26 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Krad_1958 on replicon NC_009664
Organism: Kineococcus radiotolerans SRS30216



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009664  Krad_1958  dienelactone hydrolase  100 
 
 		 199 aa  400  1e-111  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4961  dienelactone hydrolase  41.97 
 
 		 189 aa  117  9.999999999999999e-26  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008505  LACR_C28  dienelactone hydrolase family protein  29.95 
 
 		 201 aa  116  1.9999999999999998e-25  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3453  hypothetical protein  40.31 
 
 		 193 aa  108  4.0000000000000004e-23  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000726577 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_07080  dienelactone hydrolase-like enzyme  41.1 
 
 		 193 aa  107  1e-22  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.903512  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4107  dienelactone hydrolase  39.89 
 
 		 188 aa  104  9e-22  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2263  hypothetical protein  40.31 
 
 		 193 aa  103  2e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.129186  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2588  hypothetical protein  39.38 
 
 		 193 aa  101  6e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.277418  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1337  hypothetical protein  36.32 
 
 		 189 aa  95.5  4e-19  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.397563 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3343  dienelactone hydrolase  39.39 
 
 		 200 aa  93.2  2e-18  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3724  dienelactone hydrolase  37.31 
 
 		 196 aa  81.6  0.000000000000007  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.535837  normal  0.412865 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1783  Carboxymethylenebutenolidase  28.64 
 
 		 227 aa  72.8  0.000000000003  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_07480  dienelactone hydrolase-like enzyme  31.69 
 
 		 192 aa  65.5  0.0000000005  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.469925  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1399  dienelactone hydrolase  30.59 
 
 		 250 aa  51.6  0.000008  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3231  dienelactone hydrolase  25.13 
 
 		 228 aa  50.4  0.00001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.891917  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1276  carboxymethylenebutenolidase  24.62 
 
 		 227 aa  49.7  0.00003  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS04764  putative transmembrane protein  25.96 
 
 		 238 aa  47.4  0.0001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS05691  putative transmembrane protein  25.96 
 
 		 238 aa  47.4  0.0001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4378  carboxymethylenebutenolidase  25.38 
 
 		 230 aa  44.7  0.0008  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.112691 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5769  carboxymethylenebutenolidase  24.87 
 
 		 295 aa  43.5  0.002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2303  putative carboxymethylenebutenolidase  25.51 
 
 		 224 aa  41.6  0.007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0298  Carboxymethylenebutenolidase  23.4 
 
 		 227 aa  41.6  0.007  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0468  Carboxymethylenebutenolidase  30.36 
 
 		 234 aa  41.6  0.008  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2806  dienelactone hydrolase family protein  29.44 
 
 		 295 aa  41.6  0.008  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.614525  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2614  carboxymethylenebutenolidase  31.2 
 
 		 262 aa  41.2  0.01  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0175902  normal  0.245657 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1285  carboxymethylenebutenolidase  25.41 
 
 		 263 aa  41.2  0.01  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>