29 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mext_2902 on replicon NC_010172
Organism: Methylobacterium extorquens PA1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010172  Mext_2902  hypothetical protein  100 
 
 		 343 aa  672    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3128  hypothetical protein  94.75 
 
 		 342 aa  604  9.999999999999999e-173  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.339418  normal  0.299594 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3025  hypothetical protein  70.85 
 
 		 342 aa  417  1e-116  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0349628  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2729  hypothetical protein  40 
 
 		 316 aa  122  9.999999999999999e-27  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0839286 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4721  hypothetical protein  31.3 
 
 		 411 aa  74.7  0.000000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.0431186 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3483  hypothetical protein  32.05 
 
 		 220 aa  67.8  0.0000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.765061 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0132  hypothetical protein  35.25 
 
 		 370 aa  67  0.0000000004  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3675  hypothetical protein  31.78 
 
 		 433 aa  64.7  0.000000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  hitchhiker  0.00960143  normal  0.0655925 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1486  hypothetical protein  31.9 
 
 		 370 aa  65.1  0.000000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.2007  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3496  hypothetical protein  34.48 
 
 		 392 aa  64.3  0.000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2084  hypothetical protein  30.09 
 
 		 399 aa  63.5  0.000000005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.413022 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6994  hypothetical protein  33.33 
 
 		 218 aa  62.4  0.00000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.57852  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2206  hypothetical protein  31.3 
 
 		 389 aa  61.2  0.00000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1226  hypothetical protein  32.2 
 
 		 363 aa  59.7  0.00000008  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7361  hypothetical protein  31.54 
 
 		 277 aa  58.5  0.0000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4700  hypothetical protein  27.91 
 
 		 219 aa  59.3  0.0000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.574193  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3376  hypothetical protein  28.57 
 
 		 383 aa  57.8  0.0000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.0915509 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1372  hypothetical protein  29.69 
 
 		 221 aa  57.4  0.0000004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.425718  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2063  hypothetical protein  30.25 
 
 		 381 aa  56.6  0.0000007  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.80257  normal  0.561686 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1561  putative signal peptide protein  38.78 
 
 		 377 aa  55.8  0.000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.385818  normal  0.406873 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1392  hypothetical protein  28.45 
 
 		 215 aa  55.1  0.000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.655126  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5568  hypothetical protein  30.43 
 
 		 357 aa  54.7  0.000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4024  hypothetical protein  30.51 
 
 		 226 aa  50.8  0.00003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.70749  normal  0.220156 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5206  hypothetical protein  32.2 
 
 		 248 aa  50.1  0.00005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.596261  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0954  hypothetical protein  31.9 
 
 		 267 aa  49.3  0.0001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4859  hypothetical protein  32.77 
 
 		 267 aa  48.9  0.0001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.511326 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5215  hypothetical protein  31.01 
 
 		 366 aa  48.5  0.0002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.122553  normal  0.16684 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4748  hypothetical protein  31.01 
 
 		 366 aa  48.5  0.0002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  decreased coverage  0.00502344  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0846  hypothetical protein  29.66 
 
 		 268 aa  45.1  0.002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>