53 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Vapar_0574 on replicon NC_012791
Organism: Variovorax paradoxus S110



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012791  Vapar_0574  hypothetical protein  100 
 
 		 130 aa  256  5.0000000000000005e-68  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.476606  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2876  hypothetical protein  45.24 
 
 		 127 aa  107  7.000000000000001e-23  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.585701  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4353  hypothetical protein  46.03 
 
 		 127 aa  101  4e-21  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2581  hypothetical protein  42.15 
 
 		 125 aa  94  6e-19  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1634  hypothetical protein  41.32 
 
 		 125 aa  93.2  1e-18  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.541924  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3619  hypothetical protein  41.32 
 
 		 125 aa  92.4  2e-18  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.737608 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1242  hypothetical protein  41.38 
 
 		 135 aa  92.4  2e-18  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0149  hypothetical protein  45.61 
 
 		 123 aa  91.3  4e-18  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0072  hypothetical protein  41.96 
 
 		 134 aa  90.9  5e-18  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.391845  normal  0.0725128 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4372  hypothetical protein  38.02 
 
 		 125 aa  89.7  1e-17  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000174807 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1246  hypothetical protein  41.54 
 
 		 130 aa  90.1  1e-17  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1333  hypothetical protein  45.95 
 
 		 128 aa  89.4  2e-17  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.879036  normal  0.042363 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0976  hypothetical protein  47.41 
 
 		 130 aa  87.8  4e-17  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.216139  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4808  hypothetical protein  43.1 
 
 		 132 aa  88.2  4e-17  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.754824 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4311  hypothetical protein  37.19 
 
 		 125 aa  87.8  5e-17  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3252  hypothetical protein  39.67 
 
 		 147 aa  87  7e-17  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00216047  hitchhiker  3.08199e-16 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0081  hypothetical protein  33.63 
 
 		 137 aa  87  8e-17  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1375  hypothetical protein  41.32 
 
 		 125 aa  85.9  2e-16  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2929  hypothetical protein  39.66 
 
 		 127 aa  85.1  3e-16  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.20874  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0701  hypothetical protein  42.06 
 
 		 137 aa  84.7  3e-16  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.580234  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2551  hypothetical protein  40 
 
 		 133 aa  84  7e-16  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.311981  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0879  hypothetical protein  46 
 
 		 133 aa  82.8  0.000000000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.374693  hitchhiker  0.0000252652 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1051  hypothetical protein  43.09 
 
 		 126 aa  83.2  0.000000000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2108  hypothetical protein  38.02 
 
 		 128 aa  82  0.000000000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2568  hypothetical protein  39.29 
 
 		 136 aa  82  0.000000000000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.995822 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2386  hypothetical protein  37.19 
 
 		 130 aa  80.1  0.000000000000008  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1481  hypothetical protein  41.75 
 
 		 144 aa  79.7  0.00000000000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0868  hypothetical protein  43.56 
 
 		 125 aa  79.7  0.00000000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0167  hypothetical protein  41.9 
 
 		 113 aa  78.6  0.00000000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.205181  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2464  hypothetical protein  40.52 
 
 		 135 aa  78.6  0.00000000000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1210  hypothetical protein  39.67 
 
 		 140 aa  77.8  0.00000000000005  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.0426652 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0855  GTP-binding signal recognition particle  40.95 
 
 		 145 aa  75.5  0.0000000000002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.471576  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2540  GTP-binding signal recognition particle SRP54, G-domain  36.54 
 
 		 137 aa  73.6  0.0000000000009  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1620  hypothetical protein  38.79 
 
 		 133 aa  73.2  0.000000000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0805096  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1141  hypothetical protein  39.81 
 
 		 133 aa  72.8  0.000000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.63559  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1610  hypothetical protein  40 
 
 		 151 aa  72  0.000000000003  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  hitchhiker  0.00644955  normal  0.0278049 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1499  hypothetical protein  40 
 
 		 112 aa  70.9  0.000000000006  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00140337  hitchhiker  0.0000264658 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1033  hypothetical protein  37.25 
 
 		 149 aa  70.9  0.000000000006  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1195  hypothetical protein  37.96 
 
 		 145 aa  70.5  0.000000000008  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.350794  normal  0.0471945 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1694  hypothetical protein  34.26 
 
 		 122 aa  67.8  0.00000000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1849  hypothetical protein  34.95 
 
 		 123 aa  67.8  0.00000000005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2357  hypothetical protein  32.48 
 
 		 134 aa  66.2  0.0000000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0657686  normal  0.192695 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1568  hypothetical protein  38.53 
 
 		 124 aa  65.5  0.0000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.214101  normal  0.171245 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0943  hypothetical protein  31.36 
 
 		 134 aa  65.9  0.0000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3030  hypothetical protein  36.07 
 
 		 140 aa  65.1  0.0000000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0465  hypothetical protein  36.11 
 
 		 125 aa  63.5  0.0000000008  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2927  hypothetical protein  37.61 
 
 		 148 aa  63.5  0.0000000009  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.435469  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0902  hypothetical protein  38.46 
 
 		 129 aa  62.8  0.000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.0000090715  hitchhiker  0.00000319035 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0238  hypothetical protein  34.82 
 
 		 129 aa  60.8  0.000000006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.973581  normal  0.0299279 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1435  hypothetical protein  35.24 
 
 		 130 aa  60.8  0.000000006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6543  hypothetical protein  40 
 
 		 114 aa  60.5  0.000000008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0411  hypothetical protein  47.06 
 
 		 80 aa  48.9  0.00002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3086  hypothetical protein  48.78 
 
 		 53 aa  40.4  0.009  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>