More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Reut_B5703 on replicon NC_007348
Organism: Ralstonia eutropha JMP134



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007348  Reut_B5703  putative NADPH:quinone reductase and related Zn-dependent oxidoreductase  100 
 
 
174 aa  353  5e-97  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.738334  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2359  alcohol dehydrogenase  72.27 
 
 
351 aa  185  3e-46  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.137767 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3064  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  64.29 
 
 
367 aa  166  2e-40  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2960  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  60.61 
 
 
367 aa  157  7e-38  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1861  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  52.1 
 
 
345 aa  129  2.0000000000000002e-29  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3201  NAD(P)H quinone oxidoreductase, PIG3 family  43.86 
 
 
324 aa  97.1  1e-19  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2529  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  42.11 
 
 
322 aa  90.1  1e-17  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0848  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  41.44 
 
 
343 aa  84.7  5e-16  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4130  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  40.57 
 
 
313 aa  84.7  6e-16  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2630  alcohol dehydrogenase  38.94 
 
 
339 aa  83.6  0.000000000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.380756  normal  0.317622 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6197  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  40.54 
 
 
343 aa  82.8  0.000000000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.892038  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2527  NAD(P)H quinone oxidoreductase, PIG3 family  39.47 
 
 
323 aa  82  0.000000000000003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.450235  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2827  alcohol dehydrogenase  38.05 
 
 
339 aa  82.4  0.000000000000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.582411  normal  0.0605973 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2398  zinc-binding alcohol dehydrogenase  41.23 
 
 
335 aa  81.6  0.000000000000005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.860037  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2450  alcohol dehydrogenase  41.53 
 
 
323 aa  81.6  0.000000000000006  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0783  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  36.89 
 
 
347 aa  78.2  0.00000000000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.604967  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1484  alcohol dehydrogenase  41.18 
 
 
322 aa  78.2  0.00000000000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0930  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  38.1 
 
 
324 aa  77.8  0.00000000000007  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5659  alcohol dehydrogenase  37.4 
 
 
329 aa  77.4  0.0000000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.591767 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6716  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  40.68 
 
 
324 aa  76.6  0.0000000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.177246  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3723  zinc-binding alcohol dehydrogenase  37.4 
 
 
329 aa  77.4  0.0000000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.250647  n/a   
 
 
-
 
NC_011682  PHATRDRAFT_37808  predicted protein  37.5 
 
 
453 aa  77  0.0000000000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4645  alcohol dehydrogenase  37.4 
 
 
329 aa  77.4  0.0000000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2218  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  42.86 
 
 
343 aa  76.6  0.0000000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2099  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  40.91 
 
 
324 aa  76.6  0.0000000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.287009  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4094  NAD(P)H quinone oxidoreductase, PIG3 family  40.19 
 
 
325 aa  76.3  0.0000000000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0753  zinc-binding alcohol dehydrogenase  39.62 
 
 
329 aa  76.3  0.0000000000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1952  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  38.79 
 
 
332 aa  75.5  0.0000000000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1807  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  39.68 
 
 
324 aa  75.1  0.0000000000004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4431  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  37.93 
 
 
352 aa  75.1  0.0000000000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.761355  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0840  quinone oxidoreductase putative PIG3  35.34 
 
 
341 aa  74.3  0.0000000000008  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2065  putative NADPH quinone oxidoreductase protein  40 
 
 
334 aa  73.6  0.000000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.465224  normal  0.69391 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2376  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  40.52 
 
 
322 aa  73.9  0.000000000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.487886  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7910  alcohol dehydrogenase GroES domain protein  38.1 
 
 
302 aa  73.6  0.000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.989573  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1821  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  36.84 
 
 
322 aa  73.9  0.000000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00168562  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0087  quinone oxidoreductase  37.5 
 
 
337 aa  73.9  0.000000000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0391  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  39.47 
 
 
335 aa  72.8  0.000000000002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.474725  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3406  zinc-binding alcohol dehydrogenase  33.9 
 
 
335 aa  72.8  0.000000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2114  alcohol dehydrogenase  37.84 
 
 
324 aa  72.8  0.000000000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1526  Alcohol dehydrogenase GroES domain-containing protein  37.17 
 
 
313 aa  72.8  0.000000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.97459 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0337  PIG3 family NAD(P)H quinone oxidoreductase  35.96 
 
 
338 aa  72.4  0.000000000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2075  alcohol dehydrogenase  40.34 
 
 
322 aa  72.4  0.000000000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0180  alcohol dehydrogenase  40 
 
 
325 aa  71.6  0.000000000005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2709  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain-containing protein  35.96 
 
 
327 aa  71.6  0.000000000006  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.344505 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0529  zinc-binding alcohol dehydrogenase  35.56 
 
 
325 aa  71.2  0.000000000007  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2123  oxidoreductase, zinc-binding dehydrogenase family  31.78 
 
 
328 aa  70.9  0.000000000008  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4105  zinc-binding alcohol dehydrogenase  36.67 
 
 
304 aa  70.9  0.000000000008  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2575  alcohol dehydrogenase  36.15 
 
 
332 aa  70.9  0.000000000009  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2194  quinone oxidoreductase  32.56 
 
 
328 aa  70.5  0.00000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0247156  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01063  Zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  37.74 
 
 
324 aa  70.1  0.00000000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.27847  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1245  PIG3 family NAD(P)H quinone oxidoreductase  34.75 
 
 
338 aa  70.5  0.00000000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.490679  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2092  quinone oxidoreductase putative PIG3  35.09 
 
 
332 aa  70.1  0.00000000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.187867  hitchhiker  0.000106437 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2406  zinc-binding alcohol dehydrogenase  35.88 
 
 
324 aa  70.5  0.00000000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4057  alcohol dehydrogenase  42.02 
 
 
332 aa  70.5  0.00000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.00526605  normal  0.609446 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7384  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  40.91 
 
 
325 aa  69.7  0.00000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5714  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  36.36 
 
 
340 aa  70.1  0.00000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3317  NAD(P)H quinone oxidoreductase, PIG3 family  32.5 
 
 
334 aa  69.3  0.00000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0942  zinc-binding alcohol dehydrogenase  42.98 
 
 
324 aa  69.7  0.00000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0332655  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1382  alcohol dehydrogenase  35.09 
 
 
334 aa  69.3  0.00000000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0197  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  38.68 
 
 
318 aa  68.9  0.00000000003  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2265  oxidoreductase, zinc-binding dehydrogenase family  31.78 
 
 
328 aa  68.9  0.00000000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.846418  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3191  oxidoreductase, zinc-binding dehydrogenase family  31.78 
 
 
328 aa  68.9  0.00000000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0472649  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0219  NAD(P)H quinone oxidoreductase, PIG3 family  34.91 
 
 
328 aa  68.9  0.00000000003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6401  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  33.98 
 
 
337 aa  68.9  0.00000000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.348721  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0364  zinc-binding alcohol dehydrogenase  37.93 
 
 
332 aa  68.2  0.00000000005  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.430047 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5242  alcohol dehydrogenase  38.93 
 
 
321 aa  68.2  0.00000000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.155449  normal  0.0558445 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2147  oxidoreductase, zinc-binding dehydrogenase family  31.78 
 
 
328 aa  68.2  0.00000000006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0261  NAD(P)H quinone oxidoreductase PIG3 family  38.89 
 
 
324 aa  68.2  0.00000000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1944  quinone oxidoreductase  31.78 
 
 
328 aa  67.8  0.00000000008  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0819038  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4272  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  39.62 
 
 
323 aa  67.8  0.00000000008  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0472622  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4375  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  39.62 
 
 
323 aa  67.8  0.00000000008  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.313231 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1367  zinc-binding alcohol dehydrogenase  38.79 
 
 
323 aa  67.8  0.00000000008  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.9935  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3903  alcohol dehydrogenase  39.62 
 
 
323 aa  67.8  0.00000000008  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.221632  normal  0.178635 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2397  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  39.32 
 
 
341 aa  67.4  0.00000000009  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0755319  decreased coverage  0.00145448 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0615  putative oxidoreductase  33.04 
 
 
305 aa  67.4  0.00000000009  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1826  NAD(P)H quinone oxidoreductase, PIG3 family  34.68 
 
 
336 aa  67.4  0.00000000009  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.448305 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2867  alcohol dehydrogenase  37.96 
 
 
333 aa  67.4  0.00000000009  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.686994  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1174  quinone oxidoreductase putative PIG3  33.62 
 
 
334 aa  67.4  0.00000000009  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1894  NAD(P)H quinone oxidoreductase, PIG3 family  35.04 
 
 
334 aa  67.4  0.0000000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0103733  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1957  alcohol dehydrogenase  36.84 
 
 
328 aa  67  0.0000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0178184  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1920  quinone oxidoreductase  31.01 
 
 
328 aa  66.6  0.0000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0539  alcohol dehydrogenase  37.63 
 
 
319 aa  67  0.0000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03489  quinone oxidoreductase  31.93 
 
 
316 aa  67.4  0.0000000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0872  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  37.93 
 
 
302 aa  67  0.0000000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.96562 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1171  alcohol dehydrogenase  40.54 
 
 
325 aa  67.4  0.0000000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.356223 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2217  NAD(P)H quinone oxidoreductase, PIG3 family  35.04 
 
 
334 aa  67.4  0.0000000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.573138 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1231  zinc-binding alcohol dehydrogenase  35.85 
 
 
319 aa  67  0.0000000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.727575  normal  0.278949 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3228  alcohol dehydrogenase  38.6 
 
 
324 aa  67.4  0.0000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.603844 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4513  alcohol dehydrogenase  40.32 
 
 
332 aa  66.6  0.0000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0282  NAD(P)H quinone oxidoreductase, PIG3 family  38.66 
 
 
317 aa  67  0.0000000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.221318  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1697  NAD(P)H quinone oxidoreductase, PIG3 family  35.48 
 
 
336 aa  67  0.0000000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2810  alcohol dehydrogenase  36.79 
 
 
325 aa  67.4  0.0000000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.48867  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0313  alcohol dehydrogenase  34.21 
 
 
326 aa  66.2  0.0000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0571  quinone oxidoreductase  39.47 
 
 
324 aa  66.2  0.0000000002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2228  putative quinone oxidoreductase  35.94 
 
 
322 aa  66.2  0.0000000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.806393  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5977  putative oxidoreductase  37.96 
 
 
325 aa  66.2  0.0000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1156  quinone oxidoreductase  34.86 
 
 
389 aa  66.6  0.0000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1159  alcohol dehydrogenase  38.95 
 
 
324 aa  66.6  0.0000000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0429235  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5710  alcohol dehydrogenase  38.32 
 
 
324 aa  66.6  0.0000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_69110  putative oxidoreductase  38.89 
 
 
325 aa  66.2  0.0000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>