36 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Haur_3085 on replicon NC_009972
Organism: Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009972  Haur_3085  hypothetical protein  100 
 
 
48 aa  96.3  1e-19  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0868  hypothetical protein  57.45 
 
 
125 aa  59.7  0.00000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1634  hypothetical protein  54.55 
 
 
125 aa  55.8  0.0000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.541924  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2581  hypothetical protein  53.33 
 
 
125 aa  55.5  0.0000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0411  hypothetical protein  51.06 
 
 
80 aa  53.1  0.000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1333  hypothetical protein  50 
 
 
128 aa  52  0.000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.879036  normal  0.042363 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0081  hypothetical protein  43.75 
 
 
137 aa  49.7  0.00001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2108  hypothetical protein  45.45 
 
 
128 aa  48.9  0.00002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4372  hypothetical protein  43.75 
 
 
125 aa  48.5  0.00003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000174807 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3252  hypothetical protein  52.08 
 
 
147 aa  48.5  0.00003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00216047  hitchhiker  3.08199e-16 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0167  hypothetical protein  54.55 
 
 
113 aa  48.9  0.00003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.205181  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2568  hypothetical protein  41.67 
 
 
136 aa  47.8  0.00005  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.995822 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1210  hypothetical protein  43.48 
 
 
140 aa  47  0.00008  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal  0.0426652 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0149  hypothetical protein  50 
 
 
123 aa  47  0.00008  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1481  hypothetical protein  48.94 
 
 
144 aa  47  0.00008  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4353  hypothetical protein  47.92 
 
 
127 aa  47.4  0.00008  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1375  hypothetical protein  51.22 
 
 
125 aa  46.6  0.0001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0943  hypothetical protein  50 
 
 
134 aa  46.2  0.0001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2876  hypothetical protein  60 
 
 
127 aa  45.8  0.0002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.585701  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4311  hypothetical protein  41.67 
 
 
125 aa  45.8  0.0002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2357  hypothetical protein  52.78 
 
 
134 aa  46.2  0.0002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0657686  normal  0.192695 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0879  hypothetical protein  51.28 
 
 
133 aa  46.2  0.0002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.374693  hitchhiker  0.0000252652 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1242  hypothetical protein  48.84 
 
 
135 aa  44.7  0.0004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2929  hypothetical protein  40 
 
 
127 aa  44.3  0.0005  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.20874  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1051  hypothetical protein  40.82 
 
 
126 aa  44.3  0.0006  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1849  hypothetical protein  39.13 
 
 
123 aa  43.5  0.001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1568  hypothetical protein  47.73 
 
 
124 aa  42.7  0.002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.214101  normal  0.171245 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0976  hypothetical protein  43.75 
 
 
130 aa  42.4  0.002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.216139  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4808  hypothetical protein  39.58 
 
 
132 aa  42.7  0.002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.754824 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2551  hypothetical protein  40 
 
 
133 aa  42.4  0.002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.311981  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3619  hypothetical protein  51.43 
 
 
125 aa  42.7  0.002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.737608 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0855  GTP-binding signal recognition particle  45.65 
 
 
145 aa  42.7  0.002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.471576  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0701  hypothetical protein  48.57 
 
 
137 aa  42.4  0.002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.580234  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1246  hypothetical protein  37.5 
 
 
130 aa  41.6  0.004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6543  hypothetical protein  46.15 
 
 
114 aa  40.8  0.006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0902  hypothetical protein  45.83 
 
 
129 aa  40.8  0.007  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.0000090715  hitchhiker  0.00000319035 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>