29 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpop_5290 on replicon NC_010725
Organism: Methylobacterium populi BJ001



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010725  Mpop_5290  hypothetical protein  100 
 
 		 366 aa  736    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.166591  normal  0.774539 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4748  hypothetical protein  82.31 
 
 		 366 aa  575  1.0000000000000001e-163  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  decreased coverage  0.00502344  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5215  hypothetical protein  82.31 
 
 		 366 aa  554  1e-157  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.122553  normal  0.16684 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5568  hypothetical protein  62.78 
 
 		 357 aa  352  8.999999999999999e-96  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1641  hypothetical protein  59.27 
 
 		 344 aa  331  1e-89  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0531921  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0456  hypothetical protein  57.7 
 
 		 368 aa  327  2.0000000000000001e-88  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.903333  normal  0.0155871 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3675  hypothetical protein  35.02 
 
 		 433 aa  130  3e-29  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  hitchhiker  0.00960143  normal  0.0655925 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2063  hypothetical protein  27.91 
 
 		 381 aa  119  7e-26  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.80257  normal  0.561686 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2206  hypothetical protein  29.59 
 
 		 389 aa  115  8.999999999999998e-25  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3376  hypothetical protein  28.96 
 
 		 383 aa  115  1.0000000000000001e-24  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.0915509 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4721  hypothetical protein  30.11 
 
 		 411 aa  115  2.0000000000000002e-24  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.0431186 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2084  hypothetical protein  26.85 
 
 		 399 aa  108  2e-22  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.413022 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0132  hypothetical protein  32.57 
 
 		 370 aa  105  1e-21  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1226  hypothetical protein  26.97 
 
 		 363 aa  103  4e-21  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1486  hypothetical protein  26.96 
 
 		 370 aa  100  3e-20  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.2007  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3496  hypothetical protein  28.46 
 
 		 392 aa  98.2  2e-19  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0954  hypothetical protein  39.56 
 
 		 267 aa  67  0.0000000005  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1888  hypothetical protein  36.43 
 
 		 390 aa  63.9  0.000000005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1561  putative signal peptide protein  26.79 
 
 		 377 aa  63.2  0.000000007  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.385818  normal  0.406873 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1392  hypothetical protein  29.86 
 
 		 215 aa  62.4  0.00000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.655126  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4700  hypothetical protein  31.36 
 
 		 219 aa  61.2  0.00000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.574193  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5206  hypothetical protein  29.38 
 
 		 248 aa  61.2  0.00000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.596261  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4024  hypothetical protein  32.87 
 
 		 226 aa  61.2  0.00000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.70749  normal  0.220156 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1372  hypothetical protein  30.22 
 
 		 221 aa  60.8  0.00000004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.425718  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3483  hypothetical protein  28.57 
 
 		 220 aa  57.8  0.0000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.765061 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4859  hypothetical protein  35.56 
 
 		 267 aa  57  0.0000005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.511326 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0846  hypothetical protein  32.48 
 
 		 268 aa  56.2  0.0000008  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6994  hypothetical protein  31.15 
 
 		 218 aa  54.7  0.000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.57852  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7361  hypothetical protein  35 
 
 		 277 aa  52.4  0.00001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>