33 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avi_1888 on replicon NC_011989
Organism: Agrobacterium vitis S4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011989  Avi_1888  hypothetical protein  100 
 
 		 390 aa  796    Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2209  hypothetical protein  35.68 
 
 		 366 aa  201  1.9999999999999998e-50  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0305153  normal  0.169215 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1995  hypothetical protein  33.94 
 
 		 363 aa  198  1.0000000000000001e-49  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.842489 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1561  putative signal peptide protein  34.4 
 
 		 377 aa  194  2e-48  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.385818  normal  0.406873 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3376  hypothetical protein  29.41 
 
 		 383 aa  106  8e-22  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.0915509 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2063  hypothetical protein  31.17 
 
 		 381 aa  104  2e-21  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.80257  normal  0.561686 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1486  hypothetical protein  29.05 
 
 		 370 aa  102  1e-20  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.2007  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1226  hypothetical protein  28.7 
 
 		 363 aa  100  4e-20  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2206  hypothetical protein  28.84 
 
 		 389 aa  97.1  4e-19  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3496  hypothetical protein  31.06 
 
 		 392 aa  94.4  3e-18  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2084  hypothetical protein  27.41 
 
 		 399 aa  81.6  0.00000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.413022 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4721  hypothetical protein  44.44 
 
 		 411 aa  70.9  0.00000000004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.0431186 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5568  hypothetical protein  36.92 
 
 		 357 aa  64.3  0.000000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4700  hypothetical protein  32.59 
 
 		 219 aa  63.2  0.000000008  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.574193  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6994  hypothetical protein  34.43 
 
 		 218 aa  62.8  0.000000009  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.57852  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1392  hypothetical protein  36.84 
 
 		 215 aa  62.8  0.00000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.655126  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5290  hypothetical protein  36.43 
 
 		 366 aa  62.8  0.00000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.166591  normal  0.774539 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4024  hypothetical protein  35.48 
 
 		 226 aa  61.2  0.00000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.70749  normal  0.220156 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1372  hypothetical protein  32.35 
 
 		 221 aa  61.2  0.00000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.425718  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0954  hypothetical protein  36.46 
 
 		 267 aa  60.5  0.00000005  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0456  hypothetical protein  40.66 
 
 		 368 aa  58.9  0.0000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.903333  normal  0.0155871 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0132  hypothetical protein  40.79 
 
 		 370 aa  59.3  0.0000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5215  hypothetical protein  33.33 
 
 		 366 aa  57.8  0.0000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.122553  normal  0.16684 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4748  hypothetical protein  32.52 
 
 		 366 aa  57  0.0000006  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  decreased coverage  0.00502344  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3675  hypothetical protein  41.56 
 
 		 433 aa  55.8  0.000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  hitchhiker  0.00960143  normal  0.0655925 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1641  hypothetical protein  38.46 
 
 		 344 aa  56.2  0.000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0531921  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5206  hypothetical protein  33.33 
 
 		 248 aa  55.5  0.000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.596261  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0846  hypothetical protein  35.42 
 
 		 268 aa  54.3  0.000004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3483  hypothetical protein  33.33 
 
 		 220 aa  52.4  0.00001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.765061 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7361  hypothetical protein  31.87 
 
 		 277 aa  50.1  0.00006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4859  hypothetical protein  30.77 
 
 		 267 aa  48.5  0.0002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.511326 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3452  hypothetical protein  33.91 
 
 		 292 aa  47.4  0.0004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.314474  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2729  hypothetical protein  39.42 
 
 		 316 aa  47  0.0006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0839286 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>