55 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbem_1634 on replicon NC_011146
Organism: Geobacter bemidjiensis Bem



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011146  Gbem_1634  hypothetical protein  100 
 
 		 125 aa  249  9.000000000000001e-66  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.541924  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2581  hypothetical protein  95.2 
 
 		 125 aa  239  7e-63  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2108  hypothetical protein  66.4 
 
 		 128 aa  176  1e-43  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4372  hypothetical protein  59.2 
 
 		 125 aa  159  1e-38  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000174807 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4311  hypothetical protein  58.4 
 
 		 125 aa  156  7e-38  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2386  hypothetical protein  56 
 
 		 130 aa  141  2e-33  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1375  hypothetical protein  48.8 
 
 		 125 aa  132  9.999999999999999e-31  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3619  hypothetical protein  51.2 
 
 		 125 aa  131  3e-30  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.737608 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4353  hypothetical protein  50.42 
 
 		 127 aa  127  4.0000000000000003e-29  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1333  hypothetical protein  44.35 
 
 		 128 aa  125  1.0000000000000001e-28  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.879036  normal  0.042363 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3252  hypothetical protein  49.17 
 
 		 147 aa  124  6e-28  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00216047  hitchhiker  3.08199e-16 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2876  hypothetical protein  50.4 
 
 		 127 aa  123  9e-28  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.585701  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0149  hypothetical protein  50.82 
 
 		 123 aa  121  3e-27  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1242  hypothetical protein  48.7 
 
 		 135 aa  119  1.9999999999999998e-26  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1499  hypothetical protein  53.92 
 
 		 112 aa  118  3e-26  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00140337  hitchhiker  0.0000264658 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1246  hypothetical protein  47.5 
 
 		 130 aa  115  3e-25  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0167  hypothetical protein  50 
 
 		 113 aa  108  2.0000000000000002e-23  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.205181  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1051  hypothetical protein  46.83 
 
 		 126 aa  107  6e-23  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2357  hypothetical protein  44.25 
 
 		 134 aa  105  1e-22  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0657686  normal  0.192695 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0943  hypothetical protein  43.31 
 
 		 134 aa  99  2e-20  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1620  hypothetical protein  43.36 
 
 		 133 aa  91.7  3e-18  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0805096  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0902  hypothetical protein  45.45 
 
 		 129 aa  91.3  4e-18  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.0000090715  hitchhiker  0.00000319035 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2551  hypothetical protein  40.71 
 
 		 133 aa  90.1  8e-18  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.311981  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0868  hypothetical protein  40.78 
 
 		 125 aa  88.6  2e-17  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0081  hypothetical protein  39.34 
 
 		 137 aa  88.2  3e-17  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2929  hypothetical protein  39.6 
 
 		 127 aa  87.8  4e-17  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.20874  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1481  hypothetical protein  40.59 
 
 		 144 aa  87.4  5e-17  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0238  hypothetical protein  41.82 
 
 		 129 aa  85.1  3e-16  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.973581  normal  0.0299279 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2927  hypothetical protein  38.39 
 
 		 148 aa  84.7  3e-16  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.435469  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2464  hypothetical protein  37.5 
 
 		 135 aa  80.9  0.000000000000006  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3030  hypothetical protein  39.62 
 
 		 140 aa  79.7  0.00000000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1141  hypothetical protein  39.09 
 
 		 133 aa  79.3  0.00000000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.63559  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1033  hypothetical protein  34.31 
 
 		 149 aa  78.6  0.00000000000003  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0855  GTP-binding signal recognition particle  37.25 
 
 		 145 aa  78.2  0.00000000000004  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.471576  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0879  hypothetical protein  35.92 
 
 		 133 aa  77.8  0.00000000000005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.374693  hitchhiker  0.0000252652 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1694  hypothetical protein  35.45 
 
 		 122 aa  77.8  0.00000000000005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0574  hypothetical protein  41.32 
 
 		 130 aa  77  0.00000000000007  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.476606  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1610  hypothetical protein  37.25 
 
 		 151 aa  76.6  0.00000000000009  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  hitchhiker  0.00644955  normal  0.0278049 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0701  hypothetical protein  35.45 
 
 		 137 aa  75.9  0.0000000000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.580234  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0976  hypothetical protein  35.04 
 
 		 130 aa  75.5  0.0000000000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.216139  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4808  hypothetical protein  35.19 
 
 		 132 aa  75.1  0.0000000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.754824 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0465  hypothetical protein  36.94 
 
 		 125 aa  73.9  0.0000000000006  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1435  hypothetical protein  35.14 
 
 		 130 aa  73.9  0.0000000000007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1210  hypothetical protein  37.62 
 
 		 140 aa  72.4  0.000000000002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.0426652 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0072  hypothetical protein  34.65 
 
 		 134 aa  71.6  0.000000000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.391845  normal  0.0725128 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1195  hypothetical protein  33.33 
 
 		 145 aa  71.6  0.000000000003  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.350794  normal  0.0471945 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1568  hypothetical protein  37.9 
 
 		 124 aa  70.5  0.000000000007  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.214101  normal  0.171245 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2568  hypothetical protein  36.11 
 
 		 136 aa  69.7  0.00000000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.995822 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1849  hypothetical protein  32.08 
 
 		 123 aa  68.6  0.00000000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2540  GTP-binding signal recognition particle SRP54, G-domain  35.35 
 
 		 137 aa  67  0.00000000008  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6543  hypothetical protein  36.84 
 
 		 114 aa  62.8  0.000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3085  hypothetical protein  54.55 
 
 		 48 aa  55.8  0.0000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0411  hypothetical protein  34.33 
 
 		 80 aa  44.7  0.0004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0134  hypothetical protein  28.81 
 
 		 166 aa  41.2  0.004  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.14952  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3086  hypothetical protein  39.53 
 
 		 53 aa  41.2  0.005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>