More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rcas_1562 on replicon NC_009767
Organism: Roseiflexus castenholzii DSM 13941



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009767  Rcas_1562  S-adenosylmethionine synthetase  100 
 
 		 392 aa  806    Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0919  S-adenosylmethionine synthetase  87.34 
 
 		 396 aa  719    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.16882 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4899  S-adenosylmethionine synthetase  53.45 
 
 		 394 aa  443  1e-123  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.050537  normal  0.0132023 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3115  S-adenosylmethionine synthetase  52.5 
 
 		 410 aa  442  1e-123  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1303  S-adenosylmethionine synthetase  53.2 
 
 		 394 aa  441  1e-123  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3004  S-adenosylmethionine synthetase  52.25 
 
 		 410 aa  440  9.999999999999999e-123  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0036  S-adenosylmethionine synthetase  54.68 
 
 		 396 aa  435  1e-121  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0450  S-adenosylmethionine synthetase  49.87 
 
 		 397 aa  362  6e-99  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.67394  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4661  S-adenosylmethionine synthetase  44.01 
 
 		 420 aa  354  1e-96  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.778397  decreased coverage  0.00341152 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0445  S-adenosylmethionine synthetase  44.86 
 
 		 395 aa  351  1e-95  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.00000000309499  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2574  S-adenosylmethionine synthetase  45.75 
 
 		 395 aa  351  1e-95  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0485425  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2463  S-adenosylmethionine synthetase  45.15 
 
 		 417 aa  350  2e-95  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.328764  hitchhiker  0.00000000000157811 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09860  Methionine adenosyltransferase  47.12 
 
 		 402 aa  349  6e-95  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0780  S-adenosylmethionine synthetase  44.88 
 
 		 420 aa  348  8e-95  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.0000106532  hitchhiker  0.000013186 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2251  methionine adenosyltransferase  44.72 
 
 		 397 aa  348  1e-94  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.0000000460807  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3096  methionine adenosyltransferase  45.3 
 
 		 397 aa  347  3e-94  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3478  S-adenosylmethionine synthetase  43.17 
 
 		 418 aa  345  6e-94  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.575314 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0894  S-adenosylmethionine synthetase  45.75 
 
 		 395 aa  344  1e-93  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000969915  normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_03451  S-adenosylmethionine synthetase  46 
 
 		 410 aa  344  1e-93  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.536517  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0686  S-adenosylmethionine synthetase  45.04 
 
 		 396 aa  345  1e-93  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000273015  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4132  S-adenosylmethionine synthetase  44.55 
 
 		 421 aa  344  2e-93  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  unclonable  0.00000371992  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1858  S-adenosylmethionine synthetase  44.01 
 
 		 422 aa  343  2.9999999999999997e-93  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1832  S-adenosylmethionine synthetase  44.01 
 
 		 422 aa  343  2.9999999999999997e-93  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2777  S-adenosylmethionine synthetase  45.11 
 
 		 403 aa  341  1e-92  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000102854  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1071  S-adenosylmethionine synthetase  46.72 
 
 		 393 aa  341  1e-92  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0298396  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3891  S-adenosylmethionine synthetase  45.73 
 
 		 396 aa  340  2e-92  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00109689  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3981  S-adenosylmethionine synthetase  45.41 
 
 		 396 aa  340  2e-92  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00000348916  hitchhiker  0.00000146833 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_22181  S-adenosylmethionine synthetase  45.43 
 
 		 419 aa  340  2e-92  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2084  methionine adenosyltransferase  45.3 
 
 		 395 aa  337  9.999999999999999e-92  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.191002  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0659  S-adenosylmethionine synthetase  44.42 
 
 		 403 aa  337  1.9999999999999998e-91  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_03361  S-adenosylmethionine synthetase  44.42 
 
 		 413 aa  336  2.9999999999999997e-91  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_03441  S-adenosylmethionine synthetase  45.02 
 
 		 413 aa  335  7.999999999999999e-91  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3874  methionine adenosyltransferase  42.12 
 
 		 396 aa  335  1e-90  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.00000696498  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1687  S-adenosylmethionine synthetase  43.77 
 
 		 409 aa  333  2e-90  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_04001  S-adenosylmethionine synthetase  43.77 
 
 		 409 aa  334  2e-90  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.222949 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0317  S-adenosylmethionine synthetase  44.42 
 
 		 413 aa  333  3e-90  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0456  S-adenosylmethionine synthetase  43.39 
 
 		 402 aa  332  8e-90  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.0000025014  normal  0.132712 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0087  S-adenosylmethionine synthetase  43.47 
 
 		 396 aa  331  1e-89  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.00000221578  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_03351  S-adenosylmethionine synthetase  44.17 
 
 		 413 aa  331  1e-89  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1352  S-adenosylmethionine synthetase  44.58 
 
 		 399 aa  330  2e-89  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3437  S-adenosylmethionine synthetase  44 
 
 		 399 aa  328  1.0000000000000001e-88  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.109386  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4838  S-adenosylmethionine synthetase  44.63 
 
 		 424 aa  326  3e-88  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  unclonable  0.00000220213  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1869  S-adenosylmethionine synthetase  44.19 
 
 		 408 aa  325  1e-87  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2330  methionine adenosyltransferase  42.57 
 
 		 396 aa  325  1e-87  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4914  S-adenosylmethionine synthetase  43.86 
 
 		 399 aa  323  2e-87  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.11754  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4877  S-adenosylmethionine synthetase  43.86 
 
 		 399 aa  323  2e-87  Bacillus cereus B4264  Bacteria  decreased coverage  0.000842328  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1179  Methionine adenosyltransferase  45.9 
 
 		 389 aa  323  3e-87  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4660  S-adenosylmethionine synthetase  43.86 
 
 		 399 aa  323  3e-87  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4500  S-adenosylmethionine synthetase  43.75 
 
 		 399 aa  323  3e-87  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4517  S-adenosylmethionine synthetase  43.86 
 
 		 399 aa  323  3e-87  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.536795  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5017  S-adenosylmethionine synthetase  43.86 
 
 		 399 aa  323  3e-87  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00446313  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4886  S-adenosylmethionine synthetase  43.86 
 
 		 399 aa  323  3e-87  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4904  S-adenosylmethionine synthetase  43.75 
 
 		 399 aa  323  3e-87  Bacillus cereus AH187  Bacteria  decreased coverage  0.0000363625  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0363  S-adenosylmethionine synthetase  43.61 
 
 		 399 aa  322  7e-87  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.0000052915  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2353  S-adenosylmethionine synthetase  41.63 
 
 		 405 aa  321  9.999999999999999e-87  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0466  S-adenosylmethionine synthetase  44.19 
 
 		 411 aa  322  9.999999999999999e-87  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1877  S-adenosylmethionine synthetase  41.65 
 
 		 398 aa  320  3e-86  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1841  S-adenosylmethionine synthetase  41.65 
 
 		 398 aa  320  3e-86  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0413  S-adenosylmethionine synthetase  43.81 
 
 		 390 aa  319  5e-86  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0737611  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1234  S-adenosylmethionine synthetase  42.21 
 
 		 396 aa  319  6e-86  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0170314  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4594  S-adenosylmethionine synthetase  43 
 
 		 399 aa  318  1e-85  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.791965  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2435  S-adenosylmethionine synthetase  44.47 
 
 		 391 aa  317  2e-85  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2145  S-adenosylmethionine synthetase  44.47 
 
 		 391 aa  317  2e-85  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0660  S-adenosylmethionine synthetase  43.39 
 
 		 402 aa  317  3e-85  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.000409512  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0831  S-adenosylmethionine synthetase  44.2 
 
 		 398 aa  316  4e-85  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1692  S-adenosylmethionine synthetase  43.67 
 
 		 397 aa  316  4e-85  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.753186  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1133  S-adenosylmethionine synthetase  41.56 
 
 		 395 aa  315  8e-85  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  unclonable  0.00000000111198  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1171  S-adenosylmethionine synthetase  41.56 
 
 		 395 aa  315  8e-85  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  decreased coverage  0.0000972386  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_453  S-adenosylmethionine synthetase  40.69 
 
 		 406 aa  314  9.999999999999999e-85  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00689475  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0512  S-adenosylmethionine synthetase  40.45 
 
 		 406 aa  314  1.9999999999999998e-84  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.128804  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0488  S-adenosylmethionine synthetase  40.69 
 
 		 406 aa  314  1.9999999999999998e-84  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.227197  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0470  S-adenosylmethionine synthetase  42.46 
 
 		 382 aa  312  6.999999999999999e-84  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03161  S-adenosylmethionine synthetase  43.58 
 
 		 381 aa  311  9e-84  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.713354  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1186  S-adenosylmethionine synthetase  41.44 
 
 		 414 aa  311  1e-83  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2894  S-adenosylmethionine synthetase  43.26 
 
 		 391 aa  311  2e-83  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2678  S-adenosylmethionine synthetase  44.94 
 
 		 403 aa  310  4e-83  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.257721  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2391  S-adenosylmethionine synthetase  41.37 
 
 		 390 aa  309  5e-83  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.855704  normal  0.120433 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1725  S-adenosylmethionine synthetase  42.29 
 
 		 402 aa  309  6.999999999999999e-83  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.710096  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4159  S-adenosylmethionine synthetase  43.42 
 
 		 397 aa  308  1.0000000000000001e-82  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0297831  normal  0.258747 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3124  S-adenosylmethionine synthetase  43.03 
 
 		 398 aa  306  3e-82  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.110006  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0489  S-adenosylmethionine synthetase  41.85 
 
 		 405 aa  306  3e-82  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2521  S-adenosylmethionine synthetase  42.07 
 
 		 388 aa  306  4.0000000000000004e-82  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.53813 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0160  S-adenosylmethionine synthetase  41.79 
 
 		 405 aa  306  6e-82  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.754463  normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1135  S-adenosylmethionine synthetase  42.12 
 
 		 397 aa  305  7e-82  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3549  S-adenosylmethionine synthetase  42.96 
 
 		 403 aa  305  8.000000000000001e-82  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.642541  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_15650  methionine adenosyltransferase  42.71 
 
 		 400 aa  305  1.0000000000000001e-81  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.148398  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0053  S-adenosylmethionine synthetase  41.94 
 
 		 393 aa  305  1.0000000000000001e-81  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0533  S-adenosylmethionine synthetase  40.3 
 
 		 393 aa  305  1.0000000000000001e-81  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000000146797  normal  0.123305 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2131  S-adenosylmethionine synthetase  41.94 
 
 		 393 aa  304  2.0000000000000002e-81  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.204435  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0879  S-adenosylmethionine synthetase  42.71 
 
 		 388 aa  303  3.0000000000000004e-81  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000307684  hitchhiker  0.000000742555 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1296  S-adenosylmethionine synthetase  41.09 
 
 		 395 aa  303  4.0000000000000003e-81  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0081249  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0929  S-adenosylmethionine synthetase  44.27 
 
 		 383 aa  303  5.000000000000001e-81  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4320  methionine adenosyltransferase  41.12 
 
 		 387 aa  303  5.000000000000001e-81  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.238534  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3565  S-adenosylmethionine synthetase  42.46 
 
 		 403 aa  303  5.000000000000001e-81  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.814506  normal  0.982729 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3331  S-adenosylmethionine synthetase  42.35 
 
 		 383 aa  302  5.000000000000001e-81  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.175486  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2004  S-adenosylmethionine synthetase  41.88 
 
 		 382 aa  302  6.000000000000001e-81  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5342  S-adenosylmethionine synthetase  42.75 
 
 		 399 aa  302  6.000000000000001e-81  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.339579  normal  0.683287 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0871  S-adenosylmethionine synthetase  43.37 
 
 		 383 aa  302  6.000000000000001e-81  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0646  S-adenosylmethionine synthetase  44.02 
 
 		 383 aa  301  1e-80  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00167645  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3541  S-adenosylmethionine synthetase  43.62 
 
 		 383 aa  300  2e-80  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>