29 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg_4832 on replicon NC_012848
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012848  Rleg_4832  glutathione-dependent formaldehyde-activating enzyme  100 
 
 		 190 aa  395  1e-109  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.237935 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4920  glutathione-dependent formaldehyde-activating enzyme  92.55 
 
 		 189 aa  365  1e-100  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4958  glutathione-dependent formaldehyde-activating enzyme  65.96 
 
 		 190 aa  274  5e-73  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.774551  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0100  glutathione-dependent formaldehyde-activating enzyme  65.93 
 
 		 189 aa  256  2e-67  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0015  glutathione-dependent formaldehyde-activating enzyme  60 
 
 		 194 aa  246  2e-64  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1948  glutathione-dependent formaldehyde-activating enzyme  61.38 
 
 		 193 aa  244  4.9999999999999997e-64  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5971  glutathione-dependent formaldehyde-activating enzyme  61.54 
 
 		 187 aa  241  3.9999999999999997e-63  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.751414 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1233  glutathione-dependent formaldehyde-activating enzyme  59.26 
 
 		 196 aa  237  5.999999999999999e-62  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2575  glutathione-dependent formaldehyde-activating enzyme  59.26 
 
 		 196 aa  237  5.999999999999999e-62  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2793  glutathione-dependent formaldehyde-activating enzyme  58.73 
 
 		 190 aa  236  2e-61  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0213  glutathione-dependent formaldehyde-activating enzyme  56.99 
 
 		 187 aa  229  2e-59  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5797  glutathione-dependent formaldehyde-activating enzyme  59.68 
 
 		 191 aa  228  3e-59  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.943227  normal  0.707073 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3930  glutathione-dependent formaldehyde-activating enzyme  56.38 
 
 		 189 aa  229  3e-59  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.508637  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5579  glutathione-dependent formaldehyde-activating enzyme  59.14 
 
 		 191 aa  228  5e-59  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0696  glutathione-dependent formaldehyde-activating enzyme  59.26 
 
 		 194 aa  227  6e-59  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3436  glutathione-dependent formaldehyde-activating enzyme  59.12 
 
 		 202 aa  227  6e-59  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.951888  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0844  glutathione-dependent formaldehyde-activating enzyme  59.26 
 
 		 194 aa  227  6e-59  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.699536  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0267  glutathione-dependent formaldehyde-activating enzyme  59.02 
 
 		 185 aa  225  3e-58  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2957  glutathione-dependent formaldehyde-activating enzyme  51.31 
 
 		 206 aa  216  1e-55  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  decreased coverage  0.00692853  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0373  glutathione-dependent formaldehyde-activating enzyme  55.19 
 
 		 185 aa  216  1e-55  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_11015  conserved hypothetical protein  52.63 
 
 		 197 aa  215  2.9999999999999998e-55  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.598964 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5113  glutathione-dependent formaldehyde-activating enzyme  56.52 
 
 		 191 aa  213  9.999999999999999e-55  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3387  glutathione-dependent formaldehyde-activating enzyme  55.68 
 
 		 202 aa  211  4.9999999999999996e-54  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4024  glutathione-dependent formaldehyde-activating enzyme  57.53 
 
 		 191 aa  206  2e-52  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.673423 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4230  glutathione-dependent formaldehyde-activating enzyme  58.23 
 
 		 165 aa  198  3.9999999999999996e-50  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.730095  hitchhiker  0.000566631 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4238  glutathione-dependent formaldehyde-activating enzyme  52.22 
 
 		 191 aa  190  9e-48  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3438  glutathione-dependent formaldehyde-activating enzyme  55.35 
 
 		 160 aa  184  5e-46  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04414  glutathione-dependent formaldehyde-activating enzyme (S-(hydroxymethyl)glutathione synthase)  50.82 
 
 		 106 aa  65.1  0.0000000007  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2000  glutathione-dependent formaldehyde-activating GFA  32 
 
 		 133 aa  46.2  0.0003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.385456  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>