123 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene DvMF_3006 on replicon NC_011769
Organism: Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011769  DvMF_3006  hydroxyethylthiazole kinase  100 
 
 
267 aa  523  1e-147  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0899  hydroxyethylthiazole kinase  69.55 
 
 
267 aa  313  9.999999999999999e-85  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.649286  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1378  hydroxyethylthiazole kinase  61.65 
 
 
266 aa  298  6e-80  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00000119483  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0049  Hydroxyethylthiazole kinase  46.33 
 
 
264 aa  249  3e-65  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.144065  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3494  hydroxyethylthiazole kinase  48.87 
 
 
268 aa  246  2e-64  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.862853  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0930  hydroxyethylthiazole kinase  50.39 
 
 
271 aa  241  1e-62  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0358474  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3507  hydroxyethylthiazole kinase  49.22 
 
 
268 aa  239  4e-62  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.115865  normal  0.405546 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3165  hydroxyethylthiazole kinase  47.73 
 
 
278 aa  237  1e-61  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0315824  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10863  probable hydroxyethylthiazole kinase  47.11 
 
 
263 aa  231  6e-60  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.673322  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4826  hydroxyethylthiazole kinase  51.37 
 
 
265 aa  231  6e-60  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000868  hydroxyethylthiazole kinase  46.15 
 
 
263 aa  229  4e-59  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0460  hydroxyethylthiazole kinase  44.11 
 
 
266 aa  226  2e-58  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.060098  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2373  hydroxyethylthiazole kinase  46.46 
 
 
267 aa  221  7e-57  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0491  hydroxyethylthiazole kinase  44.27 
 
 
264 aa  221  7e-57  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0447  hydroxyethylthiazole kinase  42.59 
 
 
266 aa  220  1.9999999999999999e-56  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0389  hydroxyethylthiazole kinase  42.59 
 
 
266 aa  220  1.9999999999999999e-56  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal  0.320228 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06843  hydroxyethylthiazole kinase  45.63 
 
 
263 aa  220  1.9999999999999999e-56  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2472  hydroxyethylthiazole kinase  51.03 
 
 
277 aa  219  3e-56  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.304509  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2104  hydroxyethylthiazole kinase  51.5 
 
 
268 aa  216  2e-55  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.19692 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1530  hydroxyethylthiazole kinase  41.44 
 
 
266 aa  215  5.9999999999999996e-55  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0749  hydroxyethylthiazole kinase  45.45 
 
 
274 aa  213  2.9999999999999995e-54  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2217  hydroxyethylthiazole kinase  42.69 
 
 
275 aa  210  2e-53  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.46369 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5775  Hydroxyethylthiazole kinase  50.59 
 
 
267 aa  207  1e-52  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.100897  normal  0.15997 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0062  hydroxyethylthiazole kinase  39.45 
 
 
266 aa  206  3e-52  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.0462865  normal 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6679  hydroxyethylthiazole kinase  49.8 
 
 
267 aa  205  6e-52  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.788908 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1154  hydroxyethylthiazole kinase  39.18 
 
 
276 aa  204  1e-51  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00703913  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1990  hydroxyethylthiazole kinase  39.26 
 
 
273 aa  204  1e-51  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2206  hydroxyethylthiazole kinase  46.77 
 
 
295 aa  202  4e-51  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.509945 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1656  hypothetical protein  41.34 
 
 
264 aa  201  8e-51  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  hitchhiker  0.0000090877 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0567  hydroxyethylthiazole kinase  40.78 
 
 
263 aa  201  8e-51  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00000549254  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1926  hydroxyethylthiazole kinase  44.49 
 
 
270 aa  200  1.9999999999999998e-50  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0120598 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4122  hydroxyethylthiazole kinase  45.42 
 
 
270 aa  199  3e-50  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00156623 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1933  hydroxyethylthiazole kinase  45.1 
 
 
267 aa  199  5e-50  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4885  hydroxyethylthiazole kinase  40.15 
 
 
269 aa  197  2.0000000000000003e-49  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1939  hydroxyethylthiazole kinase  42.35 
 
 
269 aa  196  3e-49  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0452218  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3319  hydroxyethylthiazole kinase  40.4 
 
 
261 aa  195  7e-49  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.471859  normal  0.0259997 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0092  hydroxyethylthiazole kinase  39.22 
 
 
266 aa  195  7e-49  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0362  hydroxyethylthiazole kinase  38.64 
 
 
268 aa  194  9e-49  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0352  hydroxyethylthiazole kinase  39.02 
 
 
268 aa  194  9e-49  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0376  hydroxyethylthiazole kinase  38.64 
 
 
268 aa  194  9e-49  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0419  hydroxyethylthiazole kinase  38.64 
 
 
268 aa  194  9e-49  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0357  hydroxyethylthiazole kinase  38.64 
 
 
269 aa  194  1e-48  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0348  hydroxyethylthiazole kinase  39.02 
 
 
268 aa  194  2e-48  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0479  hydroxyethylthiazole kinase  48.22 
 
 
273 aa  194  2e-48  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.702409  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2017  hydroxyethylthiazole kinase  40.15 
 
 
267 aa  192  6e-48  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.580215  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0486  hydroxyethylthiazole kinase  38.26 
 
 
268 aa  191  7e-48  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0439  hydroxyethylthiazole kinase  38.64 
 
 
269 aa  191  8e-48  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0363  hydroxyethylthiazole kinase  40 
 
 
269 aa  191  9e-48  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0486  hydroxyethylthiazole kinase  39.69 
 
 
268 aa  190  2e-47  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2055  hydroxyethylthiazole kinase  43.6 
 
 
266 aa  190  2.9999999999999997e-47  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.476582 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2712  hydroxyethylthiazole kinase  46.41 
 
 
262 aa  189  5.999999999999999e-47  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.751353  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2302  hydroxyethylthiazole kinase  47.54 
 
 
262 aa  187  2e-46  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.120755 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2345  hydroxyethylthiazole kinase  43.18 
 
 
269 aa  185  7e-46  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2519  Hydroxyethylthiazole kinase  39.69 
 
 
267 aa  184  9e-46  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_09350  hydroxyethylthiazole kinase  45.45 
 
 
280 aa  184  1.0000000000000001e-45  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal  0.356837 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0649  putative hydoxyethylthiazole kinase  47.13 
 
 
262 aa  184  2.0000000000000003e-45  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.223409  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0830  hydroxyethylthiazole kinase  41.11 
 
 
266 aa  181  8.000000000000001e-45  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0594  hydroxyethylthiazole kinase  38.22 
 
 
266 aa  180  2e-44  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3578  hydroxyethylthiazole kinase  44.72 
 
 
264 aa  180  2e-44  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.390914 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1692  hydroxyethylthiazole kinase  44.67 
 
 
265 aa  180  2e-44  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0343927  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_2016  Hydroxyethylthiazole kinase  43.08 
 
 
271 aa  179  2.9999999999999997e-44  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  hitchhiker  0.00456451  normal  0.0136964 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3083  hydroxyethylthiazole kinase  43.48 
 
 
262 aa  180  2.9999999999999997e-44  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.150144 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1134  hydroxyethylthiazole kinase  43.08 
 
 
262 aa  176  3e-43  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0262  hydroxyethylthiazole kinase  44.44 
 
 
279 aa  176  5e-43  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2980  hydroxyethylthiazole kinase  41.8 
 
 
264 aa  175  7e-43  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02032  hydroxyethylthiazole kinase  43.39 
 
 
262 aa  174  9.999999999999999e-43  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1553  Hydroxyethylthiazole kinase  43.39 
 
 
262 aa  174  9.999999999999999e-43  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2063  hydroxyethylthiazole kinase  44.28 
 
 
278 aa  174  9.999999999999999e-43  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0960486  normal  0.0682861 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2711  hydroxyethylthiazole kinase  43.75 
 
 
256 aa  174  9.999999999999999e-43  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.144055  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2240  hydroxyethylthiazole kinase  43.39 
 
 
262 aa  174  9.999999999999999e-43  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1543  hydroxyethylthiazole kinase  43.39 
 
 
262 aa  174  9.999999999999999e-43  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01996  hypothetical protein  43.39 
 
 
262 aa  174  9.999999999999999e-43  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1190  hydroxyethylthiazole kinase  45.93 
 
 
264 aa  174  9.999999999999999e-43  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.321721  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1300  hydroxyethylthiazole kinase  41.39 
 
 
264 aa  173  1.9999999999999998e-42  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.467489  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0960  hydroxyethylthiazole kinase  43.75 
 
 
262 aa  173  1.9999999999999998e-42  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0583  hydroxyethylthiazole kinase  46.37 
 
 
262 aa  173  2.9999999999999996e-42  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0534582  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5186  Hydroxyethylthiazole kinase  43.82 
 
 
265 aa  172  3.9999999999999995e-42  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2790  hydroxyethylthiazole kinase  45.27 
 
 
267 aa  171  9e-42  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0546464  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2392  hydroxyethylthiazole kinase  42.92 
 
 
262 aa  170  2e-41  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1671  hydroxyethylthiazole kinase  40.86 
 
 
269 aa  169  3e-41  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.43536 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2334  hydroxyethylthiazole kinase  44.58 
 
 
265 aa  169  4e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.474339  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2491  hydroxyethylthiazole kinase  44.17 
 
 
265 aa  169  5e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2379  hydroxyethylthiazole kinase  44.4 
 
 
265 aa  169  6e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.325107  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2290  hydroxyethylthiazole kinase  44.58 
 
 
265 aa  168  8e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.61852  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2383  hydroxyethylthiazole kinase  44.17 
 
 
265 aa  167  1e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.816494 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2483  Hydroxyethylthiazole kinase  35.43 
 
 
273 aa  166  5e-40  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1181  Hydroxyethylthiazole kinase  41.25 
 
 
257 aa  163  3e-39  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.175871  hitchhiker  0.00376241 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0467  Hydroxyethylthiazole kinase  43.53 
 
 
285 aa  163  3e-39  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_10472  thiamine biosynthetic bifunctional enzyme, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G08970)  40.24 
 
 
519 aa  162  6e-39  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.182627  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0648  hydroxyethylthiazole kinase  41.25 
 
 
266 aa  162  6e-39  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1175  Hydroxyethylthiazole kinase  34.87 
 
 
267 aa  159  4e-38  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.83623  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2444  hydroxyethylthiazole kinase  41.06 
 
 
270 aa  159  6e-38  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0469362  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2129  hydroxyethylthiazole kinase  33.98 
 
 
263 aa  155  9e-37  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00169037  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2167  hydroxyethylthiazole kinase  33.98 
 
 
263 aa  155  9e-37  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0205075  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1123  hydroxyethylthiazole kinase  32.94 
 
 
260 aa  154  1e-36  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_27360  hydroxyethylthiazole kinase, sugar kinase family  46.06 
 
 
268 aa  152  8e-36  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1544  hydroxyethylthiazole kinase  30.53 
 
 
265 aa  148  8e-35  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.101569  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1158  thiamine-phosphate diphosphorylase  38.89 
 
 
525 aa  144  1e-33  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00817075 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1699  hydroxyethylthiazole kinase  29.46 
 
 
262 aa  139  3.9999999999999997e-32  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1629  Hydroxyethylthiazole kinase  30.51 
 
 
273 aa  139  6e-32  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.158814  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>