20 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg_2588 on replicon NC_012850
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012850  Rleg_2588  hypothetical protein  100 
 
 
193 aa  386  1e-107  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.277418  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2263  hypothetical protein  90.1 
 
 
193 aa  345  3e-94  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.129186  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1337  hypothetical protein  65.45 
 
 
189 aa  250  7e-66  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.397563 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3343  dienelactone hydrolase  64.32 
 
 
200 aa  249  2e-65  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3453  hypothetical protein  65.98 
 
 
193 aa  244  8e-64  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000726577 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3724  dienelactone hydrolase  56.92 
 
 
196 aa  210  1e-53  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.535837  normal  0.412865 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_07080  dienelactone hydrolase-like enzyme  55.03 
 
 
193 aa  198  3.9999999999999996e-50  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.903512  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_07480  dienelactone hydrolase-like enzyme  43.43 
 
 
192 aa  145  3e-34  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.469925  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4107  dienelactone hydrolase  38.74 
 
 
188 aa  110  2.0000000000000002e-23  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1958  dienelactone hydrolase  39.38 
 
 
199 aa  101  6e-21  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4961  dienelactone hydrolase  36.51 
 
 
189 aa  90.5  1e-17  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008505  LACR_C28  dienelactone hydrolase family protein  22.61 
 
 
201 aa  66.2  0.0000000003  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0190  carboxymethylenebutenolidase  27.8 
 
 
230 aa  45.4  0.0005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1783  Carboxymethylenebutenolidase  27.04 
 
 
227 aa  44.7  0.0009  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0381  carboxymethylenebutenolidase  25.25 
 
 
291 aa  43.9  0.001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0203  carboxymethylenebutenolidase  27.32 
 
 
230 aa  43.9  0.001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.19899  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7175  putative carboxymethylenebutenolidase (dienelactone hydrolase)(DLH)  27.18 
 
 
410 aa  43.9  0.002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.887651  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2600  Carboxymethylenebutenolidase  31.93 
 
 
264 aa  42.7  0.003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0276  carboxymethylenebutenolidase  27.32 
 
 
230 aa  42.4  0.004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2831  carboxymethylenebutenolidase  27.32 
 
 
230 aa  42.4  0.004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>