56 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rcas_0879 on replicon NC_009767
Organism: Roseiflexus castenholzii DSM 13941



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009767  Rcas_0879  hypothetical protein  100 
 
 		 133 aa  266  5.9999999999999995e-71  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.374693  hitchhiker  0.0000252652 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0868  hypothetical protein  66.13 
 
 		 125 aa  167  4e-41  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0855  GTP-binding signal recognition particle  50.79 
 
 		 145 aa  134  6.0000000000000005e-31  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.471576  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1481  hypothetical protein  57.98 
 
 		 144 aa  132  9.999999999999999e-31  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1033  hypothetical protein  50 
 
 		 149 aa  132  9.999999999999999e-31  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2551  hypothetical protein  49.58 
 
 		 133 aa  130  5e-30  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.311981  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1610  hypothetical protein  50.79 
 
 		 151 aa  129  1.0000000000000001e-29  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  hitchhiker  0.00644955  normal  0.0278049 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1195  hypothetical protein  49.21 
 
 		 145 aa  129  2.0000000000000002e-29  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.350794  normal  0.0471945 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0072  hypothetical protein  47.54 
 
 		 134 aa  126  8.000000000000001e-29  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.391845  normal  0.0725128 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2464  hypothetical protein  45.97 
 
 		 135 aa  118  1.9999999999999998e-26  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2929  hypothetical protein  44.26 
 
 		 127 aa  114  3.9999999999999997e-25  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.20874  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2540  GTP-binding signal recognition particle SRP54, G-domain  42.28 
 
 		 137 aa  104  4e-22  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1210  hypothetical protein  39.52 
 
 		 140 aa  100  6e-21  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.0426652 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0976  hypothetical protein  46.43 
 
 		 130 aa  95.5  2e-19  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.216139  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1141  hypothetical protein  44.17 
 
 		 133 aa  92.4  2e-18  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.63559  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0465  hypothetical protein  44.04 
 
 		 125 aa  90.1  1e-17  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4353  hypothetical protein  48.04 
 
 		 127 aa  85.5  2e-16  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1849  hypothetical protein  37.7 
 
 		 123 aa  85.1  3e-16  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1694  hypothetical protein  41.44 
 
 		 122 aa  85.1  3e-16  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1051  hypothetical protein  43.8 
 
 		 126 aa  82.8  0.000000000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3030  hypothetical protein  38.46 
 
 		 140 aa  83.2  0.000000000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4808  hypothetical protein  43.64 
 
 		 132 aa  82  0.000000000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.754824 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0411  hypothetical protein  61.54 
 
 		 80 aa  82.4  0.000000000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0238  hypothetical protein  41.86 
 
 		 129 aa  81.6  0.000000000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.973581  normal  0.0299279 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0701  hypothetical protein  41.88 
 
 		 137 aa  82  0.000000000000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.580234  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3252  hypothetical protein  42.73 
 
 		 147 aa  80.9  0.000000000000006  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00216047  hitchhiker  3.08199e-16 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1333  hypothetical protein  45 
 
 		 128 aa  80.1  0.000000000000009  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.879036  normal  0.042363 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0902  hypothetical protein  41.07 
 
 		 129 aa  78.6  0.00000000000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.0000090715  hitchhiker  0.00000319035 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1634  hypothetical protein  35.92 
 
 		 125 aa  77.8  0.00000000000005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.541924  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2581  hypothetical protein  37.17 
 
 		 125 aa  77.4  0.00000000000006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0149  hypothetical protein  39.47 
 
 		 123 aa  77.4  0.00000000000006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1435  hypothetical protein  40.87 
 
 		 130 aa  76.6  0.0000000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2876  hypothetical protein  37.62 
 
 		 127 aa  73.6  0.0000000000008  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.585701  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2386  hypothetical protein  34.31 
 
 		 130 aa  73.2  0.000000000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2927  hypothetical protein  39.32 
 
 		 148 aa  73.2  0.000000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.435469  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1499  hypothetical protein  41.94 
 
 		 112 aa  73.2  0.000000000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00140337  hitchhiker  0.0000264658 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0081  hypothetical protein  34.21 
 
 		 137 aa  72  0.000000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1242  hypothetical protein  33.04 
 
 		 135 aa  72.4  0.000000000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4372  hypothetical protein  36.27 
 
 		 125 aa  70.9  0.000000000006  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000174807 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2108  hypothetical protein  35.92 
 
 		 128 aa  70.9  0.000000000006  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1568  hypothetical protein  36.21 
 
 		 124 aa  70.1  0.000000000008  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.214101  normal  0.171245 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0167  hypothetical protein  36.27 
 
 		 113 aa  68.6  0.00000000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.205181  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4311  hypothetical protein  35.29 
 
 		 125 aa  68.6  0.00000000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2568  hypothetical protein  37.72 
 
 		 136 aa  67.8  0.00000000004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.995822 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2357  hypothetical protein  36.21 
 
 		 134 aa  68.2  0.00000000004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0657686  normal  0.192695 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1375  hypothetical protein  38.78 
 
 		 125 aa  67.8  0.00000000005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0574  hypothetical protein  46 
 
 		 130 aa  67  0.00000000009  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.476606  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6543  hypothetical protein  39.81 
 
 		 114 aa  66.6  0.0000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1246  hypothetical protein  38.24 
 
 		 130 aa  66.6  0.0000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3619  hypothetical protein  37.38 
 
 		 125 aa  62.8  0.000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.737608 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0943  hypothetical protein  28.03 
 
 		 134 aa  62.8  0.000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1620  hypothetical protein  35.29 
 
 		 133 aa  61.2  0.000000004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0805096  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0134  hypothetical protein  30.83 
 
 		 166 aa  54.3  0.0000005  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.14952  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0410  hypothetical protein  70.59 
 
 		 39 aa  53.9  0.0000007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3086  hypothetical protein  50 
 
 		 53 aa  48.1  0.00004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3085  hypothetical protein  51.28 
 
 		 48 aa  46.2  0.0002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>