243 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg_4517 on replicon NC_012850
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012850  Rleg_4517  glutathione-dependent formaldehyde-activating GFA  100 
 
 
150 aa  313  5e-85  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.463989  normal  0.0645739 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4252  glutathione-dependent formaldehyde-activating GFA  92.57 
 
 
150 aa  293  4e-79  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1801  glutathione-dependent formaldehyde-activating GFA  74.66 
 
 
153 aa  240  3.9999999999999997e-63  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.292489  hitchhiker  0.00074845 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3420  glutathione-dependent formaldehyde-activating, GFA  70.55 
 
 
154 aa  201  2e-51  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.124611 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1578  hypothetical protein  57.14 
 
 
170 aa  172  9.999999999999999e-43  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.418396  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1700  glutathione-dependent formaldehyde-activating, GFA  56.85 
 
 
151 aa  171  2.9999999999999996e-42  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0321  glutathione-dependent formaldehyde-activating, GFA  53.69 
 
 
154 aa  171  3.9999999999999995e-42  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.457074  hitchhiker  0.00769864 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6382  glutathione-dependent formaldehyde-activating GFA  55.24 
 
 
150 aa  166  8e-41  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4618  glutathione-dependent formaldehyde-activating GFA  32.59 
 
 
133 aa  81.6  0.000000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.343456 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1825  glutathione-dependent formaldehyde-activating, GFA  32.58 
 
 
135 aa  81.3  0.000000000000004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.893199  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3468  glutathione-dependent formaldehyde-activating GFA  32.88 
 
 
163 aa  80.9  0.000000000000005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2179  glutathione-dependent formaldehyde-activating, GFA  32.65 
 
 
153 aa  79.7  0.00000000000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.941254 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0987  glutathione-dependent formaldehyde-activating GFA  35.9 
 
 
137 aa  78.2  0.00000000000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4350  glutathione-dependent formaldehyde-activating GFA  32.77 
 
 
133 aa  75.9  0.0000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.300431 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0696  glutathione-dependent formaldehyde-activating, GFA  32.48 
 
 
136 aa  75.5  0.0000000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2568  glutathione-dependent formaldehyde-activating GFA  32.48 
 
 
136 aa  75.5  0.0000000000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.959618  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1412  glutathione-dependent formaldehyde-activating, GFA  29.69 
 
 
152 aa  75.1  0.0000000000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.233929  normal  0.168461 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0815  glutathione-dependent formaldehyde-activating, GFA  31.86 
 
 
136 aa  73.9  0.0000000000007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0784  glutathione-dependent formaldehyde-activating GFA  31.86 
 
 
136 aa  73.9  0.0000000000008  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3908  glutathione-dependent formaldehyde-activating, GFA  32.48 
 
 
136 aa  73.2  0.000000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0332  glutathione-dependent formaldehyde-activating, GFA  31.62 
 
 
213 aa  73.2  0.000000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.989164  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3234  hypothetical protein  33.33 
 
 
135 aa  71.2  0.000000000004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3181  glutathione-dependent formaldehyde-activating, GFA  33.33 
 
 
135 aa  71.2  0.000000000004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3220  hypothetical protein  33.33 
 
 
135 aa  71.2  0.000000000004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.275931  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0691  glutathione-dependent formaldehyde-activating, GFA  32.35 
 
 
164 aa  70.5  0.000000000007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.979336  normal  0.380735 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1928  hypothetical protein  33.33 
 
 
135 aa  70.5  0.000000000007  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2062  hypothetical protein  33.33 
 
 
135 aa  70.5  0.000000000007  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2681  hypothetical protein  33.33 
 
 
135 aa  70.5  0.000000000007  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0849  hypothetical protein  33.33 
 
 
135 aa  70.5  0.000000000007  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0830  glutathione-dependent formaldehyde-activating GFA  28.46 
 
 
137 aa  69.7  0.00000000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0707  hypothetical protein  29.29 
 
 
139 aa  69.7  0.00000000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.133766 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0409  hypothetical protein  36.36 
 
 
137 aa  70.1  0.00000000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.834181  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2171  glutathione-dependent formaldehyde-activating, GFA  35.71 
 
 
130 aa  68.6  0.00000000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1392  hypothetical protein  31.53 
 
 
135 aa  68.6  0.00000000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0763  hypothetical protein  33.33 
 
 
148 aa  68.2  0.00000000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.202538 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1406  hypothetical protein  34.75 
 
 
164 aa  67  0.00000000008  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.951325  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2827  putative lipoprotein  30.33 
 
 
139 aa  66.6  0.0000000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0331828  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2904  glutathione-dependent formaldehyde-activating, GFA  28.69 
 
 
140 aa  66.6  0.0000000001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.347392  normal  0.579092 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3558  glutathione-dependent formaldehyde-activating GFA  31.93 
 
 
134 aa  65.5  0.0000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2040  glutathione-dependent formaldehyde-activating GFA  30 
 
 
154 aa  65.5  0.0000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1511  hypothetical protein  29.6 
 
 
137 aa  65.5  0.0000000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.401586  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1761  glutathione-dependent formaldehyde-activating, GFA  29.33 
 
 
154 aa  65.5  0.0000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.161913 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0189  glutathione-dependent formaldehyde-activating, GFA  29.88 
 
 
168 aa  65.1  0.0000000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.779012 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2597  hypothetical protein  30.52 
 
 
164 aa  65.1  0.0000000004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1446  hypothetical protein  30.52 
 
 
164 aa  64.7  0.0000000004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1360  hypothetical protein  30.52 
 
 
164 aa  65.1  0.0000000004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1277  glutathione-dependent formaldehyde-activating GFA  34.23 
 
 
130 aa  63.9  0.0000000006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0151455  normal 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1094  hypothetical protein  30.52 
 
 
164 aa  63.9  0.0000000007  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.171827  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0205  hypothetical protein  30.52 
 
 
164 aa  63.9  0.0000000007  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0478  hypothetical protein  30.52 
 
 
164 aa  63.9  0.0000000007  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0528952  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1655  glutathione-dependent formaldehyde-activating, GFA  31.86 
 
 
130 aa  63.5  0.0000000009  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.290612  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0522  glutathione-dependent formaldehyde-activating, GFA  31.78 
 
 
124 aa  63.2  0.000000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.288111  normal  0.155331 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_28950  hypothetical protein  32.11 
 
 
130 aa  63.2  0.000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.906248  hitchhiker  0.0000303722 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1236  hypothetical protein  29.87 
 
 
164 aa  62.4  0.000000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2294  glutathione-dependent formaldehyde-activating, GFA  36.9 
 
 
149 aa  62.4  0.000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2632  glutathione-dependent formaldehyde-activating GFA  27.48 
 
 
137 aa  62  0.000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0500  hypothetical protein  29.36 
 
 
137 aa  62  0.000000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3089  hypothetical protein  35.71 
 
 
130 aa  61.6  0.000000003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3537  glutathione-dependent formaldehyde-activating, GFA  27.48 
 
 
154 aa  61.6  0.000000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0385198  normal  0.188367 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0661  glutathione-dependent formaldehyde-activating GFA  29.36 
 
 
137 aa  62  0.000000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3057  glutathione-dependent formaldehyde-activating GFA  34.78 
 
 
144 aa  61.6  0.000000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.100112  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1928  glutathione-dependent formaldehyde-activating, GFA  26.92 
 
 
154 aa  61.6  0.000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0516617  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3548  hypothetical protein  31.3 
 
 
129 aa  61.6  0.000000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3816  glutathione-dependent formaldehyde-activating, GFA  35.78 
 
 
130 aa  61.6  0.000000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.496132  normal  0.533485 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07594  DUF636 domain protein (AFU_orthologue; AFUA_2G15290)  30.88 
 
 
136 aa  61.2  0.000000005  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.651423 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2237  glutathione-dependent formaldehyde-activating, GFA  28.67 
 
 
154 aa  61.2  0.000000005  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1962  glutathione-dependent formaldehyde-activating, GFA  26.03 
 
 
160 aa  60.8  0.000000005  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.72415  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0258  glutathione-dependent formaldehyde-activating GFA  31.71 
 
 
132 aa  60.8  0.000000006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0150  glutathione-dependent formaldehyde-activating GFA  26.77 
 
 
135 aa  60.8  0.000000006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.0696937 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2817  glutathione-dependent formaldehyde-activating, GFA  34.82 
 
 
130 aa  60.8  0.000000006  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.627654 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1872  glutathione-dependent formaldehyde-activating GFA  28.23 
 
 
166 aa  60.5  0.000000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.308799  normal  0.266462 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0497  glutathione-dependent formaldehyde-activating GFA  29.77 
 
 
130 aa  60.5  0.000000008  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1183  glutathione-dependent formaldehyde-activating GFA  30.43 
 
 
158 aa  60.5  0.000000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.204869  normal  0.726417 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3511  glutathione-dependent formaldehyde-activating GFA  28.03 
 
 
138 aa  60.1  0.000000009  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1447  glutathione-dependent formaldehyde-activating GFA  27.61 
 
 
136 aa  60.1  0.000000009  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.724218  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1035  glutathione-dependent formaldehyde-activating GFA  27.78 
 
 
162 aa  59.7  0.00000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.115298  normal 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6124  glutathione-dependent formaldehyde-activating GFA  31.15 
 
 
138 aa  59.7  0.00000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.430831  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0451  glutathione-dependent formaldehyde-activating, GFA  29.06 
 
 
138 aa  58.9  0.00000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.333095  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1182  glutathione-dependent formaldehyde-activating GFA  29.37 
 
 
162 aa  58.9  0.00000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0852446  normal  0.729931 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2637  glutathione-dependent formaldehyde-activating, GFA  28.67 
 
 
154 aa  58.9  0.00000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.302583  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4001  hypothetical protein  29.55 
 
 
130 aa  58.9  0.00000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.985025  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0854  glutathione-dependent formaldehyde-activating, GFA  28.78 
 
 
135 aa  58.9  0.00000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3056  glutathione-dependent formaldehyde-activating, GFA  27.48 
 
 
134 aa  59.3  0.00000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00204984  hitchhiker  0.00341554 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0916  glutathione-dependent formaldehyde-activating, GFA  27.48 
 
 
134 aa  59.3  0.00000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.403663 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1659  glutathione-dependent formaldehyde-activating GFA  27.43 
 
 
137 aa  59.3  0.00000002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0579  hypothetical protein  30.19 
 
 
141 aa  58.9  0.00000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3921  glutathione-dependent formaldehyde-activating GFA  33.66 
 
 
175 aa  58.5  0.00000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0761  glutathione-dependent formaldehyde-activating, GFA  32.11 
 
 
129 aa  58.2  0.00000003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0631  glutathione-dependent formaldehyde-activating, GFA  29.29 
 
 
162 aa  58.5  0.00000003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.463993  normal  0.179081 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3017  glutathione-dependent formaldehyde-activating GFA  29.41 
 
 
136 aa  58.5  0.00000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.403214  normal  0.86852 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1181  glutathione-dependent formaldehyde-activating GFA  33.04 
 
 
158 aa  58.2  0.00000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.128297  normal  0.736042 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1327  glutathione-dependent formaldehyde-activating, GFA  32.43 
 
 
130 aa  58.2  0.00000004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2104  hypothetical protein  29.41 
 
 
156 aa  57.8  0.00000005  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.19996  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0575  glutathione-dependent formaldehyde-activating, GFA  31.09 
 
 
162 aa  57.8  0.00000005  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0962204  hitchhiker  0.00000348554 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3022  hypothetical protein  28 
 
 
154 aa  57.8  0.00000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.548087 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3911  glutathione-dependent formaldehyde-activating GFA  27.74 
 
 
175 aa  57.8  0.00000005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0706653  normal  0.116642 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1877  glutathione-dependent formaldehyde-activating, GFA  24.63 
 
 
134 aa  57  0.00000009  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.798516 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2315  glutathione-dependent formaldehyde-activating GFA  28.23 
 
 
166 aa  57  0.00000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.08295  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1582  glutathione-dependent formaldehyde-activating, GFA  26.87 
 
 
135 aa  56.2  0.0000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.625923  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3212  glutathione-dependent formaldehyde-activating, GFA  31.93 
 
 
144 aa  56.6  0.0000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.502813 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>