123 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rsph17025_1424 on replicon NC_009428
Organism: Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009428  Rsph17025_1424  hypothetical protein  100 
 
 
184 aa  371  1e-102  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1964  hypothetical protein  35.59 
 
 
333 aa  68.9  0.00000000004  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2430  hypothetical protein  35.59 
 
 
333 aa  68.9  0.00000000004  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.762343 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2804  hypothetical protein  35.59 
 
 
333 aa  68.9  0.00000000004  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.323871 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4157  hypothetical protein  35.59 
 
 
333 aa  68.9  0.00000000004  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0921  hypothetical protein  44 
 
 
204 aa  67.8  0.00000000009  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.609607 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2507  hypothetical protein  35.65 
 
 
333 aa  65.5  0.0000000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.953553 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5836  hypothetical protein  34.19 
 
 
329 aa  65.1  0.0000000005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01494  ISXo2 putative transposase  34.07 
 
 
333 aa  62  0.000000005  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1543  hypothetical protein  35.34 
 
 
359 aa  61.2  0.000000008  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.165042 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04109  ISXo2 putative transposase  34.07 
 
 
320 aa  61.2  0.000000008  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.933255  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3177  hypothetical protein  35.34 
 
 
366 aa  60.8  0.000000009  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0357941  normal  0.042708 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3230  hypothetical protein  35.34 
 
 
356 aa  61.2  0.000000009  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3779  hypothetical protein  35.34 
 
 
334 aa  61.2  0.000000009  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.603966 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5775  hypothetical protein  35.34 
 
 
334 aa  61.2  0.000000009  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.0230783 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01827  putative transposase  34.07 
 
 
448 aa  60.5  0.00000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.586106  n/a   
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3708  ISSpo8, transposase  30.71 
 
 
329 aa  60.1  0.00000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03600  ISXo2 putative transposase  33.33 
 
 
333 aa  59.7  0.00000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3333  hypothetical protein  44.44 
 
 
338 aa  59.3  0.00000003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.664615  n/a   
 
 
-
 
NC_009469  Acry_3539  hypothetical protein  44.44 
 
 
338 aa  59.3  0.00000003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0781  hypothetical protein  44.44 
 
 
338 aa  59.3  0.00000003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2206  hypothetical protein  44.44 
 
 
338 aa  59.3  0.00000003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.48827  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00952  ISXo2 putative transposase  33.33 
 
 
333 aa  59.3  0.00000003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.170926  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01966  ISXo2 putative transposase  33.33 
 
 
353 aa  59.3  0.00000003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  hitchhiker  0.0000253564  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0131  ISSpo8, transposase  36.47 
 
 
313 aa  59.3  0.00000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.0235265 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03202  ISXo2 putative transposase  33.33 
 
 
350 aa  59.3  0.00000003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06214  ISXo2 putative transposase  33.33 
 
 
333 aa  59.3  0.00000003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03442  ISXo2 putative transposase  33.33 
 
 
362 aa  59.3  0.00000003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03653  ISXo2 putative transposase  33.33 
 
 
360 aa  59.3  0.00000003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00277  ISXo2 putative transposase  33.33 
 
 
484 aa  58.9  0.00000004  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04440  ISXo2 putative transposase  33.33 
 
 
333 aa  58.9  0.00000004  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_05468  hypothetical protein  33.33 
 
 
367 aa  58.9  0.00000004  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3136  hypothetical protein  32.48 
 
 
323 aa  58.5  0.00000005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.491071  normal  0.0566917 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3166  hypothetical protein  32.48 
 
 
345 aa  58.5  0.00000005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.320291 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03894  ISXo2 putative transposase  33.33 
 
 
418 aa  58.5  0.00000005  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5545  hypothetical protein  32.35 
 
 
334 aa  58.2  0.00000007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.040244 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5066  hypothetical protein  32.35 
 
 
334 aa  58.2  0.00000007  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01617  ISXo2 putative transposase  33.33 
 
 
380 aa  58.2  0.00000007  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.6149  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0919  hypothetical protein  38.75 
 
 
311 aa  57.4  0.0000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.299986  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0048  putative transposase  40.74 
 
 
320 aa  55.1  0.0000006  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00000000000122957 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2666  hypothetical protein  26.9 
 
 
319 aa  54.3  0.0000009  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0915  hypothetical protein  26.9 
 
 
319 aa  54.3  0.0000009  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2134  hypothetical protein  26.9 
 
 
319 aa  54.3  0.0000009  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0819  ISSod11, transposase  32.17 
 
 
318 aa  53.9  0.000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1282  ISSod11, transposase  32.17 
 
 
318 aa  53.9  0.000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1394  ISSod11, transposase  32.17 
 
 
318 aa  53.9  0.000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1436  ISSod11, transposase  32.17 
 
 
318 aa  53.9  0.000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1456  ISSod11, transposase  32.17 
 
 
318 aa  53.9  0.000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1950  ISSod11, transposase  32.17 
 
 
318 aa  53.9  0.000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2187  ISSod11, transposase  32.17 
 
 
318 aa  53.9  0.000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2210  ISSod11, transposase  32.17 
 
 
318 aa  53.9  0.000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2284  ISSod11, transposase  32.17 
 
 
306 aa  54.3  0.000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2819  ISSod11, transposase  32.17 
 
 
318 aa  53.9  0.000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3321  ISSod11, transposase  32.17 
 
 
318 aa  53.9  0.000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4436  ISSod11, transposase  32.17 
 
 
306 aa  54.3  0.000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0062  hypothetical protein  40 
 
 
163 aa  53.1  0.000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.470088 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0725  putative transposase  53.06 
 
 
318 aa  52.4  0.000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.420818 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1654  chromosome segregation ATPase; intracellular signalling protein  35.9 
 
 
596 aa  51.2  0.000009  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.353113  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0206  putative transposase  52.27 
 
 
329 aa  49.7  0.00002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0693887  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1156  ISSpo8, transposase  31.5 
 
 
312 aa  49.3  0.00003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0302963  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0147  transposase  50 
 
 
328 aa  47.8  0.0001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.216525  normal  0.924195 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1278  ISSpo3, transposase  27.27 
 
 
292 aa  47  0.0002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.38837  normal  0.274857 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01861  ISXo5 transposase  29.31 
 
 
338 aa  46.6  0.0002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.485604  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02306  ISXo5 transposase  29.57 
 
 
338 aa  46.2  0.0002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3478  ISSpo8, transposase  37.29 
 
 
314 aa  45.8  0.0003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1665  hypothetical protein  28.71 
 
 
313 aa  45.4  0.0004  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.908371  normal  0.0645935 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4134  putative transposase  40 
 
 
334 aa  45.4  0.0005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.436549  normal  0.202806 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03119  ISXo5 transposase  31.88 
 
 
338 aa  44.7  0.0007  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00331  ISXo5 transposase  28.7 
 
 
338 aa  43.9  0.001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04224  ISXo5 transposase  26.96 
 
 
338 aa  43.9  0.001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0733056  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02578  ISXo5 transposase  31.88 
 
 
338 aa  43.9  0.001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02827  ISXo5 transposase  28.7 
 
 
338 aa  44.3  0.001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03597  ISXo5 transposase  28.7 
 
 
338 aa  43.9  0.001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0069  hypothetical protein  25 
 
 
318 aa  43.5  0.002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2509  hypothetical protein  25 
 
 
318 aa  43.5  0.002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000139438  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3178  hypothetical protein  25 
 
 
318 aa  43.5  0.002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02631  IS1595 transposase  26.72 
 
 
260 aa  43.5  0.002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03198  transposase  31.88 
 
 
119 aa  43.1  0.002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01914  ISXoo10 transposase  27.35 
 
 
320 aa  42.7  0.003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.474572  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3338  hypothetical protein  26.5 
 
 
641 aa  42  0.005  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.0108944 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1505  ISSod11, transposase  30.21 
 
 
193 aa  41.6  0.006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.0000861665  hitchhiker  0.00324548 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04634  ISXo5 transposase  30.43 
 
 
338 aa  41.6  0.006  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00868  ISXo5 transposase  30.43 
 
 
338 aa  41.6  0.007  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.16246  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01069  ISXo5 transposase  30.43 
 
 
338 aa  41.2  0.007  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.168183  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01807  ISXo5 transposase  30.43 
 
 
338 aa  41.2  0.007  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.156782  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04330  ISXo5 transposase  30.43 
 
 
338 aa  41.6  0.007  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  hitchhiker  0.00000810616  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04595  ISXo5 transposase  30.43 
 
 
338 aa  41.2  0.007  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04081  ISXo5 transposase  30.43 
 
 
338 aa  41.2  0.007  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02567  transposase  30.43 
 
 
277 aa  41.6  0.007  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06092  ISXo5 transposase  30.43 
 
 
338 aa  41.2  0.007  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06059  ISXo5 transposase  30.43 
 
 
338 aa  41.6  0.007  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  hitchhiker  0.000704128  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_05836  ISXo5 transposase  30.43 
 
 
338 aa  41.2  0.007  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.979452  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06250  ISXo5 transposase  30.43 
 
 
338 aa  41.2  0.007  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  hitchhiker  0.00625171  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03214  ISXo5 transposase  30.43 
 
 
338 aa  41.2  0.007  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03976  ISXo5 transposase  30.43 
 
 
338 aa  41.2  0.007  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.84431  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03560  ISXo5 transposase  30.43 
 
 
341 aa  41.6  0.007  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.81013  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03695  ISXo5 transposase  30.43 
 
 
338 aa  41.2  0.007  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03780  ISXo5 transposase  30.43 
 
 
338 aa  41.2  0.007  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00429  ISXo5 transposase  30.43 
 
 
338 aa  41.2  0.008  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.901373  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00592  ISXo5 transposase  30.43 
 
 
338 aa  41.2  0.008  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.820948  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>