37 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BBta_5971 on replicon NC_009485
Organism: Bradyrhizobium sp. BTAi1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009485  BBta_5971  glutathione-dependent formaldehyde-activating enzyme  100 
 
 		 187 aa  388  1e-107  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.751414 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0100  glutathione-dependent formaldehyde-activating enzyme  84.32 
 
 		 189 aa  327  8e-89  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2575  glutathione-dependent formaldehyde-activating enzyme  72.38 
 
 		 196 aa  279  2e-74  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1233  glutathione-dependent formaldehyde-activating enzyme  72.38 
 
 		 196 aa  279  2e-74  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1948  glutathione-dependent formaldehyde-activating enzyme  69.61 
 
 		 193 aa  270  7e-72  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2793  glutathione-dependent formaldehyde-activating enzyme  68.65 
 
 		 190 aa  267  8e-71  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0696  glutathione-dependent formaldehyde-activating enzyme  69.19 
 
 		 194 aa  265  2e-70  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0844  glutathione-dependent formaldehyde-activating enzyme  69.19 
 
 		 194 aa  265  2e-70  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.699536  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0267  glutathione-dependent formaldehyde-activating enzyme  65.41 
 
 		 185 aa  264  5e-70  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3930  glutathione-dependent formaldehyde-activating enzyme  65.41 
 
 		 189 aa  260  8.999999999999999e-69  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.508637  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0373  glutathione-dependent formaldehyde-activating enzyme  64.13 
 
 		 185 aa  258  2e-68  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0015  glutathione-dependent formaldehyde-activating enzyme  65.95 
 
 		 194 aa  255  3e-67  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4920  glutathione-dependent formaldehyde-activating enzyme  64.48 
 
 		 189 aa  254  5e-67  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5797  glutathione-dependent formaldehyde-activating enzyme  61.08 
 
 		 191 aa  248  5e-65  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.943227  normal  0.707073 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5579  glutathione-dependent formaldehyde-activating enzyme  61.62 
 
 		 191 aa  247  6e-65  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4958  glutathione-dependent formaldehyde-activating enzyme  64.8 
 
 		 190 aa  247  8e-65  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.774551  normal  1 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4832  glutathione-dependent formaldehyde-activating enzyme  61.54 
 
 		 190 aa  241  3.9999999999999997e-63  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.237935 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4230  glutathione-dependent formaldehyde-activating enzyme  69.81 
 
 		 165 aa  241  6e-63  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.730095  hitchhiker  0.000566631 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3436  glutathione-dependent formaldehyde-activating enzyme  57.92 
 
 		 202 aa  240  1e-62  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.951888  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0213  glutathione-dependent formaldehyde-activating enzyme  58.99 
 
 		 187 aa  239  2e-62  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5113  glutathione-dependent formaldehyde-activating enzyme  60 
 
 		 191 aa  239  2e-62  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3438  glutathione-dependent formaldehyde-activating enzyme  69.62 
 
 		 160 aa  236  2e-61  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2957  glutathione-dependent formaldehyde-activating enzyme  60.77 
 
 		 206 aa  231  4.0000000000000004e-60  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  decreased coverage  0.00692853  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3387  glutathione-dependent formaldehyde-activating enzyme  59.67 
 
 		 202 aa  230  7.000000000000001e-60  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4024  glutathione-dependent formaldehyde-activating enzyme  60 
 
 		 191 aa  221  7e-57  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.673423 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4238  glutathione-dependent formaldehyde-activating enzyme  56.99 
 
 		 191 aa  220  9.999999999999999e-57  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_11015  conserved hypothetical protein  53.51 
 
 		 197 aa  203  1e-51  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.598964 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04414  glutathione-dependent formaldehyde-activating enzyme (S-(hydroxymethyl)glutathione synthase)  63.64 
 
 		 106 aa  80.5  0.00000000000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_05492  glutathione-dependent formaldehyde-activating enzyme  70.97 
 
 		 37 aa  47  0.0001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2000  glutathione-dependent formaldehyde-activating GFA  28 
 
 		 133 aa  44.7  0.0007  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.385456  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3058  glutathione-dependent formaldehyde-activating GFA  31.71 
 
 		 131 aa  43.1  0.002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3282  glutathione-dependent formaldehyde-activating GFA  30.49 
 
 		 131 aa  42  0.006  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.347186  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04936  hypothetical protein  24.3 
 
 		 133 aa  41.2  0.009  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3563  glutathione-dependent formaldehyde-activating, GFA  30.36 
 
 		 130 aa  41.2  0.009  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.20004  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1877  glutathione-dependent formaldehyde-activating, GFA  30 
 
 		 134 aa  41.2  0.009  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.798516 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2174  hypothetical protein  30.36 
 
 		 130 aa  41.2  0.009  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1825  glutathione-dependent formaldehyde-activating, GFA  27.27 
 
 		 135 aa  40.8  0.01  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.893199  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>