37 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg2_4958 on replicon NC_011368
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011368  Rleg2_4958  glutathione-dependent formaldehyde-activating enzyme  100 
 
 		 190 aa  395  1e-109  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.774551  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4920  glutathione-dependent formaldehyde-activating enzyme  69.4 
 
 		 189 aa  285  2e-76  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4832  glutathione-dependent formaldehyde-activating enzyme  65.96 
 
 		 190 aa  274  5e-73  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.237935 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0100  glutathione-dependent formaldehyde-activating enzyme  65.92 
 
 		 189 aa  249  1e-65  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5971  glutathione-dependent formaldehyde-activating enzyme  64.8 
 
 		 187 aa  247  8e-65  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.751414 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2575  glutathione-dependent formaldehyde-activating enzyme  59.78 
 
 		 196 aa  236  2e-61  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1233  glutathione-dependent formaldehyde-activating enzyme  59.78 
 
 		 196 aa  236  2e-61  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1948  glutathione-dependent formaldehyde-activating enzyme  59.78 
 
 		 193 aa  235  3e-61  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0844  glutathione-dependent formaldehyde-activating enzyme  59.89 
 
 		 194 aa  233  2.0000000000000002e-60  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.699536  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0696  glutathione-dependent formaldehyde-activating enzyme  59.89 
 
 		 194 aa  233  2.0000000000000002e-60  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5579  glutathione-dependent formaldehyde-activating enzyme  57.59 
 
 		 191 aa  224  4e-58  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5797  glutathione-dependent formaldehyde-activating enzyme  57.07 
 
 		 191 aa  224  8e-58  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.943227  normal  0.707073 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2793  glutathione-dependent formaldehyde-activating enzyme  57.61 
 
 		 190 aa  222  2e-57  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0015  glutathione-dependent formaldehyde-activating enzyme  57.07 
 
 		 194 aa  221  6e-57  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0213  glutathione-dependent formaldehyde-activating enzyme  54.3 
 
 		 187 aa  220  9.999999999999999e-57  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5113  glutathione-dependent formaldehyde-activating enzyme  54.3 
 
 		 191 aa  214  4e-55  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3930  glutathione-dependent formaldehyde-activating enzyme  56.52 
 
 		 189 aa  214  7e-55  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.508637  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2957  glutathione-dependent formaldehyde-activating enzyme  54.05 
 
 		 206 aa  213  9.999999999999999e-55  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  decreased coverage  0.00692853  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0373  glutathione-dependent formaldehyde-activating enzyme  54.95 
 
 		 185 aa  213  1.9999999999999998e-54  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3436  glutathione-dependent formaldehyde-activating enzyme  53.37 
 
 		 202 aa  209  3e-53  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.951888  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0267  glutathione-dependent formaldehyde-activating enzyme  53.07 
 
 		 185 aa  206  1e-52  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3387  glutathione-dependent formaldehyde-activating enzyme  54.95 
 
 		 202 aa  203  1e-51  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001304  ANIA_11015  conserved hypothetical protein  49.46 
 
 		 197 aa  203  1e-51  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.598964 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4024  glutathione-dependent formaldehyde-activating enzyme  55.91 
 
 		 191 aa  202  3e-51  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.673423 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4230  glutathione-dependent formaldehyde-activating enzyme  58.86 
 
 		 165 aa  196  2.0000000000000003e-49  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.730095  hitchhiker  0.000566631 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4238  glutathione-dependent formaldehyde-activating enzyme  52.75 
 
 		 191 aa  190  1e-47  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3438  glutathione-dependent formaldehyde-activating enzyme  56.33 
 
 		 160 aa  187  5.999999999999999e-47  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04414  glutathione-dependent formaldehyde-activating enzyme (S-(hydroxymethyl)glutathione synthase)  54.55 
 
 		 106 aa  67  0.0000000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1825  glutathione-dependent formaldehyde-activating, GFA  31.36 
 
 		 135 aa  49.3  0.00003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.893199  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1447  glutathione-dependent formaldehyde-activating GFA  28.57 
 
 		 136 aa  47.4  0.0001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.724218  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0987  glutathione-dependent formaldehyde-activating GFA  31.25 
 
 		 137 aa  44.3  0.001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1877  glutathione-dependent formaldehyde-activating, GFA  28.95 
 
 		 134 aa  43.9  0.001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.798516 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2000  glutathione-dependent formaldehyde-activating GFA  27.14 
 
 		 133 aa  43.5  0.002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.385456  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_05492  glutathione-dependent formaldehyde-activating enzyme  59.38 
 
 		 37 aa  42.7  0.003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4517  glutathione-dependent formaldehyde-activating GFA  23.84 
 
 		 150 aa  42.4  0.004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.463989  normal  0.0645739 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0897  glutathione-dependent formaldehyde-activating GFA  29.25 
 
 		 136 aa  42.4  0.005  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4252  glutathione-dependent formaldehyde-activating GFA  23.81 
 
 		 150 aa  41.6  0.008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>