53 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RoseRS_0238 on replicon NC_009523
Organism: Roseiflexus sp. RS-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009523  RoseRS_0238  hypothetical protein  100 
 
 		 129 aa  259  6.999999999999999e-69  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.973581  normal  0.0299279 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0902  hypothetical protein  73.6 
 
 		 129 aa  197  5e-50  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.0000090715  hitchhiker  0.00000319035 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3030  hypothetical protein  60.8 
 
 		 140 aa  155  2e-37  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2927  hypothetical protein  57.98 
 
 		 148 aa  144  3e-34  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.435469  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1435  hypothetical protein  53.28 
 
 		 130 aa  127  6e-29  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1694  hypothetical protein  53.85 
 
 		 122 aa  122  2e-27  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0976  hypothetical protein  49.57 
 
 		 130 aa  113  1.0000000000000001e-24  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.216139  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0465  hypothetical protein  43.97 
 
 		 125 aa  103  6e-22  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1141  hypothetical protein  48.72 
 
 		 133 aa  103  8e-22  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.63559  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4353  hypothetical protein  54.81 
 
 		 127 aa  100  7e-21  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2108  hypothetical protein  45.05 
 
 		 128 aa  92.8  1e-18  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1568  hypothetical protein  45.37 
 
 		 124 aa  91.3  4e-18  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.214101  normal  0.171245 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1481  hypothetical protein  47.9 
 
 		 144 aa  91.3  4e-18  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4372  hypothetical protein  44.95 
 
 		 125 aa  91.3  4e-18  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000174807 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1195  hypothetical protein  38.89 
 
 		 145 aa  89.7  1e-17  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.350794  normal  0.0471945 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0855  GTP-binding signal recognition particle  40.48 
 
 		 145 aa  89.7  1e-17  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.471576  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4311  hypothetical protein  43.64 
 
 		 125 aa  89.4  2e-17  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3252  hypothetical protein  45.54 
 
 		 147 aa  88.6  3e-17  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00216047  hitchhiker  3.08199e-16 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1033  hypothetical protein  40.98 
 
 		 149 aa  88.6  3e-17  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2581  hypothetical protein  41.82 
 
 		 125 aa  87.8  4e-17  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1610  hypothetical protein  40.48 
 
 		 151 aa  87.8  5e-17  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  hitchhiker  0.00644955  normal  0.0278049 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0701  hypothetical protein  35.59 
 
 		 137 aa  86.7  1e-16  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.580234  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2386  hypothetical protein  44.55 
 
 		 130 aa  86.3  1e-16  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2540  GTP-binding signal recognition particle SRP54, G-domain  45.37 
 
 		 137 aa  85.5  2e-16  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1634  hypothetical protein  41.82 
 
 		 125 aa  85.1  3e-16  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.541924  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2464  hypothetical protein  39.34 
 
 		 135 aa  84.3  6e-16  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0868  hypothetical protein  42.5 
 
 		 125 aa  83.2  0.000000000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3619  hypothetical protein  44.95 
 
 		 125 aa  82.4  0.000000000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.737608 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2551  hypothetical protein  42.99 
 
 		 133 aa  82  0.000000000000003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.311981  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0879  hypothetical protein  41.86 
 
 		 133 aa  81.6  0.000000000000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.374693  hitchhiker  0.0000252652 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0943  hypothetical protein  44.34 
 
 		 134 aa  81.6  0.000000000000004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2568  hypothetical protein  34.19 
 
 		 136 aa  80.5  0.000000000000007  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.995822 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1246  hypothetical protein  41.51 
 
 		 130 aa  77  0.00000000000009  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1375  hypothetical protein  42.34 
 
 		 125 aa  76.6  0.00000000000009  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4808  hypothetical protein  33.33 
 
 		 132 aa  76.3  0.0000000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.754824 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0167  hypothetical protein  44.66 
 
 		 113 aa  76.6  0.0000000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.205181  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0149  hypothetical protein  43.4 
 
 		 123 aa  75.1  0.0000000000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2929  hypothetical protein  38.94 
 
 		 127 aa  75.1  0.0000000000003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.20874  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2876  hypothetical protein  34.68 
 
 		 127 aa  73.9  0.0000000000006  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.585701  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1333  hypothetical protein  39.81 
 
 		 128 aa  72.8  0.000000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.879036  normal  0.042363 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0072  hypothetical protein  32.81 
 
 		 134 aa  72.8  0.000000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.391845  normal  0.0725128 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1499  hypothetical protein  43.43 
 
 		 112 aa  72.4  0.000000000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00140337  hitchhiker  0.0000264658 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2357  hypothetical protein  35.85 
 
 		 134 aa  71.6  0.000000000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0657686  normal  0.192695 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1242  hypothetical protein  38.68 
 
 		 135 aa  71.2  0.000000000005  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1051  hypothetical protein  37.5 
 
 		 126 aa  67.4  0.00000000006  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1210  hypothetical protein  32.5 
 
 		 140 aa  67.4  0.00000000007  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.0426652 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0081  hypothetical protein  34.26 
 
 		 137 aa  65.9  0.0000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6543  hypothetical protein  35.78 
 
 		 114 aa  64.7  0.0000000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1620  hypothetical protein  37.86 
 
 		 133 aa  63.9  0.0000000008  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0805096  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1849  hypothetical protein  31.96 
 
 		 123 aa  57.8  0.00000004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0134  hypothetical protein  31.06 
 
 		 166 aa  54.7  0.0000004  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.14952  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3086  hypothetical protein  46.51 
 
 		 53 aa  46.6  0.0001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0574  hypothetical protein  34.82 
 
 		 130 aa  46.2  0.0002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.476606  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>