29 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg_2209 on replicon NC_012850
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012850  Rleg_2209  hypothetical protein  100 
 
 		 366 aa  746    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0305153  normal  0.169215 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1995  hypothetical protein  88.46 
 
 		 363 aa  637    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.842489 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1561  putative signal peptide protein  37.8 
 
 		 377 aa  221  1.9999999999999999e-56  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.385818  normal  0.406873 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1888  hypothetical protein  35.5 
 
 		 390 aa  202  6e-51  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3496  hypothetical protein  30.45 
 
 		 392 aa  97.1  4e-19  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1226  hypothetical protein  26 
 
 		 363 aa  91.3  2e-17  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1486  hypothetical protein  26.16 
 
 		 370 aa  87.8  3e-16  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.2007  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2206  hypothetical protein  26.67 
 
 		 389 aa  81.3  0.00000000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2063  hypothetical protein  25.71 
 
 		 381 aa  77.8  0.0000000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.80257  normal  0.561686 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2084  hypothetical protein  25.97 
 
 		 399 aa  76.6  0.0000000000006  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.413022 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3376  hypothetical protein  26.21 
 
 		 383 aa  74.7  0.000000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.0915509 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4721  hypothetical protein  29.71 
 
 		 411 aa  73.6  0.000000000005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.0431186 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0132  hypothetical protein  28.57 
 
 		 370 aa  55.5  0.000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3675  hypothetical protein  34.88 
 
 		 433 aa  54.7  0.000003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  hitchhiker  0.00960143  normal  0.0655925 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4700  hypothetical protein  32.74 
 
 		 219 aa  53.1  0.000007  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.574193  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4024  hypothetical protein  34.12 
 
 		 226 aa  53.1  0.000007  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.70749  normal  0.220156 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0954  hypothetical protein  36.05 
 
 		 267 aa  53.1  0.000008  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1392  hypothetical protein  36.9 
 
 		 215 aa  52  0.00001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.655126  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6994  hypothetical protein  34.41 
 
 		 218 aa  52  0.00002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.57852  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4859  hypothetical protein  34.88 
 
 		 267 aa  50.8  0.00003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.511326 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1372  hypothetical protein  31.68 
 
 		 221 aa  50.8  0.00004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.425718  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7361  hypothetical protein  33.33 
 
 		 277 aa  48.5  0.0002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5206  hypothetical protein  33.33 
 
 		 248 aa  47.4  0.0004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.596261  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3483  hypothetical protein  29.86 
 
 		 220 aa  47.4  0.0005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.765061 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5568  hypothetical protein  32.88 
 
 		 357 aa  47  0.0005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1641  hypothetical protein  28.95 
 
 		 344 aa  45.8  0.001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0531921  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3452  hypothetical protein  26.11 
 
 		 292 aa  45.4  0.002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.314474  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0846  hypothetical protein  32.18 
 
 		 268 aa  44.3  0.003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0456  hypothetical protein  27.27 
 
 		 368 aa  43.9  0.005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.903333  normal  0.0155871 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>