14 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg2_2263 on replicon NC_011369
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011369  Rleg2_2263  hypothetical protein  100 
 
 
193 aa  387  1e-107  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.129186  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2588  hypothetical protein  90.1 
 
 
193 aa  345  3e-94  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.277418  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3343  dienelactone hydrolase  65.66 
 
 
200 aa  255  3e-67  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1337  hypothetical protein  65.26 
 
 
189 aa  246  2e-64  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.397563 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3453  hypothetical protein  65.97 
 
 
193 aa  240  1e-62  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000726577 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3724  dienelactone hydrolase  57.73 
 
 
196 aa  220  9.999999999999999e-57  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.535837  normal  0.412865 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_07080  dienelactone hydrolase-like enzyme  54.26 
 
 
193 aa  195  4.0000000000000005e-49  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.903512  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_07480  dienelactone hydrolase-like enzyme  44.22 
 
 
192 aa  147  1.0000000000000001e-34  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.469925  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4107  dienelactone hydrolase  37.97 
 
 
188 aa  110  2.0000000000000002e-23  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1958  dienelactone hydrolase  40.31 
 
 
199 aa  103  2e-21  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4961  dienelactone hydrolase  36.73 
 
 
189 aa  86.7  2e-16  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008505  LACR_C28  dienelactone hydrolase family protein  23.62 
 
 
201 aa  72.4  0.000000000004  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7870  putative carboxymethylenebutenolidase  26.6 
 
 
223 aa  46.2  0.0003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1783  Carboxymethylenebutenolidase  27.72 
 
 
227 aa  45.4  0.0005  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>