More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene HMPREF0424_1158 on replicon NC_013721
Organism: Gardnerella vaginalis 409-05



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013721  HMPREF0424_1158  thiamine-phosphate diphosphorylase  100 
 
 		 525 aa  1083    Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00817075 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2980  hydroxyethylthiazole kinase  45.42 
 
 		 264 aa  199  1.0000000000000001e-49  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1300  hydroxyethylthiazole kinase  45.82 
 
 		 264 aa  198  3e-49  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.467489  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5186  Hydroxyethylthiazole kinase  45.85 
 
 		 265 aa  188  2e-46  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1134  hydroxyethylthiazole kinase  48.12 
 
 		 262 aa  188  2e-46  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3083  hydroxyethylthiazole kinase  47.28 
 
 		 262 aa  187  3e-46  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.150144 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0960  hydroxyethylthiazole kinase  48.12 
 
 		 262 aa  188  3e-46  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1181  Hydroxyethylthiazole kinase  43.37 
 
 		 257 aa  184  2.0000000000000003e-45  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.175871  hitchhiker  0.00376241 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02032  hydroxyethylthiazole kinase  47.28 
 
 		 262 aa  184  3e-45  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1553  Hydroxyethylthiazole kinase  47.28 
 
 		 262 aa  184  3e-45  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1543  hydroxyethylthiazole kinase  47.28 
 
 		 262 aa  184  3e-45  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2712  hydroxyethylthiazole kinase  45.04 
 
 		 262 aa  184  3e-45  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.751353  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01996  hypothetical protein  47.28 
 
 		 262 aa  184  3e-45  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2240  hydroxyethylthiazole kinase  47.28 
 
 		 262 aa  184  3e-45  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2711  hydroxyethylthiazole kinase  45.93 
 
 		 256 aa  184  4.0000000000000006e-45  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.144055  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0049  Hydroxyethylthiazole kinase  42.19 
 
 		 264 aa  181  2.9999999999999997e-44  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.144065  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1190  hydroxyethylthiazole kinase  44.22 
 
 		 264 aa  179  1e-43  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.321721  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2392  hydroxyethylthiazole kinase  46.86 
 
 		 262 aa  179  1e-43  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3578  hydroxyethylthiazole kinase  44.84 
 
 		 264 aa  177  6e-43  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.390914 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3507  hydroxyethylthiazole kinase  41.76 
 
 		 268 aa  175  9.999999999999999e-43  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.115865  normal  0.405546 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2383  hydroxyethylthiazole kinase  44.76 
 
 		 265 aa  174  2.9999999999999996e-42  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.816494 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2334  hydroxyethylthiazole kinase  44.76 
 
 		 265 aa  173  6.999999999999999e-42  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.474339  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2491  hydroxyethylthiazole kinase  44.76 
 
 		 265 aa  173  6.999999999999999e-42  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2379  hydroxyethylthiazole kinase  44.35 
 
 		 265 aa  172  1e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.325107  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2290  hydroxyethylthiazole kinase  43.95 
 
 		 265 aa  171  3e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.61852  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_2016  Hydroxyethylthiazole kinase  40.87 
 
 		 271 aa  169  2e-40  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  hitchhiker  0.00456451  normal  0.0136964 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3494  hydroxyethylthiazole kinase  43.15 
 
 		 268 aa  168  2e-40  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.862853  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10863  probable hydroxyethylthiazole kinase  38.61 
 
 		 263 aa  168  2e-40  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.673322  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6679  hydroxyethylthiazole kinase  42.28 
 
 		 267 aa  158  2e-37  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.788908 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5775  Hydroxyethylthiazole kinase  41.94 
 
 		 267 aa  156  7e-37  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.100897  normal  0.15997 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0649  putative hydoxyethylthiazole kinase  44.13 
 
 		 262 aa  155  2e-36  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.223409  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06843  hydroxyethylthiazole kinase  39.45 
 
 		 263 aa  153  5.9999999999999996e-36  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2302  hydroxyethylthiazole kinase  43.72 
 
 		 262 aa  152  1e-35  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.120755 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0899  hydroxyethylthiazole kinase  39.92 
 
 		 267 aa  152  2e-35  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.649286  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000868  hydroxyethylthiazole kinase  39.45 
 
 		 263 aa  151  3e-35  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4826  hydroxyethylthiazole kinase  38.08 
 
 		 265 aa  150  4e-35  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0830  hydroxyethylthiazole kinase  36.54 
 
 		 266 aa  149  1.0000000000000001e-34  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1378  hydroxyethylthiazole kinase  41.8 
 
 		 266 aa  149  1.0000000000000001e-34  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00000119483  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2206  hydroxyethylthiazole kinase  39.17 
 
 		 295 aa  147  5e-34  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.509945 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0583  hydroxyethylthiazole kinase  42.23 
 
 		 262 aa  145  2e-33  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0534582  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_02960  hydroxyethylthiazole kinase  40.32 
 
 		 272 aa  145  2e-33  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2519  Hydroxyethylthiazole kinase  38.58 
 
 		 267 aa  144  5e-33  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1154  hydroxyethylthiazole kinase  35 
 
 		 276 aa  144  6e-33  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00703913  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_27360  hydroxyethylthiazole kinase, sugar kinase family  40.64 
 
 		 268 aa  142  9.999999999999999e-33  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0852  Hydroxyethylthiazole kinase  48.1 
 
 		 275 aa  142  1.9999999999999998e-32  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.327863  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2345  hydroxyethylthiazole kinase  38.04 
 
 		 269 aa  141  1.9999999999999998e-32  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0357  hydroxyethylthiazole kinase  33.09 
 
 		 269 aa  141  3e-32  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0363  hydroxyethylthiazole kinase  32.71 
 
 		 269 aa  140  7e-32  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1671  hydroxyethylthiazole kinase  36.29 
 
 		 269 aa  139  1e-31  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.43536 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1939  hydroxyethylthiazole kinase  35.19 
 
 		 269 aa  139  1e-31  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0452218  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0439  hydroxyethylthiazole kinase  32.23 
 
 		 269 aa  139  2e-31  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1699  hydroxyethylthiazole kinase  31.87 
 
 		 262 aa  137  4e-31  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0486  hydroxyethylthiazole kinase  31.87 
 
 		 268 aa  137  5e-31  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0491  hydroxyethylthiazole kinase  37.11 
 
 		 264 aa  137  6.0000000000000005e-31  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0567  hydroxyethylthiazole kinase  34.25 
 
 		 263 aa  137  7.000000000000001e-31  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00000549254  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0930  hydroxyethylthiazole kinase  36.58 
 
 		 271 aa  136  8e-31  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0358474  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0362  hydroxyethylthiazole kinase  31.14 
 
 		 268 aa  136  9e-31  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0376  hydroxyethylthiazole kinase  31.14 
 
 		 268 aa  136  9e-31  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0419  hydroxyethylthiazole kinase  31.14 
 
 		 268 aa  136  9e-31  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4885  hydroxyethylthiazole kinase  32.12 
 
 		 269 aa  136  9e-31  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0352  hydroxyethylthiazole kinase  31.5 
 
 		 268 aa  135  1.9999999999999998e-30  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2483  Hydroxyethylthiazole kinase  31.8 
 
 		 273 aa  135  1.9999999999999998e-30  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0640  hydroxyethylthiazole kinase  35.74 
 
 		 266 aa  135  1.9999999999999998e-30  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.145272  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0348  hydroxyethylthiazole kinase  31.14 
 
 		 268 aa  134  3e-30  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2472  hydroxyethylthiazole kinase  38.37 
 
 		 277 aa  134  3.9999999999999996e-30  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.304509  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0486  hydroxyethylthiazole kinase  31.5 
 
 		 268 aa  133  6.999999999999999e-30  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0460  hydroxyethylthiazole kinase  32.8 
 
 		 266 aa  132  1.0000000000000001e-29  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.060098  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2063  hydroxyethylthiazole kinase  37.16 
 
 		 278 aa  132  2.0000000000000002e-29  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0960486  normal  0.0682861 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1656  hypothetical protein  35.29 
 
 		 264 aa  132  2.0000000000000002e-29  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.0000090877 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1634  Hydroxyethylthiazole kinase  45.23 
 
 		 279 aa  131  3e-29  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.137176  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2167  hydroxyethylthiazole kinase  34 
 
 		 263 aa  131  4.0000000000000003e-29  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0205075  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2129  hydroxyethylthiazole kinase  34 
 
 		 263 aa  131  4.0000000000000003e-29  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00169037  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_09350  hydroxyethylthiazole kinase  35.32 
 
 		 280 aa  129  1.0000000000000001e-28  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  0.356837 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0594  hydroxyethylthiazole kinase  36.68 
 
 		 266 aa  129  2.0000000000000002e-28  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3006  hydroxyethylthiazole kinase  38.49 
 
 		 267 aa  127  4.0000000000000003e-28  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3165  hydroxyethylthiazole kinase  34.35 
 
 		 278 aa  127  4.0000000000000003e-28  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0315824  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2017  hydroxyethylthiazole kinase  35.06 
 
 		 267 aa  125  2e-27  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.580215  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1990  hydroxyethylthiazole kinase  33.21 
 
 		 273 aa  125  2e-27  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1810  Hydroxyethylthiazole kinase  36.13 
 
 		 280 aa  124  5e-27  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.188354  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0841  hydroxyethylthiazole kinase  34 
 
 		 256 aa  124  6e-27  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0467  Hydroxyethylthiazole kinase  33.08 
 
 		 285 aa  124  6e-27  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0749  hydroxyethylthiazole kinase  37.1 
 
 		 274 aa  123  7e-27  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1123  hydroxyethylthiazole kinase  32.81 
 
 		 260 aa  123  7e-27  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0092  hydroxyethylthiazole kinase  32.28 
 
 		 266 aa  122  9.999999999999999e-27  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2373  hydroxyethylthiazole kinase  36.65 
 
 		 267 aa  123  9.999999999999999e-27  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_10472  thiamine biosynthetic bifunctional enzyme, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G08970)  32.95 
 
 		 519 aa  122  1.9999999999999998e-26  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.182627  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1926  hydroxyethylthiazole kinase  37.21 
 
 		 270 aa  122  1.9999999999999998e-26  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0120598 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0389  hydroxyethylthiazole kinase  31.91 
 
 		 266 aa  121  3e-26  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.320228 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0062  hydroxyethylthiazole kinase  31.97 
 
 		 266 aa  121  3e-26  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.0462865  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1013  hydroxyethylthiazole kinase  32.26 
 
 		 269 aa  120  4.9999999999999996e-26  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2104  hydroxyethylthiazole kinase  37.17 
 
 		 268 aa  120  9e-26  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.19692 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1933  hydroxyethylthiazole kinase  33.2 
 
 		 267 aa  120  9e-26  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0447  hydroxyethylthiazole kinase  30.83 
 
 		 266 aa  120  9e-26  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1175  Hydroxyethylthiazole kinase  30.94 
 
 		 267 aa  119  9.999999999999999e-26  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.83623  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0133  hydroxyethylthiazole kinase  32.73 
 
 		 314 aa  119  9.999999999999999e-26  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0190857  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1530  hydroxyethylthiazole kinase  31.52 
 
 		 266 aa  119  9.999999999999999e-26  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0262  hydroxyethylthiazole kinase  34.77 
 
 		 279 aa  117  3.9999999999999997e-25  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3319  hydroxyethylthiazole kinase  30.12 
 
 		 261 aa  117  6e-25  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.471859  normal  0.0259997 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4122  hydroxyethylthiazole kinase  36.28 
 
 		 270 aa  116  1.0000000000000001e-24  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00156623 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1629  Hydroxyethylthiazole kinase  29.28 
 
 		 273 aa  115  2.0000000000000002e-24  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.158814  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>