19 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tcr_2203 on replicon NC_007520
Organism: Thiomicrospira crunogena XCL-2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007520  Tcr_2203  Phage tail protein X  100 
 
 		 70 aa  142  2e-33  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2290  phage tail X family protein  45.45 
 
 		 70 aa  59.7  0.00000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.525878  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2372  phage tail X  43.94 
 
 		 70 aa  56.2  0.0000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3320  phage tail X  43.94 
 
 		 70 aa  55.5  0.0000003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0882  tail X family protein  36.36 
 
 		 71 aa  46.6  0.0001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.126083  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0752  hypothetical protein  40.91 
 
 		 70 aa  46.6  0.0001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.286797  normal  0.157353 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0771  hypothetical protein  44.44 
 
 		 68 aa  45.8  0.0002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.63147  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_08140  hypothetical protein  47.06 
 
 		 68 aa  46.2  0.0002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  3.77075e-17  hitchhiker  0.000171752 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_37560  Phage P2 tail gpX-like protein  35.94 
 
 		 69 aa  44.3  0.0005  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.881867  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3391  tail protein X  38.81 
 
 		 68 aa  43.5  0.001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_32140  Phage tail X protein  47.92 
 
 		 64 aa  43.5  0.001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4370  phage Tail Protein X  42.62 
 
 		 67 aa  42.4  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.621111  hitchhiker  0.00000000857758 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1934  bacteriophage protein  35.48 
 
 		 68 aa  42  0.003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.5631  normal  0.801255 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3047  phage tail protein GpX  39.34 
 
 		 67 aa  41.2  0.005  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000083115 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1855  phage tail X family protein  39.58 
 
 		 68 aa  40.8  0.006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.520238  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3358  Phage tail component protein X  39.39 
 
 		 70 aa  40.4  0.008  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4328  phage tail protein GpX  40.68 
 
 		 67 aa  40.4  0.008  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00292132 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0392  phage-related tail protein  41.07 
 
 		 72 aa  40.4  0.009  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1131  phage-related tail protein  41.07 
 
 		 72 aa  40.4  0.009  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>