38 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bamb_5797 on replicon NC_008392
Organism: Burkholderia ambifaria AMMD



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008392  Bamb_5797  glutathione-dependent formaldehyde-activating enzyme  100 
 
 		 191 aa  395  1e-109  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.943227  normal  0.707073 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5579  glutathione-dependent formaldehyde-activating enzyme  97.91 
 
 		 191 aa  390  1e-108  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5113  glutathione-dependent formaldehyde-activating enzyme  82.2 
 
 		 191 aa  331  4e-90  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4024  glutathione-dependent formaldehyde-activating enzyme  78.01 
 
 		 191 aa  295  3e-79  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.673423 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4238  glutathione-dependent formaldehyde-activating enzyme  71.73 
 
 		 191 aa  289  2e-77  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2793  glutathione-dependent formaldehyde-activating enzyme  65.59 
 
 		 190 aa  273  8e-73  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0696  glutathione-dependent formaldehyde-activating enzyme  66.49 
 
 		 194 aa  269  2e-71  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0844  glutathione-dependent formaldehyde-activating enzyme  66.49 
 
 		 194 aa  269  2e-71  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.699536  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1948  glutathione-dependent formaldehyde-activating enzyme  67.39 
 
 		 193 aa  265  2.9999999999999995e-70  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0267  glutathione-dependent formaldehyde-activating enzyme  63.78 
 
 		 185 aa  258  3e-68  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2957  glutathione-dependent formaldehyde-activating enzyme  61.5 
 
 		 206 aa  257  9e-68  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  decreased coverage  0.00692853  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1233  glutathione-dependent formaldehyde-activating enzyme  65.22 
 
 		 196 aa  256  1e-67  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2575  glutathione-dependent formaldehyde-activating enzyme  65.22 
 
 		 196 aa  256  1e-67  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3930  glutathione-dependent formaldehyde-activating enzyme  61.41 
 
 		 189 aa  249  2e-65  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.508637  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5971  glutathione-dependent formaldehyde-activating enzyme  61.08 
 
 		 187 aa  248  5e-65  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.751414 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0373  glutathione-dependent formaldehyde-activating enzyme  61.96 
 
 		 185 aa  247  6e-65  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0100  glutathione-dependent formaldehyde-activating enzyme  63.78 
 
 		 189 aa  246  1e-64  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0015  glutathione-dependent formaldehyde-activating enzyme  61.96 
 
 		 194 aa  241  3.9999999999999997e-63  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4920  glutathione-dependent formaldehyde-activating enzyme  61.5 
 
 		 189 aa  236  1e-61  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4832  glutathione-dependent formaldehyde-activating enzyme  59.68 
 
 		 190 aa  228  3e-59  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.237935 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0213  glutathione-dependent formaldehyde-activating enzyme  57.87 
 
 		 187 aa  228  3e-59  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4230  glutathione-dependent formaldehyde-activating enzyme  63.92 
 
 		 165 aa  226  2e-58  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.730095  hitchhiker  0.000566631 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3436  glutathione-dependent formaldehyde-activating enzyme  53.55 
 
 		 202 aa  226  2e-58  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.951888  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4958  glutathione-dependent formaldehyde-activating enzyme  57.07 
 
 		 190 aa  224  7e-58  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.774551  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3438  glutathione-dependent formaldehyde-activating enzyme  62.42 
 
 		 160 aa  216  1e-55  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3387  glutathione-dependent formaldehyde-activating enzyme  55.25 
 
 		 202 aa  214  5e-55  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001304  ANIA_11015  conserved hypothetical protein  52.38 
 
 		 197 aa  209  2e-53  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.598964 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04414  glutathione-dependent formaldehyde-activating enzyme (S-(hydroxymethyl)glutathione synthase)  67.21 
 
 		 106 aa  91.3  8e-18  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1035  glutathione-dependent formaldehyde-activating GFA  34.91 
 
 		 162 aa  48.1  0.00007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.115298  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0987  glutathione-dependent formaldehyde-activating GFA  29.06 
 
 		 137 aa  46.6  0.0002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1182  glutathione-dependent formaldehyde-activating GFA  34.41 
 
 		 162 aa  45.4  0.0005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0852446  normal  0.729931 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04936  hypothetical protein  25.64 
 
 		 133 aa  45.4  0.0005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1825  glutathione-dependent formaldehyde-activating, GFA  30.25 
 
 		 135 aa  45.1  0.0006  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.893199  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1480  hypothetical protein  33.71 
 
 		 164 aa  44.3  0.001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.412839  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3058  glutathione-dependent formaldehyde-activating GFA  32.05 
 
 		 131 aa  42.4  0.004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0661  glutathione-dependent formaldehyde-activating GFA  25.61 
 
 		 137 aa  42  0.005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0500  hypothetical protein  25.61 
 
 		 137 aa  42  0.005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1776  glutathione-dependent formaldehyde-activating GFA  30.77 
 
 		 155 aa  41.6  0.007  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.621397  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>