20 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noca_3343 on replicon NC_008699
Organism: Nocardioides sp. JS614



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008699  Noca_3343  dienelactone hydrolase  100 
 
 
200 aa  394  1e-109  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2263  hypothetical protein  65.66 
 
 
193 aa  255  3e-67  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.129186  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2588  hypothetical protein  64.32 
 
 
193 aa  249  2e-65  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.277418  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3724  dienelactone hydrolase  59.7 
 
 
196 aa  225  3e-58  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.535837  normal  0.412865 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1337  hypothetical protein  58.79 
 
 
189 aa  216  2e-55  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.397563 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3453  hypothetical protein  56.85 
 
 
193 aa  196  2.0000000000000003e-49  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000726577 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_07080  dienelactone hydrolase-like enzyme  46.15 
 
 
193 aa  151  5e-36  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.903512  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_07480  dienelactone hydrolase-like enzyme  42 
 
 
192 aa  131  7.999999999999999e-30  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.469925  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4107  dienelactone hydrolase  41.58 
 
 
188 aa  124  1e-27  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4961  dienelactone hydrolase  40 
 
 
189 aa  94.7  8e-19  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1958  dienelactone hydrolase  39.39 
 
 
199 aa  93.2  2e-18  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008505  LACR_C28  dienelactone hydrolase family protein  25.25 
 
 
201 aa  72  0.000000000005  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1276  carboxymethylenebutenolidase  28.5 
 
 
227 aa  52.4  0.000005  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4378  carboxymethylenebutenolidase  27.05 
 
 
230 aa  47.4  0.0001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.112691 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7160  Carboxymethylenebutenolidase  27.01 
 
 
407 aa  46.2  0.0003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.115938  normal  0.549117 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1783  Carboxymethylenebutenolidase  28.99 
 
 
227 aa  44.3  0.001  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1304  carboxymethylenebutenolidase  25.37 
 
 
224 aa  43.5  0.002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0900  carboxymethylenebutenolidase  26.6 
 
 
221 aa  42  0.006  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1016  Carboxymethylenebutenolidase  27.83 
 
 
250 aa  42  0.007  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.387888 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6385  carboxymethylenebutenolidase  25.6 
 
 
234 aa  42  0.007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>