More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SAG0178 on replicon NC_004116
Organism: Streptococcus agalactiae 2603V/R



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_004116  SAG0178  tRNA-binding domain-containing protein  100 
 
 
208 aa  427  1e-119  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1824  EMAP domain-containing protein  67.15 
 
 
207 aa  291  6e-78  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  decreased coverage  0.0000678669  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0436  EMAP domain-containing protein  59.62 
 
 
208 aa  260  8e-69  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4809  putative tRNA binding domain protein  47.45 
 
 
204 aa  182  3e-45  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4834  tRNA-binding domain-containing protein  46.94 
 
 
204 aa  181  1e-44  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4587  tRNA-binding domain-containing protein  46.94 
 
 
204 aa  180  1e-44  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4804  putative tRNA binding domain protein  46.94 
 
 
204 aa  180  1e-44  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.35936  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4424  tRNA-binding-domain-containing protein  46.94 
 
 
204 aa  180  1e-44  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4442  tRNA-binding-domain-containing protein  46.94 
 
 
204 aa  180  1e-44  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.128672  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4943  tRNA-binding domain-containing protein  46.94 
 
 
204 aa  180  1e-44  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4825  putative tRNA binding domain protein  46.94 
 
 
201 aa  180  1e-44  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00270111  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3353  tRNA-binding domain-containing protein  47.45 
 
 
201 aa  179  2.9999999999999997e-44  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0432  putative tRNA binding domain protein  46.43 
 
 
204 aa  176  2e-43  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.630907  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4523  tRNA-binding domain-containing protein  45.92 
 
 
201 aa  174  9e-43  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0691  t-RNA-binding domain protein  44.39 
 
 
201 aa  171  5.999999999999999e-42  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2741  t-RNA-binding domain protein  41.84 
 
 
201 aa  165  5e-40  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00906438  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1436  EMAP domain-containing protein  41.26 
 
 
215 aa  157  1e-37  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.180074  normal 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1270  EMAP domain-containing protein  41.54 
 
 
203 aa  151  5e-36  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.514449  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1251  tRNA-binding domain-containing protein  40.95 
 
 
215 aa  148  4e-35  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0000000609794  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0707  EMAP domain-containing protein  39.61 
 
 
218 aa  142  3e-33  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.653747  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1797  tRNA-binding domain-containing protein  38 
 
 
198 aa  131  6.999999999999999e-30  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1832  tRNA-binding domain-containing protein  38 
 
 
198 aa  131  6.999999999999999e-30  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.448228  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1302  hypothetical protein  38 
 
 
198 aa  121  8e-27  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.000484296  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1341  phenylalanyl-tRNA synthetase subunit beta  43.17 
 
 
810 aa  100  1e-20  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0182  putative tRNA binding domain protein  36 
 
 
198 aa  99.4  3e-20  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1582  phenylalanyl-tRNA synthetase subunit beta  39.58 
 
 
809 aa  99  4e-20  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1642  phenylalanyl-tRNA synthetase subunit beta  40.28 
 
 
809 aa  99  5e-20  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.39134 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1972  phenylalanyl-tRNA synthetase subunit beta  39.58 
 
 
809 aa  98.6  6e-20  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1453  phenylalanyl-tRNA synthetase subunit beta  42.64 
 
 
814 aa  95.5  5e-19  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2395  phenylalanyl-tRNA synthetase subunit beta  42.64 
 
 
814 aa  95.5  6e-19  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.990048  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1875  phenylalanyl-tRNA synthetase subunit beta  50 
 
 
813 aa  94.7  9e-19  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0426  putative phenylalanyl-tRNA synthetase, beta subunit  46.77 
 
 
876 aa  94  1e-18  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  0.333075  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2765  phenylalanyl-tRNA synthetase subunit beta  41.91 
 
 
793 aa  93.6  2e-18  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2638  phenylalanyl-tRNA synthetase subunit beta  41.91 
 
 
793 aa  93.2  2e-18  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1930  phenylalanyl-tRNA synthetase, beta subunit  44.17 
 
 
804 aa  93.6  2e-18  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.0326717 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1012  phenylalanyl-tRNA synthetase beta subunit  41.84 
 
 
781 aa  93.6  2e-18  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.0141167 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0444  phenylalanyl-tRNA synthetase subunit beta  45 
 
 
803 aa  94  2e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.341552  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1838  phenylalanyl-tRNA synthetase, beta subunit  47.17 
 
 
810 aa  93.2  3e-18  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0684561 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1165  phenylalanyl-tRNA synthetase subunit beta  40 
 
 
815 aa  93.2  3e-18  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.827312  normal  0.855752 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_2039  phenylalanyl-tRNA synthetase subunit beta  44.44 
 
 
804 aa  92.4  4e-18  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0763  phenylalanyl-tRNA synthetase subunit beta  42.64 
 
 
797 aa  92.4  4e-18  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002978  WD0425  phenylalanyl-tRNA synthetase subunit beta  46.61 
 
 
779 aa  92.4  5e-18  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR2123  phenylalanyl-tRNA synthetase subunit beta  44.44 
 
 
804 aa  92.4  5e-18  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.615312  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2107  phenylalanyl-tRNA synthetase subunit beta  41.1 
 
 
808 aa  92.4  5e-18  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.123782  normal  0.168772 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1280  phenylalanyl-tRNA synthetase subunit beta  38.62 
 
 
815 aa  92  6e-18  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.477194  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0797  phenylalanyl-tRNA synthetase subunit beta  44.34 
 
 
804 aa  91.3  8e-18  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1998  phenylalanyl-tRNA synthetase, beta subunit  51.72 
 
 
839 aa  90.5  2e-17  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal  0.448786 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2800  phenylalanyl-tRNA synthetase subunit beta  47.62 
 
 
802 aa  90.1  2e-17  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1312  phenylalanyl-tRNA synthetase subunit beta  45.28 
 
 
803 aa  90.5  2e-17  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0484  phenylalanyl-tRNA synthetase subunit beta  45.28 
 
 
801 aa  90.5  2e-17  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.376458  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0677  phenylalanyl-tRNA synthetase subunit beta  44.34 
 
 
801 aa  89.7  2e-17  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.443307  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0454  phenylalanyl-tRNA synthetase subunit beta  48.6 
 
 
800 aa  89.7  3e-17  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2849  phenylalanyl-tRNA synthetase subunit beta  39.01 
 
 
808 aa  89.4  4e-17  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.0102687 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3020  phenylalanyl-tRNA synthetase subunit beta  40.94 
 
 
796 aa  88.6  6e-17  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl589  phenylalanyl-tRNA synthetase, beta subunit  36.79 
 
 
193 aa  88.2  8e-17  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  0.655316  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4611  phenylalanyl-tRNA synthetase subunit beta  45.37 
 
 
815 aa  88.2  8e-17  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.16834  normal  0.0519802 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1253  phenylalanyl-tRNA synthetase subunit beta  47.96 
 
 
778 aa  88.2  9e-17  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.434071  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1534  phenylalanyl-tRNA synthetase subunit beta  46.02 
 
 
810 aa  87.4  1e-16  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.540635  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0968  phenylalanyl-tRNA synthetase subunit beta  46.02 
 
 
810 aa  87.4  1e-16  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1005  phenylalanyl-tRNA synthetase subunit beta  41.6 
 
 
818 aa  87.8  1e-16  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1091  phenylalanyl-tRNA synthetase subunit beta  46.02 
 
 
810 aa  87.4  1e-16  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.39692  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1896  phenylalanyl-tRNA synthetase subunit beta  46.02 
 
 
810 aa  87.4  1e-16  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.963354  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1717  phenylalanyl-tRNA synthetase subunit beta  46.02 
 
 
810 aa  87.4  1e-16  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1740  phenylalanyl-tRNA synthetase subunit beta  46.02 
 
 
810 aa  87.4  1e-16  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.218671  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2992  phenylalanyl-tRNA synthetase subunit beta  40.77 
 
 
793 aa  87.4  1e-16  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2590  phenylalanyl-tRNA synthetase subunit beta  46.02 
 
 
810 aa  87.4  1e-16  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0198  phenylalanyl-tRNA synthetase subunit beta  46.02 
 
 
810 aa  87.4  1e-16  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0148461  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0834  phenylalanyl-tRNA synthetase subunit beta  39.42 
 
 
818 aa  87.4  1e-16  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3247  phenylalanyl-tRNA synthetase, beta subunit  41.51 
 
 
806 aa  87.8  1e-16  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2854  phenylalanyl-tRNA synthetase subunit beta  40.91 
 
 
812 aa  86.7  2e-16  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.440462  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1883  phenylalanyl-tRNA synthetase subunit beta  40.58 
 
 
806 aa  86.7  2e-16  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.0428661 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2672  phenylalanyl-tRNA synthetase subunit beta  46.24 
 
 
794 aa  86.3  3e-16  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0280  phenylalanyl-tRNA synthetase, beta subunit  38.74 
 
 
807 aa  86.3  3e-16  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3524  phenylalanyl-tRNA synthetase subunit beta  47.57 
 
 
800 aa  86.3  3e-16  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1455  phenylalanyl-tRNA synthetase, beta subunit  51.22 
 
 
789 aa  86.3  3e-16  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.105434  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1816  phenylalanyl-tRNA synthetase, beta subunit  42.45 
 
 
819 aa  85.9  4e-16  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.597533  normal  0.483495 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0698  phenylalanyl-tRNA synthetase, beta subunit  45.54 
 
 
791 aa  85.5  5e-16  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.155841  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0689  phenylalanyl-tRNA synthetase subunit beta  38.06 
 
 
796 aa  85.5  5e-16  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.428867  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0979  phenylalanyl-tRNA synthetase subunit beta  42.57 
 
 
805 aa  85.1  7e-16  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.126916 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1774  phenylalanyl-tRNA synthetase subunit beta  45.13 
 
 
809 aa  85.1  7e-16  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.35718 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4620  phenylalanyl-tRNA synthetase subunit beta  41.35 
 
 
809 aa  85.1  7e-16  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.52188  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0492  phenylalanyl-tRNA synthetase subunit beta  39.44 
 
 
792 aa  85.1  7e-16  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.229173  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2751  phenylalanyl-tRNA synthetase subunit beta  50 
 
 
811 aa  85.1  7e-16  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0848577  normal 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0434  phenylalanyl-tRNA synthetase subunit beta  45.87 
 
 
788 aa  85.1  7e-16  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1376  phenylalanyl-tRNA synthetase subunit beta  50 
 
 
811 aa  85.1  7e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.44726 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1404  phenylalanyl-tRNA synthetase subunit beta  45.13 
 
 
809 aa  85.1  7e-16  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1364  phenylalanyl-tRNA synthetase subunit beta  45.13 
 
 
809 aa  85.1  7e-16  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1480  phenylalanyl-tRNA synthetase subunit beta  45.13 
 
 
809 aa  84.7  8e-16  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3094  phenylalanyl-tRNA synthetase subunit beta  44.86 
 
 
820 aa  84.7  8e-16  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.067961 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1912  phenylalanyl-tRNA synthetase, beta subunit  38.33 
 
 
850 aa  84.7  8e-16  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.24608 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1457  phenylalanyl-tRNA synthetase subunit beta  45.13 
 
 
809 aa  84.7  8e-16  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0870  phenylalanyl-tRNA synthetase subunit beta  45.92 
 
 
778 aa  84.7  8e-16  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0998  phenylalanyl-tRNA synthetase subunit beta  45.13 
 
 
809 aa  84.7  8e-16  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1217  phenylalanyl-tRNA synthetase subunit beta  43.82 
 
 
805 aa  84.7  9e-16  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0000000796481  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0587  phenylalanyl-tRNA synthetase subunit beta  42.5 
 
 
785 aa  84.7  9e-16  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0361  phenylalanyl-tRNA synthetase subunit beta  41.51 
 
 
827 aa  84.7  9e-16  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.996315  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1998  phenylalanyl-tRNA synthetase beta subunit  39.69 
 
 
784 aa  84.3  0.000000000000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.109142  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1604  phenylalanyl-tRNA synthetase, beta subunit  38.33 
 
 
807 aa  83.2  0.000000000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.140835  normal  0.0323303 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1662  phenylalanyl-tRNA synthetase, beta subunit  38.46 
 
 
793 aa  83.6  0.000000000000002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0047  phenylalanyl-tRNA synthetase subunit beta  41.67 
 
 
802 aa  83.6  0.000000000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>