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3047  phage tail protein GpX  45.9 
 
 		 67 aa  48.1  0.00004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000083115 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4370  phage Tail Protein X  45.76 
 
 		 67 aa  48.1  0.00004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.621111  hitchhiker  0.00000000857758 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4328  phage tail protein GpX  45.9 
 
 		 67 aa  47.8  0.00005  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00292132 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_37560  Phage P2 tail gpX-like protein  48.33 
 
 		 69 aa  47  0.00008  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.881867  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3176  tail X family protein  43.1 
 
 		 67 aa  47  0.0001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.753012  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3064  pyocin R2_PP, tail component protein  43.48 
 
 		 68 aa  46.2  0.0002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.471622  normal  0.438372 
 
 
-
 
NC_002978  WD0568  prophage P2W3, tail protein X, putative  36.76 
 
 		 69 aa  45.4  0.0002  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.37075  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1624  P2-like protein prophage tail protein X-like protein  50 
 
 		 73 aa  45.8  0.0002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1934  bacteriophage protein  40.62 
 
 		 68 aa  45.8  0.0002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.5631  normal  0.801255 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1855  phage tail X family protein  38.24 
 
 		 68 aa  45.1  0.0003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.520238  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0752  hypothetical protein  38.46 
 
 		 70 aa  45.1  0.0003  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.286797  normal  0.157353 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_32140  Phage tail X protein  43.75 
 
 		 64 aa  43.9  0.0008  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2332  tail X family protein  41.38 
 
 		 67 aa  43.9  0.0009  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0325995  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1217  tail X family protein  44.07 
 
 		 68 aa  43.5  0.001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000611286 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_08140  hypothetical protein  41.18 
 
 		 68 aa  42.7  0.002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  3.77075e-17  hitchhiker  0.000171752 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3391  tail protein X  42.03 
 
 		 68 aa  42.4  0.002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1346  Phage tail protein X  50 
 
 		 68 aa  42.4  0.002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3320  phage tail X  41.07 
 
 		 70 aa  42.4  0.002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0771  hypothetical protein  40.85 
 
 		 68 aa  41.6  0.003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.63147  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3496  phage tail X family protein  39.34 
 
 		 67 aa  41.2  0.005  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.147017 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2646  tail X family protein  38.1 
 
 		 67 aa  40.8  0.006  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  decreased coverage  0.00667297  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2372  phage tail X  42.59 
 
 		 70 aa  40.8  0.007  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3294  phage tail X family protein  44 
 
 		 68 aa  40.8  0.007  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.884324  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0202  tail X family protein  40.91 
 
 		 70 aa  40.4  0.008  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.10462 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2203  Phage tail protein X  39.39 
 
 		 70 aa  40.4  0.008  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>