210 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hoch_6382 on replicon NC_013440
Organism: Haliangium ochraceum DSM 14365



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013440  Hoch_6382  glutathione-dependent formaldehyde-activating GFA  100 
 
 
150 aa  313  6e-85  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1700  glutathione-dependent formaldehyde-activating, GFA  72.11 
 
 
151 aa  209  1e-53  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1801  glutathione-dependent formaldehyde-activating GFA  62.32 
 
 
153 aa  191  4e-48  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.292489  hitchhiker  0.00074845 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4517  glutathione-dependent formaldehyde-activating GFA  55.24 
 
 
150 aa  180  7e-45  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.463989  normal  0.0645739 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4252  glutathione-dependent formaldehyde-activating GFA  52.74 
 
 
150 aa  176  1e-43  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3420  glutathione-dependent formaldehyde-activating, GFA  55.78 
 
 
154 aa  162  1.0000000000000001e-39  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.124611 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1578  hypothetical protein  52.11 
 
 
170 aa  159  9e-39  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.418396  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0321  glutathione-dependent formaldehyde-activating, GFA  46.98 
 
 
154 aa  146  1.0000000000000001e-34  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.457074  hitchhiker  0.00769864 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1825  glutathione-dependent formaldehyde-activating, GFA  30.83 
 
 
135 aa  78.2  0.00000000000004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.893199  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2179  glutathione-dependent formaldehyde-activating, GFA  27.08 
 
 
153 aa  74.7  0.0000000000004  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.941254 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0661  glutathione-dependent formaldehyde-activating GFA  31.36 
 
 
137 aa  72.4  0.000000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0500  hypothetical protein  31.36 
 
 
137 aa  72.4  0.000000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3558  glutathione-dependent formaldehyde-activating GFA  32 
 
 
134 aa  72  0.000000000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1659  glutathione-dependent formaldehyde-activating GFA  31.15 
 
 
137 aa  70.9  0.000000000005  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4350  glutathione-dependent formaldehyde-activating GFA  32.76 
 
 
133 aa  70.9  0.000000000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.300431 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4618  glutathione-dependent formaldehyde-activating GFA  31.9 
 
 
133 aa  70.9  0.000000000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.343456 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1980  glutathione-dependent formaldehyde-activating, GFA  31.21 
 
 
143 aa  67.8  0.00000000005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00504481 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2000  glutathione-dependent formaldehyde-activating GFA  29.31 
 
 
133 aa  66.6  0.0000000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.385456  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0451  glutathione-dependent formaldehyde-activating, GFA  26.67 
 
 
138 aa  62.8  0.000000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.333095  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1406  hypothetical protein  30.16 
 
 
164 aa  61.6  0.000000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.951325  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0987  glutathione-dependent formaldehyde-activating GFA  28.33 
 
 
137 aa  61.6  0.000000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_4979  glutathione-dependent formaldehyde-activating, GFA  28.8 
 
 
165 aa  60.5  0.000000008  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000257887 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1236  hypothetical protein  31.67 
 
 
164 aa  60.1  0.00000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2597  hypothetical protein  30.83 
 
 
164 aa  59.3  0.00000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1360  hypothetical protein  30.83 
 
 
164 aa  59.3  0.00000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0830  glutathione-dependent formaldehyde-activating GFA  23.88 
 
 
137 aa  59.3  0.00000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07594  DUF636 domain protein (AFU_orthologue; AFUA_2G15290)  28.24 
 
 
136 aa  58.5  0.00000003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.651423 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0897  glutathione-dependent formaldehyde-activating GFA  28.57 
 
 
136 aa  58.9  0.00000003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0691  glutathione-dependent formaldehyde-activating, GFA  29.75 
 
 
164 aa  58.5  0.00000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.979336  normal  0.380735 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_05940  DUF636 domain protein (AFU_orthologue; AFUA_1G03180)  27.01 
 
 
142 aa  58.2  0.00000004  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0707  hypothetical protein  22.86 
 
 
139 aa  58.2  0.00000004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.133766 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2294  glutathione-dependent formaldehyde-activating, GFA  28.7 
 
 
149 aa  58.2  0.00000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1094  hypothetical protein  30.83 
 
 
164 aa  58.2  0.00000004  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.171827  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0373  hypothetical protein  28.93 
 
 
134 aa  58.2  0.00000004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.752552  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0205  hypothetical protein  30.83 
 
 
164 aa  58.2  0.00000004  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0478  hypothetical protein  30.83 
 
 
164 aa  58.2  0.00000004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0528952  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3921  glutathione-dependent formaldehyde-activating GFA  32.54 
 
 
175 aa  57.8  0.00000005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1362  hypothetical protein  24.14 
 
 
137 aa  57.8  0.00000005  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  1.98535e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0861  glutathione-dependent formaldehyde-activating GFA  27.78 
 
 
136 aa  57.8  0.00000005  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0763  hypothetical protein  29.06 
 
 
148 aa  57.4  0.00000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.202538 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2827  putative lipoprotein  23.93 
 
 
139 aa  57  0.00000008  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0331828  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2904  glutathione-dependent formaldehyde-activating, GFA  23.48 
 
 
140 aa  56.2  0.0000001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.347392  normal  0.579092 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2194  glutathione-dependent formaldehyde-activating, GFA  29.82 
 
 
137 aa  56.2  0.0000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.36194  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3511  glutathione-dependent formaldehyde-activating GFA  28.24 
 
 
138 aa  56.6  0.0000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1446  hypothetical protein  30 
 
 
164 aa  56.6  0.0000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0497  glutathione-dependent formaldehyde-activating GFA  28.45 
 
 
130 aa  55.8  0.0000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001306  ANIA_10368  DUF636 domain protein (AFU_orthologue; AFUA_6G11530)  26.83 
 
 
141 aa  55.8  0.0000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.0141752 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3282  glutathione-dependent formaldehyde-activating GFA  26.36 
 
 
131 aa  56.2  0.0000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.347186  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2104  hypothetical protein  30.25 
 
 
156 aa  55.5  0.0000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.19996  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0884  glutathione-dependent formaldehyde-activating GFA  26.98 
 
 
136 aa  56.2  0.0000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3911  glutathione-dependent formaldehyde-activating GFA  36.63 
 
 
175 aa  55.8  0.0000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0706653  normal  0.116642 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1655  glutathione-dependent formaldehyde-activating, GFA  27.59 
 
 
130 aa  55.5  0.0000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.290612  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0409  hypothetical protein  25.21 
 
 
137 aa  55.5  0.0000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.834181  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0780  glutathione-dependent formaldehyde-activating, GFA  30.25 
 
 
156 aa  55.8  0.0000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.400966  normal  0.594391 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3478  glutathione-dependent formaldehyde-activating GFA  27.83 
 
 
136 aa  55.8  0.0000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3212  glutathione-dependent formaldehyde-activating, GFA  29.86 
 
 
144 aa  55.1  0.0000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.502813 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3257  glutathione-dependent formaldehyde-activating GFA  27.13 
 
 
131 aa  54.7  0.0000004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.158594  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2568  glutathione-dependent formaldehyde-activating GFA  27.19 
 
 
136 aa  54.7  0.0000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.959618  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1286  glutathione-dependent formaldehyde-activating, GFA  27.07 
 
 
136 aa  54.3  0.0000005  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.792681  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3022  glutathione-dependent formaldehyde-activating, GFA  27.83 
 
 
132 aa  54.3  0.0000006  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1907  glutathione-dependent formaldehyde-activating, GFA  25.35 
 
 
142 aa  53.9  0.0000007  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.39902  hitchhiker  0.0000265119 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2632  glutathione-dependent formaldehyde-activating GFA  26.72 
 
 
137 aa  53.9  0.0000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2780  glutathione-dependent formaldehyde-activating, GFA  31.5 
 
 
145 aa  53.9  0.0000008  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2171  glutathione-dependent formaldehyde-activating, GFA  27.19 
 
 
130 aa  53.5  0.0000009  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3468  glutathione-dependent formaldehyde-activating GFA  25 
 
 
163 aa  53.5  0.0000009  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04936  hypothetical protein  28.45 
 
 
133 aa  53.1  0.000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1412  glutathione-dependent formaldehyde-activating, GFA  26.45 
 
 
152 aa  53.1  0.000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.233929  normal  0.168461 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2294  glutathione-dependent formaldehyde-activating GFA  26.61 
 
 
137 aa  53.1  0.000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.267657  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2092  glutathione-dependent formaldehyde-activating, GFA  25.19 
 
 
147 aa  53.1  0.000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0175411  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2040  glutathione-dependent formaldehyde-activating GFA  27.27 
 
 
154 aa  53.5  0.000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0916  glutathione-dependent formaldehyde-activating, GFA  24.56 
 
 
134 aa  52.8  0.000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.403663 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2864  glutathione-dependent formaldehyde-activating, GFA  25.44 
 
 
143 aa  53.5  0.000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.567755  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0579  hypothetical protein  25.86 
 
 
141 aa  53.1  0.000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5167  glutathione-dependent formaldehyde-activating GFA  28.45 
 
 
129 aa  53.1  0.000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.578961 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1147  hypothetical protein  30.71 
 
 
145 aa  52.4  0.000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0603  glutathione-dependent formaldehyde-activating, GFA  25.44 
 
 
139 aa  52.4  0.000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.791565 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3056  glutathione-dependent formaldehyde-activating, GFA  24.56 
 
 
134 aa  52.8  0.000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00204984  hitchhiker  0.00341554 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7106  glutathione-dependent formaldehyde-activating GFA  31.58 
 
 
125 aa  52.8  0.000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.221304 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2808  glutathione-dependent formaldehyde-activating, GFA  30.71 
 
 
145 aa  52.4  0.000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5412  glutathione-dependent formaldehyde-activating GFA  29.91 
 
 
125 aa  52  0.000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.162493 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1568  glutathione-dependent formaldehyde-activating GFA  27.19 
 
 
158 aa  51.6  0.000003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2353  glutathione-dependent formaldehyde-activating GFA  24.56 
 
 
143 aa  52  0.000003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0485749  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3089  hypothetical protein  26.72 
 
 
130 aa  51.2  0.000004  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2367  glutathione-dependent formaldehyde-activating GFA  25.69 
 
 
142 aa  51.2  0.000004  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.703282  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0696  glutathione-dependent formaldehyde-activating, GFA  26.55 
 
 
136 aa  51.6  0.000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4770  glutathione-dependent formaldehyde-activating GFA  30.97 
 
 
128 aa  51.6  0.000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.251226  normal  0.268537 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0189  glutathione-dependent formaldehyde-activating, GFA  26.15 
 
 
168 aa  50.8  0.000006  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.779012 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0403  hypothetical protein  26.77 
 
 
135 aa  50.8  0.000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.140726  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1582  glutathione-dependent formaldehyde-activating, GFA  24.35 
 
 
135 aa  50.8  0.000006  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.625923  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1511  hypothetical protein  21.31 
 
 
137 aa  50.8  0.000006  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.401586  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0332  glutathione-dependent formaldehyde-activating, GFA  26.79 
 
 
213 aa  50.8  0.000006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.989164  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0815  glutathione-dependent formaldehyde-activating, GFA  26.79 
 
 
136 aa  50.8  0.000006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3816  glutathione-dependent formaldehyde-activating, GFA  26.72 
 
 
130 aa  50.8  0.000006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.496132  normal  0.533485 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1891  glutathione-dependent formaldehyde-activating GFA  28.32 
 
 
124 aa  50.4  0.000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.0984276 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3058  glutathione-dependent formaldehyde-activating GFA  24.81 
 
 
131 aa  50.8  0.000007  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0784  glutathione-dependent formaldehyde-activating GFA  26.79 
 
 
136 aa  50.8  0.000007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3908  glutathione-dependent formaldehyde-activating, GFA  26.55 
 
 
136 aa  50.1  0.000009  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3234  hypothetical protein  28.32 
 
 
135 aa  50.1  0.00001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3548  hypothetical protein  29.31 
 
 
129 aa  50.1  0.00001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3220  hypothetical protein  28.32 
 
 
135 aa  50.1  0.00001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.275931  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>