40 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcav_3724 on replicon NC_012669
Organism: Beutenbergia cavernae DSM 12333



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012669  Bcav_3724  dienelactone hydrolase  100 
 
 
196 aa  393  1e-109  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.535837  normal  0.412865 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3343  dienelactone hydrolase  59.7 
 
 
200 aa  225  3e-58  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2263  hypothetical protein  57.73 
 
 
193 aa  220  9.999999999999999e-57  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.129186  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2588  hypothetical protein  56.92 
 
 
193 aa  210  1e-53  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.277418  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1337  hypothetical protein  52.6 
 
 
189 aa  189  2.9999999999999997e-47  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.397563 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3453  hypothetical protein  47.45 
 
 
193 aa  162  3e-39  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000726577 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_07080  dienelactone hydrolase-like enzyme  45.31 
 
 
193 aa  145  4.0000000000000006e-34  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.903512  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_07480  dienelactone hydrolase-like enzyme  36.87 
 
 
192 aa  100  2e-20  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.469925  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4107  dienelactone hydrolase  31.79 
 
 
188 aa  83.2  0.000000000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1958  dienelactone hydrolase  37.31 
 
 
199 aa  81.6  0.000000000000007  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008505  LACR_C28  dienelactone hydrolase family protein  24.24 
 
 
201 aa  67.4  0.0000000001  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4961  dienelactone hydrolase  31.75 
 
 
189 aa  67.8  0.0000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5769  carboxymethylenebutenolidase  27.27 
 
 
295 aa  51.6  0.000008  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0190  carboxymethylenebutenolidase  27.88 
 
 
230 aa  50.1  0.00002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3645  carboxymethylenebutenolidase (dienelactone) hydrolase (DLH)  27.45 
 
 
236 aa  50.1  0.00002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5319  Carboxymethylenebutenolidase  29.41 
 
 
223 aa  48.9  0.00005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.319881  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5380  Carboxymethylenebutenolidase  27.54 
 
 
420 aa  48.1  0.00008  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.204007  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0203  carboxymethylenebutenolidase  26.92 
 
 
230 aa  46.6  0.0002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.19899  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5577  carboxymethylenebutenolidase  27.75 
 
 
237 aa  46.2  0.0003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2181  carboxymethylenebutenolidase  25.6 
 
 
250 aa  45.8  0.0004  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  decreased coverage  0.00295739  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1199  Carboxymethylenebutenolidase  25.25 
 
 
214 aa  45.4  0.0005  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0260  carboxymethylenebutenolidase  25.98 
 
 
229 aa  45.4  0.0006  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00785902 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_00900  dienelactone hydrolase-like enzyme  27.59 
 
 
241 aa  45.1  0.0006  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0255  Carboxymethylenebutenolidase  25.98 
 
 
229 aa  45.4  0.0006  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.781459  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0381  carboxymethylenebutenolidase  28.28 
 
 
291 aa  45.1  0.0007  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0900  carboxymethylenebutenolidase  25.25 
 
 
221 aa  44.7  0.0008  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3180  carboxymethylenebutenolidase  28.43 
 
 
433 aa  44.7  0.001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  decreased coverage  0.000051009  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3379  carboxymethylenebutenolidase  26.89 
 
 
230 aa  44.7  0.001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2831  carboxymethylenebutenolidase  27.83 
 
 
230 aa  43.9  0.001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0276  carboxymethylenebutenolidase  27.83 
 
 
230 aa  43.9  0.001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7175  putative carboxymethylenebutenolidase (dienelactone hydrolase)(DLH)  25.96 
 
 
410 aa  44.3  0.001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.887651  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7870  putative carboxymethylenebutenolidase  26.6 
 
 
223 aa  44.7  0.001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0391  Carboxymethylenebutenolidase  28.1 
 
 
232 aa  44.3  0.001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0258  carboxymethylenebutenolidase  27.83 
 
 
230 aa  43.9  0.002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0298  Carboxymethylenebutenolidase  22.82 
 
 
227 aa  43.9  0.002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6359  carboxymethylenebutenolidase  25.36 
 
 
415 aa  43.1  0.003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3321  dienelactone hydrolase  25.82 
 
 
409 aa  42  0.006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3055  Carboxymethylenebutenolidase  26.26 
 
 
243 aa  41.6  0.007  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.655447 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3311  dienelactone hydrolase  28.37 
 
 
305 aa  41.6  0.008  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.162342 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7160  Carboxymethylenebutenolidase  25 
 
 
407 aa  41.2  0.009  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.115938  normal  0.549117 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>