28 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg2_1995 on replicon NC_011369
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011369  Rleg2_1995  hypothetical protein  100 
 
 		 363 aa  739    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.842489 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2209  hypothetical protein  88.46 
 
 		 366 aa  630  1e-179  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0305153  normal  0.169215 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1561  putative signal peptide protein  37.43 
 
 		 377 aa  216  4e-55  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.385818  normal  0.406873 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1888  hypothetical protein  33.83 
 
 		 390 aa  199  5e-50  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3496  hypothetical protein  31.5 
 
 		 392 aa  101  2e-20  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1226  hypothetical protein  27.59 
 
 		 363 aa  94.7  2e-18  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1486  hypothetical protein  27.53 
 
 		 370 aa  93.2  7e-18  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.2007  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2084  hypothetical protein  27.94 
 
 		 399 aa  87  5e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.413022 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2206  hypothetical protein  27.27 
 
 		 389 aa  86.3  9e-16  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2063  hypothetical protein  26.91 
 
 		 381 aa  83.2  0.000000000000006  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.80257  normal  0.561686 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3376  hypothetical protein  27.47 
 
 		 383 aa  79.7  0.00000000000008  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.0915509 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4721  hypothetical protein  26.84 
 
 		 411 aa  69.7  0.00000000007  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.0431186 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0132  hypothetical protein  25.97 
 
 		 370 aa  55.8  0.000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4700  hypothetical protein  32.74 
 
 		 219 aa  52.8  0.00001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.574193  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3675  hypothetical protein  35.63 
 
 		 433 aa  52.4  0.00001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  hitchhiker  0.00960143  normal  0.0655925 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4024  hypothetical protein  34.12 
 
 		 226 aa  51.6  0.00002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.70749  normal  0.220156 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3452  hypothetical protein  27.5 
 
 		 292 aa  50.1  0.00007  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.314474  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0954  hypothetical protein  34.88 
 
 		 267 aa  49.3  0.00009  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5568  hypothetical protein  34.72 
 
 		 357 aa  48.9  0.0001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6994  hypothetical protein  32.26 
 
 		 218 aa  49.3  0.0001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.57852  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1392  hypothetical protein  35.71 
 
 		 215 aa  49.3  0.0001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.655126  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4859  hypothetical protein  33.72 
 
 		 267 aa  47.8  0.0003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.511326 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1372  hypothetical protein  30.95 
 
 		 221 aa  47.4  0.0004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.425718  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1641  hypothetical protein  25.71 
 
 		 344 aa  47.4  0.0004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0531921  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0456  hypothetical protein  23.27 
 
 		 368 aa  47  0.0005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.903333  normal  0.0155871 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7361  hypothetical protein  32.18 
 
 		 277 aa  45.4  0.001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5206  hypothetical protein  32.56 
 
 		 248 aa  44.7  0.003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.596261  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3483  hypothetical protein  31.11 
 
 		 220 aa  43.1  0.008  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.765061 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>