16 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_3453 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013131  Caci_3453  hypothetical protein  100 
 
 
193 aa  382  1e-105  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000726577 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2588  hypothetical protein  65.98 
 
 
193 aa  244  8e-64  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.277418  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2263  hypothetical protein  65.97 
 
 
193 aa  240  1e-62  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.129186  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1337  hypothetical protein  61.78 
 
 
189 aa  227  1e-58  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.397563 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_07080  dienelactone hydrolase-like enzyme  58.73 
 
 
193 aa  205  3e-52  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.903512  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3343  dienelactone hydrolase  56.85 
 
 
200 aa  196  1.0000000000000001e-49  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3724  dienelactone hydrolase  47.45 
 
 
196 aa  162  3e-39  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.535837  normal  0.412865 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_07480  dienelactone hydrolase-like enzyme  42.71 
 
 
192 aa  139  1.9999999999999998e-32  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.469925  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4107  dienelactone hydrolase  38.54 
 
 
188 aa  117  7.999999999999999e-26  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1958  dienelactone hydrolase  40.31 
 
 
199 aa  108  4.0000000000000004e-23  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4961  dienelactone hydrolase  38.1 
 
 
189 aa  99  4e-20  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008505  LACR_C28  dienelactone hydrolase family protein  30.96 
 
 
201 aa  85.1  6e-16  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4378  carboxymethylenebutenolidase  26.77 
 
 
230 aa  47.4  0.0001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.112691 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1783  Carboxymethylenebutenolidase  28.64 
 
 
227 aa  45.4  0.0005  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2091  carboxymethylenebutenolidase  25.49 
 
 
303 aa  43.5  0.002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.449099  normal  0.243646 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3645  carboxymethylenebutenolidase (dienelactone) hydrolase (DLH)  28.37 
 
 
236 aa  42  0.005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>