35 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpal_4700 on replicon NC_011004
Organism: Rhodopseudomonas palustris TIE-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011004  Rpal_4700  hypothetical protein  100 
 
 		 219 aa  444  1.0000000000000001e-124  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.574193  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1392  hypothetical protein  61.09 
 
 		 215 aa  241  3.9999999999999997e-63  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.655126  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1372  hypothetical protein  59.21 
 
 		 221 aa  236  2e-61  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.425718  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4024  hypothetical protein  56.68 
 
 		 226 aa  223  2e-57  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.70749  normal  0.220156 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6994  hypothetical protein  50.48 
 
 		 218 aa  201  8e-51  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.57852  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4859  hypothetical protein  40.53 
 
 		 267 aa  135  7.000000000000001e-31  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.511326 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0954  hypothetical protein  44.17 
 
 		 267 aa  129  4.0000000000000003e-29  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0846  hypothetical protein  41.98 
 
 		 268 aa  127  1.0000000000000001e-28  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5206  hypothetical protein  40.35 
 
 		 248 aa  125  5e-28  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.596261  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7361  hypothetical protein  43.59 
 
 		 277 aa  118  6e-26  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3483  hypothetical protein  40.48 
 
 		 220 aa  111  7.000000000000001e-24  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.765061 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4721  hypothetical protein  32.95 
 
 		 411 aa  92.8  3e-18  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.0431186 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0132  hypothetical protein  36.2 
 
 		 370 aa  79.3  0.00000000000004  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2206  hypothetical protein  38.74 
 
 		 389 aa  74.3  0.000000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1641  hypothetical protein  33.1 
 
 		 344 aa  72.4  0.000000000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0531921  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1226  hypothetical protein  31.69 
 
 		 363 aa  72.8  0.000000000004  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3376  hypothetical protein  35.25 
 
 		 383 aa  71.2  0.00000000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.0915509 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1486  hypothetical protein  36.15 
 
 		 370 aa  69.7  0.00000000003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.2007  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2063  hypothetical protein  34.64 
 
 		 381 aa  69.7  0.00000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.80257  normal  0.561686 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3496  hypothetical protein  35.37 
 
 		 392 aa  68.9  0.00000000006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0456  hypothetical protein  35.4 
 
 		 368 aa  67.4  0.0000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.903333  normal  0.0155871 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5568  hypothetical protein  35.34 
 
 		 357 aa  65.9  0.0000000004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2084  hypothetical protein  33.61 
 
 		 399 aa  63.5  0.000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.413022 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1888  hypothetical protein  32.59 
 
 		 390 aa  63.9  0.000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2729  hypothetical protein  30.43 
 
 		 316 aa  61.2  0.00000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0839286 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5290  hypothetical protein  31.86 
 
 		 366 aa  60.8  0.00000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.166591  normal  0.774539 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4748  hypothetical protein  34.21 
 
 		 366 aa  59.7  0.00000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  decreased coverage  0.00502344  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5215  hypothetical protein  34.86 
 
 		 366 aa  59.7  0.00000004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.122553  normal  0.16684 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3675  hypothetical protein  36.47 
 
 		 433 aa  54.7  0.000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  hitchhiker  0.00960143  normal  0.0655925 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1561  putative signal peptide protein  39.19 
 
 		 377 aa  53.9  0.000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.385818  normal  0.406873 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2209  hypothetical protein  35.71 
 
 		 366 aa  52.4  0.000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0305153  normal  0.169215 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1995  hypothetical protein  33.03 
 
 		 363 aa  52  0.000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.842489 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2902  hypothetical protein  27.91 
 
 		 343 aa  45.8  0.0005  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3128  hypothetical protein  27.13 
 
 		 342 aa  43.9  0.002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.339418  normal  0.299594 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3025  hypothetical protein  28.12 
 
 		 342 aa  42  0.006  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0349628  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>