273 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmet_0122 on replicon NC_007973
Organism: Cupriavidus metallidurans CH34



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007973  Rmet_0122  GCN5-related N-acetyltransferase  100 
 
 
183 aa  379  1e-104  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.420596 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1764  GCN5-related N-acetyltransferase  43.75 
 
 
182 aa  159  2e-38  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4508  GCN5-related N-acetyltransferase  45.88 
 
 
190 aa  149  2e-35  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.256059  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1730  GCN5-related N-acetyltransferase  45.45 
 
 
181 aa  145  2.0000000000000003e-34  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.170022  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1479  putative ribosomal-protein-serine acetyltransferase  35.54 
 
 
178 aa  107  1e-22  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.298398  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003996  putative ribosomal-protein-serine acetyltransferase  35.17 
 
 
182 aa  102  4e-21  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.69551  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01526  hypothetical protein  33.56 
 
 
182 aa  102  4e-21  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2901  GCN5-related N-acetyltransferase  25.73 
 
 
192 aa  77.4  0.0000000000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0400  GCN5-related N-acetyltransferase  25.29 
 
 
181 aa  76.3  0.0000000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0390  GCN5-related N-acetyltransferase  25.29 
 
 
181 aa  76.3  0.0000000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2034  GCN5-related N-acetyltransferase  28.18 
 
 
198 aa  74.7  0.0000000000007  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.00000135176  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0241  GCN5-related N-acetyltransferase  30.77 
 
 
210 aa  73.6  0.000000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0622  GCN5-related N-acetyltransferase  32.14 
 
 
194 aa  73.2  0.000000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1833  putative ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  33.77 
 
 
194 aa  72.4  0.000000000003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0482  GCN5-related N-acetyltransferase  33.77 
 
 
194 aa  72.4  0.000000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.15117  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4313  GCN5-related N-acetyltransferase  31.03 
 
 
193 aa  72.4  0.000000000004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1456  ribosomal-protein-serine acetyltransferase  35.64 
 
 
177 aa  69.3  0.00000000003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2506  acetyltransferase-like  25.73 
 
 
191 aa  68.9  0.00000000004  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.219044  normal  0.689211 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0311  acetyltransferase related protein  23.43 
 
 
188 aa  67.8  0.00000000008  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3126  acetyltransferase  31.9 
 
 
181 aa  66.6  0.0000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.731723  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3425  acetyltransferase, gnat family  31.9 
 
 
182 aa  66.6  0.0000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3672  putative acetyltransferase  30.07 
 
 
193 aa  65.9  0.0000000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.112681  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3372  GCN5-related N-acetyltransferase  28.33 
 
 
202 aa  65.1  0.0000000005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.351729  normal  0.46007 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3435  acetyltransferase  31.29 
 
 
182 aa  65.1  0.0000000006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.00643707  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1148  GCN5-related N-acetyltransferase  28.3 
 
 
194 aa  64.7  0.0000000007  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3147  GCN5-related N-acetyltransferase  30.72 
 
 
194 aa  63.9  0.000000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.750296 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0475  GCN5-related N-acetyltransferase  28.49 
 
 
179 aa  63.5  0.000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1763  GCN5-related N-acetyltransferase  23.39 
 
 
180 aa  62.8  0.000000002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.766793  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1896  GCN5-related N-acetyltransferase  27.33 
 
 
186 aa  61.6  0.000000006  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0485206  normal  0.78893 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4797  GCN5-related N-acetyltransferase  28.81 
 
 
195 aa  60.5  0.00000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2328  GCN5-related N-acetyltransferase  27.01 
 
 
196 aa  60.5  0.00000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.211341  normal  0.620155 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5702  GCN5-related N-acetyltransferase  25.44 
 
 
233 aa  60.5  0.00000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.384469 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2015  GCN5-related N-acetyltransferase  25.29 
 
 
189 aa  59.7  0.00000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.684  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0700  GCN5-related N-acetyltransferase  19.54 
 
 
180 aa  60.1  0.00000002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.503047  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0140  GCN5-related N-acetyltransferase  22.75 
 
 
182 aa  58.5  0.00000006  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal  0.0185488 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1173  GCN5-related N-acetyltransferase  25.68 
 
 
195 aa  57.8  0.00000008  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6702  GCN5-related N-acetyltransferase  27.46 
 
 
177 aa  57.8  0.00000009  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3435  GCN5-related N-acetyltransferase  28.73 
 
 
191 aa  57.4  0.0000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0309618  normal  0.570602 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0903  acetyltransferase  23.19 
 
 
181 aa  57.4  0.0000001  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.975526  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0239  GCN5-related N-acetyltransferase  23.67 
 
 
180 aa  56.2  0.0000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5839  GCN5-related N-acetyltransferase  31.82 
 
 
216 aa  56.6  0.0000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0730862  normal  0.574858 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0841  putative ribosomal-protein-alanine N-acetyltransferase  26.55 
 
 
195 aa  56.2  0.0000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.489337 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0310  GCN5-related N-acetyltransferase  23.5 
 
 
203 aa  56.6  0.0000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0909  GCN5-related N-acetyltransferase  29.78 
 
 
195 aa  56.6  0.0000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.665646  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0680  GCN5-related N-acetyltransferase  25 
 
 
184 aa  57  0.0000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.0000882021  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2808  GCN5-related N-acetyltransferase  29.58 
 
 
180 aa  56.2  0.0000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.189362  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0597  GCN5-related N-acetyltransferase  26.99 
 
 
206 aa  55.8  0.0000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.310523  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3728  GCN5-related N-acetyltransferase  25.49 
 
 
205 aa  55.5  0.0000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.385619  normal  0.545549 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4567  GCN5-related N-acetyltransferase  25.49 
 
 
205 aa  55.5  0.0000005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3796  GCN5-related N-acetyltransferase  25.49 
 
 
205 aa  55.5  0.0000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.351975  normal  0.211845 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0824  GCN5-related N-acetyltransferase  27.68 
 
 
195 aa  55.1  0.0000006  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.202101 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1789  GCN5-related N-acetyltransferase  26.51 
 
 
182 aa  54.7  0.0000007  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0166942  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1985  GCN5-related N-acetyltransferase  24.02 
 
 
182 aa  54.3  0.0000009  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.966311 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0992  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  25.7 
 
 
181 aa  53.9  0.000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_41970  GCN5-related N-acetyltransferase  31.25 
 
 
211 aa  53.9  0.000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0264  GCN5-related N-acetyltransferase  27.12 
 
 
194 aa  53.9  0.000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0083  GCN5-related N-acetyltransferase  26.74 
 
 
176 aa  53.9  0.000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0457106  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1509  GCN5-related N-acetyltransferase  26.06 
 
 
185 aa  53.5  0.000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3026  GCN5-related N-acetyltransferase  22.52 
 
 
187 aa  53.5  0.000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3348  GCN5-related N-acetyltransferase  23.86 
 
 
182 aa  53.5  0.000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.345211  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3391  GCN5-related N-acetyltransferase  25.43 
 
 
183 aa  53.1  0.000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5083  GCN5-related N-acetyltransferase  29.68 
 
 
195 aa  52.4  0.000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.596364  normal  0.591106 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1823  GCN5-related N-acetyltransferase  25 
 
 
185 aa  52.8  0.000003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_32870  acetyltransferase, ribosomal protein N-acetylase  26.79 
 
 
178 aa  52.8  0.000003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.439449  normal  0.189376 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1733  GCN5-related N-acetyltransferase  30 
 
 
176 aa  52.4  0.000004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.321693  hitchhiker  0.00320787 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4320  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  26.47 
 
 
181 aa  52.4  0.000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0692  GCN5-related N-acetyltransferase  27.42 
 
 
210 aa  52.4  0.000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0892137 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3526  GCN5-related N-acetyltransferase  26.99 
 
 
212 aa  52.4  0.000004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.140052  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0766  GCN5-related N-acetyltransferase  35.9 
 
 
202 aa  52.4  0.000004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2496  GCN5-related N-acetyltransferase  29.33 
 
 
193 aa  51.6  0.000006  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2226  GCN5-related N-acetyltransferase  26.06 
 
 
192 aa  51.2  0.000008  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.459408  hitchhiker  0.00554726 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2197  GCN5-related N-acetyltransferase  27.44 
 
 
184 aa  51.2  0.000008  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.963489 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0633  GCN5-related N-acetyltransferase  26.92 
 
 
204 aa  51.2  0.000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.0805493 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4576  GCN5-related N-acetyltransferase  26.55 
 
 
195 aa  51.2  0.000009  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8007  GCN5-related N-acetyltransferase  26.09 
 
 
187 aa  50.4  0.00001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0534  GCN5-related N-acetyltransferase  28.49 
 
 
203 aa  50.8  0.00001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.700744  normal  0.612185 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2204  GCN5-related N-acetyltransferase  24.73 
 
 
199 aa  50.4  0.00001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1253  GCN5-related N-acetyltransferase  26.14 
 
 
202 aa  50.8  0.00001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0231  GCN5-related N-acetyltransferase  27.78 
 
 
194 aa  50.8  0.00001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.394828  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3590  GCN5-related N-acetyltransferase  25.15 
 
 
185 aa  50.4  0.00001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.249758  normal  0.183758 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0207  acetyltransferase  18.37 
 
 
187 aa  50.4  0.00001  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.742792  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1501  GCN5-related N-acetyltransferase  26.06 
 
 
180 aa  50.4  0.00001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003301  GCN5-related N-acetyltransferase  23.78 
 
 
181 aa  50.8  0.00001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4642  GCN5-related N-acetyltransferase  39.66 
 
 
225 aa  50.4  0.00001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3008  acetyltransferase, GNAT family  29.66 
 
 
180 aa  49.7  0.00002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000400809 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3046  acetyltransferase  29.66 
 
 
180 aa  49.7  0.00002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0847366  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0694  GCN5-related N-acetyltransferase  29.25 
 
 
215 aa  50.1  0.00002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.720743 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2798  acetyltransferase  29.66 
 
 
180 aa  49.7  0.00002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.036966  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2729  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  29.66 
 
 
180 aa  49.7  0.00002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.776721  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3010  acetyltransferase  29.66 
 
 
180 aa  49.7  0.00002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001020  putative ribosomal protein N-acetyltransferase  30.22 
 
 
177 aa  50.1  0.00002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_21980  hypothetical protein  24 
 
 
183 aa  49.7  0.00002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000000214127 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4545  GCN5-related N-acetyltransferase  26.79 
 
 
189 aa  49.7  0.00002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3105  GCN5-related N-acetyltransferase  28.12 
 
 
177 aa  49.7  0.00003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2749  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  28.81 
 
 
180 aa  49.3  0.00003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000127055  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0785  GCN5-related N-acetyltransferase  24.18 
 
 
192 aa  49.3  0.00003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.931422  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5474  GCN5-related N-acetyltransferase  25.52 
 
 
190 aa  49.3  0.00003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.387077  normal  0.265431 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1073  ribosomal-protein (S5)-alanine N-acetyltransferase  29.21 
 
 
204 aa  49.3  0.00003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4665  acetyltransferase  18.86 
 
 
187 aa  48.9  0.00004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4036  GCN5-related N-acetyltransferase  30.06 
 
 
210 aa  48.9  0.00004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.357695  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>