34 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPB_1392 on replicon NC_007778
Organism: Rhodopseudomonas palustris HaA2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007778  RPB_1392  hypothetical protein  100 
 
 		 215 aa  433  1e-121  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.655126  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1372  hypothetical protein  79.19 
 
 		 221 aa  356  1.9999999999999998e-97  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.425718  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4024  hypothetical protein  59.19 
 
 		 226 aa  247  8e-65  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.70749  normal  0.220156 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4700  hypothetical protein  61.09 
 
 		 219 aa  240  9e-63  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.574193  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6994  hypothetical protein  62.76 
 
 		 218 aa  235  4e-61  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.57852  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4859  hypothetical protein  42.86 
 
 		 267 aa  138  6e-32  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.511326 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0954  hypothetical protein  41.18 
 
 		 267 aa  129  4.0000000000000003e-29  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5206  hypothetical protein  42.77 
 
 		 248 aa  127  2.0000000000000002e-28  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.596261  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3483  hypothetical protein  45.06 
 
 		 220 aa  126  3e-28  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.765061 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0846  hypothetical protein  45 
 
 		 268 aa  122  3e-27  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7361  hypothetical protein  44.44 
 
 		 277 aa  111  9e-24  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4721  hypothetical protein  34.09 
 
 		 411 aa  87.4  1e-16  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.0431186 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1226  hypothetical protein  35.07 
 
 		 363 aa  82.4  0.000000000000005  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3376  hypothetical protein  36.75 
 
 		 383 aa  75.9  0.0000000000005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.0915509 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1486  hypothetical protein  36.09 
 
 		 370 aa  75.5  0.0000000000006  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.2007  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2063  hypothetical protein  33.58 
 
 		 381 aa  75.1  0.0000000000008  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.80257  normal  0.561686 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2206  hypothetical protein  36.61 
 
 		 389 aa  74.7  0.000000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3496  hypothetical protein  39.82 
 
 		 392 aa  72.8  0.000000000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1641  hypothetical protein  33.58 
 
 		 344 aa  72.8  0.000000000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0531921  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0456  hypothetical protein  33.07 
 
 		 368 aa  71.2  0.00000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.903333  normal  0.0155871 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2084  hypothetical protein  33.33 
 
 		 399 aa  69.7  0.00000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.413022 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2729  hypothetical protein  33.62 
 
 		 316 aa  65.1  0.0000000008  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0839286 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5568  hypothetical protein  31.01 
 
 		 357 aa  63.9  0.000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1888  hypothetical protein  37 
 
 		 390 aa  63.5  0.000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4748  hypothetical protein  29.93 
 
 		 366 aa  63.2  0.000000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  decreased coverage  0.00502344  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5215  hypothetical protein  30.28 
 
 		 366 aa  62.4  0.000000005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.122553  normal  0.16684 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5290  hypothetical protein  29.58 
 
 		 366 aa  61.2  0.00000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.166591  normal  0.774539 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0132  hypothetical protein  32.69 
 
 		 370 aa  61.2  0.00000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3675  hypothetical protein  38.82 
 
 		 433 aa  59.3  0.00000004  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  hitchhiker  0.00960143  normal  0.0655925 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1561  putative signal peptide protein  41.33 
 
 		 377 aa  53.5  0.000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.385818  normal  0.406873 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2209  hypothetical protein  35.71 
 
 		 366 aa  51.6  0.000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0305153  normal  0.169215 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1995  hypothetical protein  33.04 
 
 		 363 aa  49.3  0.00004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.842489 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2902  hypothetical protein  31.45 
 
 		 343 aa  46.2  0.0004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3128  hypothetical protein  28.23 
 
 		 342 aa  43.5  0.002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.339418  normal  0.299594 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>