42 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Haur_0411 on replicon NC_009972
Organism: Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009972  Haur_0411  hypothetical protein  100 
 
 
80 aa  153  7e-37  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0879  hypothetical protein  61.54 
 
 
133 aa  82.4  0.000000000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.374693  hitchhiker  0.0000252652 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0868  hypothetical protein  60 
 
 
125 aa  81.3  0.000000000000004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2551  hypothetical protein  50.79 
 
 
133 aa  65.5  0.0000000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.311981  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0072  hypothetical protein  43.75 
 
 
134 aa  63.2  0.000000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.391845  normal  0.0725128 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2876  hypothetical protein  40.3 
 
 
127 aa  58.9  0.00000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.585701  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2929  hypothetical protein  48.21 
 
 
127 aa  58.5  0.00000003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.20874  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2464  hypothetical protein  46.03 
 
 
135 aa  57  0.00000008  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0855  GTP-binding signal recognition particle  48.21 
 
 
145 aa  55.8  0.0000002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.471576  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1033  hypothetical protein  42.62 
 
 
149 aa  53.5  0.0000009  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0081  hypothetical protein  38.75 
 
 
137 aa  53.5  0.0000009  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4808  hypothetical protein  44.68 
 
 
132 aa  53.1  0.000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.754824 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3085  hypothetical protein  51.06 
 
 
48 aa  53.1  0.000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1610  hypothetical protein  48.21 
 
 
151 aa  52.4  0.000002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  hitchhiker  0.00644955  normal  0.0278049 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1195  hypothetical protein  44.64 
 
 
145 aa  52  0.000003  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.350794  normal  0.0471945 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1051  hypothetical protein  45.16 
 
 
126 aa  51.2  0.000005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2357  hypothetical protein  38.81 
 
 
134 aa  50.8  0.000006  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0657686  normal  0.192695 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0976  hypothetical protein  47.06 
 
 
130 aa  50.8  0.000007  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.216139  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1849  hypothetical protein  32.88 
 
 
123 aa  50.4  0.000008  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4353  hypothetical protein  50 
 
 
127 aa  50.4  0.000008  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3252  hypothetical protein  37.31 
 
 
147 aa  49.3  0.00002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00216047  hitchhiker  3.08199e-16 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1481  hypothetical protein  44.64 
 
 
144 aa  49.7  0.00002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2540  GTP-binding signal recognition particle SRP54, G-domain  41.07 
 
 
137 aa  49.3  0.00002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2568  hypothetical protein  35.19 
 
 
136 aa  48.5  0.00003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.995822 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2581  hypothetical protein  37.31 
 
 
125 aa  48.5  0.00003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1210  hypothetical protein  39.66 
 
 
140 aa  48.5  0.00003  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal  0.0426652 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1694  hypothetical protein  46.94 
 
 
122 aa  47.4  0.00007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3030  hypothetical protein  46 
 
 
140 aa  47  0.00008  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1499  hypothetical protein  51.06 
 
 
112 aa  46.6  0.0001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00140337  hitchhiker  0.0000264658 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0465  hypothetical protein  41.18 
 
 
125 aa  46.6  0.0001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0701  hypothetical protein  36.54 
 
 
137 aa  45.8  0.0002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.580234  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1333  hypothetical protein  41.18 
 
 
128 aa  45.8  0.0002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.879036  normal  0.042363 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2386  hypothetical protein  35.29 
 
 
130 aa  45.8  0.0002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1634  hypothetical protein  34.33 
 
 
125 aa  44.7  0.0004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.541924  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6543  hypothetical protein  46.51 
 
 
114 aa  44.7  0.0004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0149  hypothetical protein  39.58 
 
 
123 aa  43.9  0.0006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1435  hypothetical protein  39.13 
 
 
130 aa  43.5  0.0009  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3619  hypothetical protein  32.84 
 
 
125 aa  43.5  0.001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.737608 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0167  hypothetical protein  38.3 
 
 
113 aa  42.4  0.002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.205181  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1246  hypothetical protein  43.75 
 
 
130 aa  42.4  0.002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0134  hypothetical protein  38.46 
 
 
166 aa  42.7  0.002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.14952  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1141  hypothetical protein  31.03 
 
 
133 aa  41.2  0.005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.63559  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>