44 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SYO3AOP1_0134 on replicon NC_010730
Organism: Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010730  SYO3AOP1_0134  hypothetical protein  100 
 
 		 166 aa  322  2e-87  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.14952  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0465  hypothetical protein  32.2 
 
 		 125 aa  58.5  0.00000004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1195  hypothetical protein  31.62 
 
 		 145 aa  58.2  0.00000006  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.350794  normal  0.0471945 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1568  hypothetical protein  31.91 
 
 		 124 aa  57  0.0000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.214101  normal  0.171245 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1610  hypothetical protein  31.62 
 
 		 151 aa  57  0.0000001  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  hitchhiker  0.00644955  normal  0.0278049 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1435  hypothetical protein  30.65 
 
 		 130 aa  55.5  0.0000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0976  hypothetical protein  25.98 
 
 		 130 aa  55.5  0.0000003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.216139  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0855  GTP-binding signal recognition particle  30.88 
 
 		 145 aa  55.1  0.0000004  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.471576  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0238  hypothetical protein  31.06 
 
 		 129 aa  54.7  0.0000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.973581  normal  0.0299279 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3252  hypothetical protein  31.62 
 
 		 147 aa  54.7  0.0000006  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00216047  hitchhiker  3.08199e-16 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0879  hypothetical protein  30.83 
 
 		 133 aa  54.3  0.0000007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.374693  hitchhiker  0.0000252652 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0902  hypothetical protein  30.51 
 
 		 129 aa  53.9  0.000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.0000090715  hitchhiker  0.00000319035 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0081  hypothetical protein  31.93 
 
 		 137 aa  53.5  0.000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1694  hypothetical protein  28.57 
 
 		 122 aa  53.9  0.000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1481  hypothetical protein  30.33 
 
 		 144 aa  52.8  0.000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4372  hypothetical protein  32.26 
 
 		 125 aa  53.1  0.000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000174807 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2108  hypothetical protein  31.45 
 
 		 128 aa  52.8  0.000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1333  hypothetical protein  30.77 
 
 		 128 aa  52  0.000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.879036  normal  0.042363 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2551  hypothetical protein  32.43 
 
 		 133 aa  52.4  0.000003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.311981  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0868  hypothetical protein  32.84 
 
 		 125 aa  52  0.000004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1141  hypothetical protein  27.82 
 
 		 133 aa  51.6  0.000004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.63559  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2464  hypothetical protein  29.32 
 
 		 135 aa  51.6  0.000005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4311  hypothetical protein  31.45 
 
 		 125 aa  50.4  0.00001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0701  hypothetical protein  28.77 
 
 		 137 aa  50.4  0.00001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.580234  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1033  hypothetical protein  30.91 
 
 		 149 aa  49.7  0.00002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4353  hypothetical protein  29.71 
 
 		 127 aa  49.7  0.00002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1242  hypothetical protein  24.06 
 
 		 135 aa  48.1  0.00005  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6543  hypothetical protein  28.21 
 
 		 114 aa  47.4  0.00008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1246  hypothetical protein  32.28 
 
 		 130 aa  47.4  0.00009  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2540  GTP-binding signal recognition particle SRP54, G-domain  28.47 
 
 		 137 aa  47  0.0001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1375  hypothetical protein  29.84 
 
 		 125 aa  46.6  0.0002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0072  hypothetical protein  26.36 
 
 		 134 aa  45.1  0.0004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.391845  normal  0.0725128 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2927  hypothetical protein  28.33 
 
 		 148 aa  45.1  0.0005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.435469  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1210  hypothetical protein  28.83 
 
 		 140 aa  43.5  0.001  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.0426652 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1499  hypothetical protein  32.32 
 
 		 112 aa  43.9  0.001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00140337  hitchhiker  0.0000264658 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2929  hypothetical protein  27.43 
 
 		 127 aa  43.9  0.001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.20874  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0411  hypothetical protein  38.46 
 
 		 80 aa  42.7  0.002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2876  hypothetical protein  26.27 
 
 		 127 aa  43.1  0.002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.585701  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0149  hypothetical protein  30.16 
 
 		 123 aa  42.4  0.003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1634  hypothetical protein  28.81 
 
 		 125 aa  41.2  0.006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.541924  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2386  hypothetical protein  26.61 
 
 		 130 aa  40.8  0.008  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4808  hypothetical protein  24.62 
 
 		 132 aa  40.8  0.009  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.754824 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3030  hypothetical protein  25.81 
 
 		 140 aa  40.8  0.009  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0943  hypothetical protein  27.35 
 
 		 134 aa  40.8  0.009  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>