122 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rfer_2472 on replicon NC_007908
Organism: Rhodoferax ferrireducens T118



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007908  Rfer_2472  hydroxyethylthiazole kinase  100 
 
 		 277 aa  555  1e-157  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.304509  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2206  hydroxyethylthiazole kinase  72.26 
 
 		 295 aa  364  1e-100  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.509945 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3494  hydroxyethylthiazole kinase  50.95 
 
 		 268 aa  257  2e-67  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.862853  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4826  hydroxyethylthiazole kinase  51.5 
 
 		 265 aa  239  4e-62  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10863  probable hydroxyethylthiazole kinase  45.32 
 
 		 263 aa  236  3e-61  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.673322  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3507  hydroxyethylthiazole kinase  47.1 
 
 		 268 aa  224  1e-57  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.115865  normal  0.405546 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000868  hydroxyethylthiazole kinase  47.89 
 
 		 263 aa  224  1e-57  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06843  hydroxyethylthiazole kinase  47.71 
 
 		 263 aa  223  3e-57  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1933  hydroxyethylthiazole kinase  50.19 
 
 		 267 aa  222  4e-57  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0749  hydroxyethylthiazole kinase  46.9 
 
 		 274 aa  218  1e-55  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0491  hydroxyethylthiazole kinase  46.12 
 
 		 264 aa  215  5e-55  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0362  hydroxyethylthiazole kinase  44.57 
 
 		 268 aa  210  2e-53  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0376  hydroxyethylthiazole kinase  44.57 
 
 		 268 aa  210  2e-53  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0357  hydroxyethylthiazole kinase  42.65 
 
 		 269 aa  210  2e-53  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0419  hydroxyethylthiazole kinase  44.57 
 
 		 268 aa  210  2e-53  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0486  hydroxyethylthiazole kinase  42.22 
 
 		 268 aa  209  5e-53  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1939  hydroxyethylthiazole kinase  46.69 
 
 		 269 aa  208  6e-53  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0452218  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0899  hydroxyethylthiazole kinase  49.25 
 
 		 267 aa  208  9e-53  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.649286  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0439  hydroxyethylthiazole kinase  42.38 
 
 		 269 aa  207  1e-52  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0352  hydroxyethylthiazole kinase  43.8 
 
 		 268 aa  207  2e-52  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1990  hydroxyethylthiazole kinase  42.21 
 
 		 273 aa  207  2e-52  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0930  hydroxyethylthiazole kinase  49.19 
 
 		 271 aa  206  3e-52  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0358474  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0348  hydroxyethylthiazole kinase  43.8 
 
 		 268 aa  206  4e-52  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0486  hydroxyethylthiazole kinase  43.8 
 
 		 268 aa  206  4e-52  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4885  hydroxyethylthiazole kinase  41.64 
 
 		 269 aa  203  3e-51  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0567  hydroxyethylthiazole kinase  43.41 
 
 		 263 aa  202  6e-51  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00000549254  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3165  hydroxyethylthiazole kinase  44.96 
 
 		 278 aa  201  9.999999999999999e-51  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0315824  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0062  hydroxyethylthiazole kinase  40.91 
 
 		 266 aa  200  1.9999999999999998e-50  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.0462865  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3006  hydroxyethylthiazole kinase  48.67 
 
 		 267 aa  200  1.9999999999999998e-50  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0363  hydroxyethylthiazole kinase  41.64 
 
 		 269 aa  199  3e-50  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0460  hydroxyethylthiazole kinase  40.61 
 
 		 266 aa  197  1.0000000000000001e-49  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.060098  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1656  hypothetical protein  47.27 
 
 		 264 aa  196  3e-49  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.0000090877 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2217  hydroxyethylthiazole kinase  43.65 
 
 		 275 aa  196  4.0000000000000005e-49  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.46369 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0447  hydroxyethylthiazole kinase  40.23 
 
 		 266 aa  195  6e-49  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0389  hydroxyethylthiazole kinase  41.13 
 
 		 266 aa  194  1e-48  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.320228 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2373  hydroxyethylthiazole kinase  45.7 
 
 		 267 aa  191  1e-47  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0049  Hydroxyethylthiazole kinase  41.06 
 
 		 264 aa  190  2e-47  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.144065  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2017  hydroxyethylthiazole kinase  47.35 
 
 		 267 aa  190  2e-47  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.580215  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2104  hydroxyethylthiazole kinase  45.45 
 
 		 268 aa  190  2.9999999999999997e-47  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.19692 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4122  hydroxyethylthiazole kinase  48.16 
 
 		 270 aa  190  2.9999999999999997e-47  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00156623 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1530  hydroxyethylthiazole kinase  39.46 
 
 		 266 aa  190  2.9999999999999997e-47  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3319  hydroxyethylthiazole kinase  41.25 
 
 		 261 aa  188  5.999999999999999e-47  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.471859  normal  0.0259997 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1154  hydroxyethylthiazole kinase  41.22 
 
 		 276 aa  188  5.999999999999999e-47  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00703913  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1926  hydroxyethylthiazole kinase  46.94 
 
 		 270 aa  188  7e-47  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0120598 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5775  Hydroxyethylthiazole kinase  44.11 
 
 		 267 aa  187  2e-46  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.100897  normal  0.15997 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2519  Hydroxyethylthiazole kinase  41.6 
 
 		 267 aa  187  2e-46  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6679  hydroxyethylthiazole kinase  44.44 
 
 		 267 aa  185  7e-46  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.788908 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1378  hydroxyethylthiazole kinase  49.4 
 
 		 266 aa  182  7e-45  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00000119483  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2345  hydroxyethylthiazole kinase  43.98 
 
 		 269 aa  178  7e-44  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2055  hydroxyethylthiazole kinase  42.35 
 
 		 266 aa  176  3e-43  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.476582 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0583  hydroxyethylthiazole kinase  44.4 
 
 		 262 aa  176  5e-43  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0534582  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0467  Hydroxyethylthiazole kinase  43.48 
 
 		 285 aa  176  5e-43  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0479  hydroxyethylthiazole kinase  49.53 
 
 		 273 aa  175  6e-43  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.702409  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2302  hydroxyethylthiazole kinase  44.79 
 
 		 262 aa  174  1.9999999999999998e-42  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.120755 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0649  putative hydoxyethylthiazole kinase  44.79 
 
 		 262 aa  173  2.9999999999999996e-42  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.223409  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0092  hydroxyethylthiazole kinase  40.16 
 
 		 266 aa  172  5e-42  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0830  hydroxyethylthiazole kinase  40.88 
 
 		 266 aa  172  5e-42  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1692  hydroxyethylthiazole kinase  41.73 
 
 		 265 aa  171  2e-41  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0343927  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_09350  hydroxyethylthiazole kinase  43.4 
 
 		 280 aa  169  4e-41  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  0.356837 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2790  hydroxyethylthiazole kinase  48.65 
 
 		 267 aa  169  5e-41  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0546464  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1175  Hydroxyethylthiazole kinase  37.74 
 
 		 267 aa  169  5e-41  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.83623  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2712  hydroxyethylthiazole kinase  42.68 
 
 		 262 aa  167  1e-40  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.751353  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5186  Hydroxyethylthiazole kinase  40.88 
 
 		 265 aa  166  4e-40  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2483  Hydroxyethylthiazole kinase  37.15 
 
 		 273 aa  166  4e-40  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_2016  Hydroxyethylthiazole kinase  40.29 
 
 		 271 aa  166  5.9999999999999996e-40  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  hitchhiker  0.00456451  normal  0.0136964 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0594  hydroxyethylthiazole kinase  37.79 
 
 		 266 aa  165  8e-40  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2980  hydroxyethylthiazole kinase  40.57 
 
 		 264 aa  165  8e-40  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3083  hydroxyethylthiazole kinase  39.84 
 
 		 262 aa  164  2.0000000000000002e-39  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.150144 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0648  hydroxyethylthiazole kinase  43.88 
 
 		 266 aa  162  5.0000000000000005e-39  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1300  hydroxyethylthiazole kinase  40.57 
 
 		 264 aa  161  8.000000000000001e-39  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.467489  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_10472  thiamine biosynthetic bifunctional enzyme, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G08970)  37.94 
 
 		 519 aa  161  1e-38  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.182627  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2063  hydroxyethylthiazole kinase  42.64 
 
 		 278 aa  161  1e-38  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0960486  normal  0.0682861 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1544  hydroxyethylthiazole kinase  32.18 
 
 		 265 aa  160  3e-38  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.101569  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0262  hydroxyethylthiazole kinase  44.19 
 
 		 279 aa  157  2e-37  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1181  Hydroxyethylthiazole kinase  40.91 
 
 		 257 aa  157  2e-37  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.175871  hitchhiker  0.00376241 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2711  hydroxyethylthiazole kinase  39.42 
 
 		 256 aa  156  4e-37  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.144055  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0960  hydroxyethylthiazole kinase  40.65 
 
 		 262 aa  155  5.0000000000000005e-37  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1134  hydroxyethylthiazole kinase  40.24 
 
 		 262 aa  155  8e-37  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2444  hydroxyethylthiazole kinase  39.21 
 
 		 270 aa  154  1e-36  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0469362  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02032  hydroxyethylthiazole kinase  39.84 
 
 		 262 aa  153  2e-36  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1553  Hydroxyethylthiazole kinase  39.84 
 
 		 262 aa  153  2e-36  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2240  hydroxyethylthiazole kinase  39.84 
 
 		 262 aa  153  2e-36  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2392  hydroxyethylthiazole kinase  40.24 
 
 		 262 aa  154  2e-36  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1543  hydroxyethylthiazole kinase  39.84 
 
 		 262 aa  153  2e-36  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01996  hypothetical protein  39.84 
 
 		 262 aa  153  2e-36  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1190  hydroxyethylthiazole kinase  39.52 
 
 		 264 aa  150  2e-35  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.321721  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3578  hydroxyethylthiazole kinase  41.22 
 
 		 264 aa  148  8e-35  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.390914 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_02960  hydroxyethylthiazole kinase  40.86 
 
 		 272 aa  148  1.0000000000000001e-34  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2129  hydroxyethylthiazole kinase  34.36 
 
 		 263 aa  146  3e-34  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00169037  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2167  hydroxyethylthiazole kinase  34.36 
 
 		 263 aa  146  3e-34  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0205075  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1337  hydroxyethylthiazole kinase  30.27 
 
 		 265 aa  146  4.0000000000000006e-34  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0159699  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0841  hydroxyethylthiazole kinase  40.41 
 
 		 256 aa  142  4e-33  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1158  thiamine-phosphate diphosphorylase  38.71 
 
 		 525 aa  140  3e-32  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00817075 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1671  hydroxyethylthiazole kinase  39.15 
 
 		 269 aa  139  3.9999999999999997e-32  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.43536 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1123  hydroxyethylthiazole kinase  32.43 
 
 		 260 aa  139  6e-32  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2383  hydroxyethylthiazole kinase  39.59 
 
 		 265 aa  138  8.999999999999999e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.816494 
 
 
-
 
NC_006694  CNI03710  thiamine biosynthetic bifunctional enzyme, putative  33.78 
 
 		 555 aa  138  1e-31  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.036727  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2491  hydroxyethylthiazole kinase  39.59 
 
 		 265 aa  138  1e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2334  hydroxyethylthiazole kinase  39.18 
 
 		 265 aa  137  2e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.474339  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0640  hydroxyethylthiazole kinase  33.71 
 
 		 266 aa  136  3.0000000000000003e-31  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.145272  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>