162 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPB_0921 on replicon NC_007778
Organism: Rhodopseudomonas palustris HaA2



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007778  RPB_0921  hypothetical protein  100 
 
 
204 aa  418  1e-116  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.609607 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1156  ISSpo8, transposase  55.05 
 
 
312 aa  122  4e-27  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0302963  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0081  ISSpo8, transposase  43.12 
 
 
323 aa  97.1  2e-19  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.462993  normal  0.0895527 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0131  ISSpo8, transposase  45.79 
 
 
313 aa  95.9  3e-19  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.0235265 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3478  ISSpo8, transposase  41.23 
 
 
314 aa  91.7  7e-18  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3708  ISSpo8, transposase  44.66 
 
 
329 aa  89.4  3e-17  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01494  ISXo2 putative transposase  38.52 
 
 
333 aa  87  2e-16  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03600  ISXo2 putative transposase  38.52 
 
 
333 aa  86.7  2e-16  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01617  ISXo2 putative transposase  38.52 
 
 
380 aa  85.5  4e-16  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.6149  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01827  putative transposase  38.52 
 
 
448 aa  85.5  4e-16  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.586106  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04109  ISXo2 putative transposase  37.7 
 
 
320 aa  85.1  6e-16  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.933255  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04440  ISXo2 putative transposase  37.7 
 
 
333 aa  85.1  7e-16  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_05468  hypothetical protein  37.7 
 
 
367 aa  84.7  9e-16  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03202  ISXo2 putative transposase  37.7 
 
 
350 aa  84.7  9e-16  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06214  ISXo2 putative transposase  37.7 
 
 
333 aa  84.3  0.000000000000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03442  ISXo2 putative transposase  37.7 
 
 
362 aa  84.3  0.000000000000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03894  ISXo2 putative transposase  37.7 
 
 
418 aa  84.3  0.000000000000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03653  ISXo2 putative transposase  37.7 
 
 
360 aa  84.3  0.000000000000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00952  ISXo2 putative transposase  37.7 
 
 
333 aa  84.3  0.000000000000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.170926  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01966  ISXo2 putative transposase  37.7 
 
 
353 aa  84.3  0.000000000000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  hitchhiker  0.0000253564  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5836  hypothetical protein  41.67 
 
 
329 aa  83.6  0.000000000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00277  ISXo2 putative transposase  37.7 
 
 
484 aa  83.2  0.000000000000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0069  hypothetical protein  38.89 
 
 
318 aa  82.8  0.000000000000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2509  hypothetical protein  38.89 
 
 
318 aa  82.8  0.000000000000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000139438  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3178  hypothetical protein  38.89 
 
 
318 aa  82.8  0.000000000000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2804  hypothetical protein  38.18 
 
 
333 aa  79.3  0.00000000000003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.323871 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1964  hypothetical protein  38.18 
 
 
333 aa  79.3  0.00000000000004  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2430  hypothetical protein  38.18 
 
 
333 aa  79.3  0.00000000000004  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.762343 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4157  hypothetical protein  38.18 
 
 
333 aa  79.3  0.00000000000004  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01914  ISXoo10 transposase  37.7 
 
 
320 aa  78.6  0.00000000000006  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.474572  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3136  hypothetical protein  39.81 
 
 
323 aa  78.2  0.00000000000009  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.491071  normal  0.0566917 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3166  hypothetical protein  39.81 
 
 
345 aa  77.8  0.0000000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.320291 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01861  ISXo5 transposase  32.79 
 
 
338 aa  76.6  0.0000000000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.485604  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02631  IS1595 transposase  36.07 
 
 
260 aa  77  0.0000000000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00484  ISXo5 transposase  33.33 
 
 
338 aa  76.3  0.0000000000003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.741552  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02306  ISXo5 transposase  32.79 
 
 
338 aa  76.3  0.0000000000003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04014  ISXo5 transposase  32.5 
 
 
338 aa  75.9  0.0000000000004  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0919  hypothetical protein  33.6 
 
 
311 aa  75.5  0.0000000000005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.299986  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2134  hypothetical protein  32.43 
 
 
319 aa  75.5  0.0000000000006  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0915  hypothetical protein  32.43 
 
 
319 aa  75.5  0.0000000000006  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1109  hypothetical protein  38.24 
 
 
341 aa  75.5  0.0000000000006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0062  hypothetical protein  36.36 
 
 
163 aa  75.1  0.0000000000006  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.470088 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2666  hypothetical protein  32.43 
 
 
319 aa  75.5  0.0000000000006  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02578  ISXo5 transposase  32.79 
 
 
338 aa  75.1  0.0000000000006  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03560  ISXo5 transposase  32.5 
 
 
341 aa  73.9  0.000000000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.81013  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00331  ISXo5 transposase  32.5 
 
 
338 aa  74.3  0.000000000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04224  ISXo5 transposase  32.5 
 
 
338 aa  74.3  0.000000000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0733056  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04634  ISXo5 transposase  32.5 
 
 
338 aa  73.6  0.000000000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03315  ISXo5 transposase  32.5 
 
 
338 aa  73.2  0.000000000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00592  ISXo5 transposase  32.5 
 
 
338 aa  73.2  0.000000000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.820948  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01473  ISXo5 transposase  32.5 
 
 
338 aa  73.6  0.000000000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02486  ISXo5 transposase  32.5 
 
 
338 aa  73.2  0.000000000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02759  ISXo5 transposase  32.5 
 
 
338 aa  73.6  0.000000000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.890391  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02827  ISXo5 transposase  32.5 
 
 
338 aa  73.9  0.000000000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03012  ISXo5 transposase  32.5 
 
 
338 aa  73.2  0.000000000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06219  ISXo5 transposase  32.5 
 
 
338 aa  72.8  0.000000000003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0124141  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06092  ISXo5 transposase  32.5 
 
 
338 aa  72.8  0.000000000003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06032  ISXo5 transposase  32.5 
 
 
338 aa  73.2  0.000000000003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.978605  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06250  ISXo5 transposase  32.5 
 
 
338 aa  72.8  0.000000000003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  hitchhiker  0.00625171  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_05836  ISXo5 transposase  32.5 
 
 
338 aa  72.8  0.000000000003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.979452  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06059  ISXo5 transposase  32.5 
 
 
338 aa  72.8  0.000000000003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  hitchhiker  0.000704128  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04595  ISXo5 transposase  32.5 
 
 
338 aa  72.8  0.000000000003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03353  ISXo5 transposase  32.5 
 
 
338 aa  73.2  0.000000000003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03214  ISXo5 transposase  32.5 
 
 
338 aa  72.8  0.000000000003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03780  ISXo5 transposase  32.5 
 
 
338 aa  72.8  0.000000000003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03976  ISXo5 transposase  32.5 
 
 
338 aa  72.8  0.000000000003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.84431  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04081  ISXo5 transposase  32.5 
 
 
338 aa  72.8  0.000000000003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03695  ISXo5 transposase  32.5 
 
 
338 aa  72.8  0.000000000003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04330  ISXo5 transposase  32.5 
 
 
338 aa  72.8  0.000000000003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  hitchhiker  0.00000810616  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03338  ISXo5 transposase  32.5 
 
 
338 aa  73.2  0.000000000003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00429  ISXo5 transposase  32.5 
 
 
338 aa  72.8  0.000000000003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.901373  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00868  ISXo5 transposase  32.5 
 
 
338 aa  72.8  0.000000000003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.16246  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00947  ISXo5 transposase  32.5 
 
 
338 aa  72.8  0.000000000003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  hitchhiker  0.0000842303  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01069  ISXo5 transposase  32.5 
 
 
338 aa  72.8  0.000000000003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.168183  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01807  ISXo5 transposase  32.5 
 
 
338 aa  72.8  0.000000000003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.156782  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03664  ISXo5 transposase  32.5 
 
 
338 aa  72.8  0.000000000003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01857  ISXo5 transposase  32.5 
 
 
338 aa  72.8  0.000000000003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01870  ISXo5 transposase  32.5 
 
 
338 aa  73.2  0.000000000003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01918  ISXo5 transposase  32.5 
 
 
338 aa  72.8  0.000000000003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.684506  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02023  ISXo5 transposase  32.5 
 
 
338 aa  72.8  0.000000000003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.273323  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02455  ISXo5 transposase  32.5 
 
 
338 aa  72.8  0.000000000003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02591  ISXo5 transposase  32.5 
 
 
338 aa  72.8  0.000000000003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.317416  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02593  ISXo5 transposase  32.5 
 
 
338 aa  72.8  0.000000000003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02617  ISXo5 transposase  32.5 
 
 
338 aa  72.8  0.000000000003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02971  ISXo5 transposase  32.5 
 
 
338 aa  72.8  0.000000000003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02993  ISXo5 transposase  32.5 
 
 
338 aa  72.8  0.000000000003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.528498  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02567  transposase  32.5 
 
 
277 aa  72.4  0.000000000004  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01491  transposase  32.5 
 
 
277 aa  72.4  0.000000000005  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3333  hypothetical protein  37.61 
 
 
338 aa  71.6  0.000000000006  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.664615  n/a   
 
 
-
 
NC_009469  Acry_3539  hypothetical protein  37.61 
 
 
338 aa  71.6  0.000000000006  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0781  hypothetical protein  37.61 
 
 
338 aa  71.6  0.000000000006  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2206  hypothetical protein  37.61 
 
 
338 aa  71.6  0.000000000006  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.48827  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03597  ISXo5 transposase  32.5 
 
 
338 aa  71.6  0.000000000007  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03367  ISXo5 transposase  32.5 
 
 
338 aa  71.6  0.000000000007  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  hitchhiker  0.00000000263373  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00040  ISXo5 transposase  32.5 
 
 
338 aa  71.6  0.000000000007  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.765513  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01725  ISXo5 transposase  31.67 
 
 
338 aa  71.6  0.000000000007  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03228  ISXo5 transposase  31.67 
 
 
338 aa  70.5  0.00000000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03119  ISXo5 transposase  31.67 
 
 
338 aa  70.9  0.00000000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02702  ISXo5 transposase  31.67 
 
 
338 aa  68.2  0.00000000008  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.222301  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1424  hypothetical protein  44 
 
 
184 aa  67.8  0.0000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>