36 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpal_2206 on replicon NC_011004
Organism: Rhodopseudomonas palustris TIE-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011004  Rpal_2206  hypothetical protein  100 
 
 		 389 aa  791    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3376  hypothetical protein  68.84 
 
 		 383 aa  523  1e-147  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.0915509 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2063  hypothetical protein  71.68 
 
 		 381 aa  521  1e-146  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.80257  normal  0.561686 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1486  hypothetical protein  65.37 
 
 		 370 aa  444  1e-123  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.2007  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1226  hypothetical protein  65.28 
 
 		 363 aa  433  1e-120  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2084  hypothetical protein  65.07 
 
 		 399 aa  430  1e-119  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.413022 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3496  hypothetical protein  58.99 
 
 		 392 aa  405  1.0000000000000001e-112  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4721  hypothetical protein  40.69 
 
 		 411 aa  218  2e-55  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.0431186 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3675  hypothetical protein  28.41 
 
 		 433 aa  129  6e-29  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  hitchhiker  0.00960143  normal  0.0655925 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1561  putative signal peptide protein  29.21 
 
 		 377 aa  124  4e-27  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.385818  normal  0.406873 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0132  hypothetical protein  30.22 
 
 		 370 aa  118  1.9999999999999998e-25  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5290  hypothetical protein  30.83 
 
 		 366 aa  117  3e-25  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.166591  normal  0.774539 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4748  hypothetical protein  29.41 
 
 		 366 aa  116  6e-25  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  decreased coverage  0.00502344  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5215  hypothetical protein  28.24 
 
 		 366 aa  112  8.000000000000001e-24  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.122553  normal  0.16684 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5568  hypothetical protein  28.87 
 
 		 357 aa  111  2.0000000000000002e-23  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1888  hypothetical protein  29.95 
 
 		 390 aa  108  2e-22  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1641  hypothetical protein  27.75 
 
 		 344 aa  107  5e-22  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0531921  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0456  hypothetical protein  28.01 
 
 		 368 aa  99.4  1e-19  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.903333  normal  0.0155871 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1995  hypothetical protein  27.83 
 
 		 363 aa  95.1  2e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.842489 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2209  hypothetical protein  27.19 
 
 		 366 aa  92.8  9e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0305153  normal  0.169215 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6994  hypothetical protein  33.33 
 
 		 218 aa  78.6  0.0000000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.57852  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1372  hypothetical protein  38.39 
 
 		 221 aa  78.6  0.0000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.425718  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4024  hypothetical protein  41.9 
 
 		 226 aa  77  0.0000000000006  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.70749  normal  0.220156 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1392  hypothetical protein  36.51 
 
 		 215 aa  77  0.0000000000006  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.655126  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3483  hypothetical protein  32.14 
 
 		 220 aa  75.1  0.000000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.765061 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4700  hypothetical protein  38.74 
 
 		 219 aa  74.3  0.000000000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.574193  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5206  hypothetical protein  33.64 
 
 		 248 aa  60.8  0.00000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.596261  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2729  hypothetical protein  39.33 
 
 		 316 aa  60.1  0.00000007  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0839286 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4859  hypothetical protein  35.14 
 
 		 267 aa  59.7  0.00000009  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.511326 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7361  hypothetical protein  34.51 
 
 		 277 aa  59.7  0.0000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0954  hypothetical protein  35.19 
 
 		 267 aa  59.3  0.0000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0846  hypothetical protein  33.33 
 
 		 268 aa  53.9  0.000005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2902  hypothetical protein  31.09 
 
 		 343 aa  52  0.00002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3025  hypothetical protein  30.51 
 
 		 342 aa  49.3  0.0001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0349628  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3128  hypothetical protein  31.09 
 
 		 342 aa  49.3  0.0001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.339418  normal  0.299594 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0400  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  26.99 
 
 		 843 aa  44.3  0.003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00170819 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>