31 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mnod_1641 on replicon NC_011894
Organism: Methylobacterium nodulans ORS 2060



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011894  Mnod_1641  hypothetical protein  100 
 
 		 344 aa  681    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0531921  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0456  hypothetical protein  84.35 
 
 		 368 aa  518  1e-146  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.903333  normal  0.0155871 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4748  hypothetical protein  58.11 
 
 		 366 aa  328  8e-89  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  decreased coverage  0.00502344  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5290  hypothetical protein  60.34 
 
 		 366 aa  324  1e-87  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.166591  normal  0.774539 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5568  hypothetical protein  58.75 
 
 		 357 aa  321  9.999999999999999e-87  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5215  hypothetical protein  58.11 
 
 		 366 aa  318  1e-85  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.122553  normal  0.16684 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3675  hypothetical protein  32.88 
 
 		 433 aa  123  4e-27  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  hitchhiker  0.00960143  normal  0.0655925 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1226  hypothetical protein  29.03 
 
 		 363 aa  119  6e-26  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1486  hypothetical protein  28.69 
 
 		 370 aa  116  5e-25  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.2007  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4721  hypothetical protein  28.72 
 
 		 411 aa  116  6e-25  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.0431186 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0132  hypothetical protein  30.69 
 
 		 370 aa  112  1.0000000000000001e-23  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2084  hypothetical protein  27.02 
 
 		 399 aa  106  7e-22  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.413022 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2063  hypothetical protein  26.63 
 
 		 381 aa  103  6e-21  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.80257  normal  0.561686 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2206  hypothetical protein  28.01 
 
 		 389 aa  96.7  5e-19  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3376  hypothetical protein  26.92 
 
 		 383 aa  93.6  4e-18  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.0915509 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3496  hypothetical protein  27.89 
 
 		 392 aa  91.3  2e-17  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1372  hypothetical protein  33.83 
 
 		 221 aa  74.7  0.000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.425718  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4700  hypothetical protein  33.1 
 
 		 219 aa  73.2  0.000000000007  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.574193  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4024  hypothetical protein  36.03 
 
 		 226 aa  72.4  0.00000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.70749  normal  0.220156 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1392  hypothetical protein  33.06 
 
 		 215 aa  72  0.00000000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.655126  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3483  hypothetical protein  32.14 
 
 		 220 aa  68.2  0.0000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.765061 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6994  hypothetical protein  31.09 
 
 		 218 aa  62.8  0.000000009  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.57852  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0954  hypothetical protein  40 
 
 		 267 aa  62  0.00000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5206  hypothetical protein  36.84 
 
 		 248 aa  62  0.00000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.596261  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1888  hypothetical protein  38.46 
 
 		 390 aa  57  0.0000005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0846  hypothetical protein  34.21 
 
 		 268 aa  55.8  0.000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4859  hypothetical protein  37.08 
 
 		 267 aa  55.8  0.000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.511326 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1561  putative signal peptide protein  32.91 
 
 		 377 aa  49.7  0.00007  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.385818  normal  0.406873 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7361  hypothetical protein  30.51 
 
 		 277 aa  48.9  0.0001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1995  hypothetical protein  25.82 
 
 		 363 aa  47  0.0005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.842489 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2209  hypothetical protein  28.95 
 
 		 366 aa  45.8  0.001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0305153  normal  0.169215 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>